揭示了m6ARNA修饰的新的进化意义
无义介导的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式，细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子（Premature Termination Codon, PTC）从而决定是否降解该RNA。因此经典的NMD通路是一种RNA剪接依赖的机制。假基因是一种失去了蛋白编码能力或者表达能力的基因，通常由基因重复产生，基因组上的DNA重复可以形成非加工型假基因，而逆转录形成的基因重复会形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白产生细胞毒性，因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC，因此大量的非加工型假基因可以通过NMD的方式降解。然而，加工型假基因由于缺少内含子而不能通过NMD的机制降解，那么加工型的假基因是否进化出其他的方式来进行降解并不清楚。 近日，中山大学王金凯教授课题组在Genome Bi......阅读全文
RNA降解
新鲜细胞：如果试剂没有问题，且外源性污染也可以排除，那么降解几乎都来自裂解液的用量不足。如 果将裂解液直接加入培养皿中裂解细胞，一定要使裂解液能覆盖住细胞。 2. 新鲜组织：某些富含内源核酸酶的样品(如肝脏，胸腺等)，即使使用电动匀浆器匀浆也不能避免RNA的降解。更可靠的方法是：在液氮条件下将组织
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞： 裂解液的量不足，使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织： 某些含有内源性核酸酶的样品，很难避免RNA酶的降解，建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎，并且，匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品： 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放，然后转移到-70℃冰箱存
信使RNA的降解
同一细胞内的不同mRNA具有不同的寿命（稳定性）。在细菌细胞中，单个mRNA可以存活数秒至超过一小时，但平均寿命为1至3分钟，因此，细菌mRNA的稳定性远低于真核mRNA。哺乳动物细胞mRNA的寿命从几分钟到几天不等。mRNA的稳定性越高，从该mRNA产生的蛋白质越多。 mRNA的有限寿命使细胞能够
Nature揭秘RNA降解机制
就好像我们利用碎纸机来销毁不再有用或包含有潜在破坏性信息的文件一样，细胞利用一些分子机器来降解不必要或有缺陷的大分子。来自马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的科学家们，现在揭示出了细胞核区室利用一种特异的RNA外来体（exosome）的机制——这一大分子机器负责了核糖核酸(RNAs)的降解和
m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RNA在
Cell新文章解析RNA降解机制
如同我们利用碎纸机来销毁不再有用或是包含潜在破坏性信息的文件一样，细胞利用分子机器来降解不需要或有缺陷的大分子。来自马克思普朗克生物化学研究所的科学家们现在解码了在降解核糖核酸(RNA)过程中起至关重要作用的一个蛋白质复合物(Ski复合物)的结构。这项研究发表在8月15日的《细胞》(Cell)杂
避免RNA降解的方法有哪些？
(1)在用来验证完整性之前先在变性胶上分析RNA。(2)运用良好无污染的技术分离RNA(3)将组织提取后立刻提取RNA，并将提取好的RNA反转录为cDNA进行低温保存。
RNA 和 DNA 提取的降解问题
降解问题是RNA制备中常常到的问题。因为在 RNA 提取过程中,样品储存不当或裂解效率低等情况都会导致降解。对于 DNA 提取,降解不是一个大问题,因为对于 PCR,DNA 可以被剪切并且工作正常,如果不希望有较多剪切的 DNA,可以使用弱裂解的方法。
揭示RNA m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地，其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原，难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点，提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
m6A“RNA甲基化”研究汇总—病毒篇
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星，也是国自然申请的大热点；究其原因，是因为最近一两年，RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展，病毒感染，神经发育，干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天，我们承接上一期的癌症篇，为您带来病毒领域的RNA甲基化研究