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揭示了m6ARNA修饰的新的进化意义

无义介导的RNA降解(Nonsense-mediated decay, NMD)是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式,细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子(Premature Termination Codon, PTC)从而决定是否降解该RNA。因此经典的NMD通路是一种RNA剪接依赖的机制。假基因是一种失去了蛋白编码能力或者表达能力的基因,通常由基因重复产生,基因组上的DNA重复可以形成非加工型假基因,而逆转录形成的基因重复会形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白产生细胞毒性,因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC,因此大量的非加工型假基因可以通过NMD的方式降解。然而,加工型假基因由于缺少内含子而不能通过NMD的机制降解,那么加工型的假基因是否进化出其他的方式来进行降解并不清楚。 近日,中山大学王金凯教授课题组在Genome Bi......阅读全文

曹雪涛、刘娟发表Immunity文章:天然免疫及炎症调控新靶标

   树突状细胞(DC)是一类重要的天然免疫细胞,在激活机体抗病原体免疫应答及维持自身免疫耐受过程中发挥关键性调控作用。DC的体内迁移对于其成熟活化及功能调控至关重要,DC迁移紊乱可能导致DC在炎症部位的过度聚集及活化,导致组织过度炎症,甚至引发炎症性疾病的发生。探索DC迁移过程的调控机制对于深入了

中科院、复旦Nature子刊解析RNA甲基化

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真

多篇文章解读影响男性生育力的诸多因素!

近年来,科学家们发现了很多影响男性生育能力的因素,比如来自中国的研究人员就发现,肥胖或会明显降低男性的生育力;而且还有研究人员发现,长期服用镇痛药布洛芬或会降低男性的生育力;本文中小编就盘点了近期多篇亮点研究成果,共同解读男性生育力关联性研究进展,分享给大家!【1】Front Physiol:胖子们

m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性

m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰,能够在多种生物过程中发挥重要作用,包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日,美国芝加哥大学何川,中科院北京基因组研究所韩大力和同济

看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

Nature遗传学综述:何川教授详解RNA甲基化

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现, mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。   RNA在生物学系统中有着举足轻重的作用,它

RNA甲基化整体水平鉴定的方法汇总

RNA甲基化(RNA methylation)是一类表观遗传修饰,在已经发现的超过100种不同的RNA化学修饰中,主要有6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)、5-甲基胞嘧啶(C5-methylcytidine, m5C)和1-甲基腺嘌呤(N1-methylad

Gotham成立 表观转录组学进入转化阶段

  10月11日,纽约的Gotham Therapeutics获得5400万美元A轮投资,正式挂牌成立。Gotham的技术平台是表观转录组学(epitranscriptomics)、即调控RNA的化学修饰。Gotham主要关注一种叫做m6A(6-甲基腺苷)的常见mRNA修饰,这个修饰在RNA代谢中起

广州生物院m6A修饰调控体细胞重编程机理研究获进展

  9月8日,中国科学院广州生物医药与健康研究院陈捷凯课题组在Cell Reprots杂志在线发表了题为YTHDF2/3 are required for somatic reprogramming through different RNA deadenylation pathways的文章。该研

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关...(一)

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&...1

如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测序研究,首发推出了超微

LncRNA搭上m6A后逆袭为新星

m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你!2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell,Cell

靶向干预m6A通路抑制癌细胞新策略被发现

  近日,国际期刊美国《公共科学图书馆—生物学》(PLOS Biology)在线发表了最新研究成果。该成果揭示了RNA甲基化m6A阅读器YTHDF2在细胞周期中的作用,并阐明细胞周期通过影响YTHDF2蛋白稳定性形成前馈调控回路的分子机制,为通过靶向干预m6A通路抑制癌细胞增殖提供新的策略。  论文

Hepatology:m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

  导读   近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

circRNA再发IF=18.88高分文章--circRNA机制研究汇总

超强子调控circRNA-Nfix缺失诱导成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成为心脏发育和疾病强有力的调节因子,但其在心脏再生中的作用仍然未知。鉴于此,作者与他的团队探究了与超增强子(SEs)相关的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生过程中的功能,并探究了其调节心脏重塑的分子机制

三个月内搞定5分m6A甲基化谱文章

关于m6A修饰的研究在生物领域持续火热,近年国自然立项和文章发表数目保持指数增长趋势,2020年pubmed收录文章已经高达652篇。云序生物在m6A修饰测序领域具有丰富的经验,近期云序客户又连发了5篇m6A甲基化测序研究的文章,下面小编就带大家一起来分析下这几篇发表文章的研究思路,给想短时间内发表

RNA甲基化位点分析新方法

  继上次QB期刊给大家推荐了WendyV. Gilbert教授的《关于pre-mRNA存在的修饰形式及其对剪接的影响》综述后,小编看到读者们的热情度特别高。借此机会,再给大家推荐一篇来自德克萨斯大学西南医学中心,QBRC、BICF中心主任谢阳教授实验室在QB期刊上发表的最新关于分析MeRIP-Se

Hepatology:m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

  近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat

m6A RNA甲基化酶METTL3促肝癌发展新玄机

导读近年来,m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m6A RNA修饰的催化、去除以及识别的分子机理研究越来越清晰,而人们更关心的似乎是m6A RNA修饰与重大疾病例如肿瘤之间的相关性。表观遗传的改变极大得促进了人类癌症的发展,近期Hepat

SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调...

SMAD2/3与TGF-β通路协同影响转录因子发生m6A RNA甲基化调控干细胞发育文章导读:胚胎干细胞作为一种全能性细胞,通过增殖和分化,产生动物体所有组织和器官的细胞。已有研究表明,胚胎干细胞发生m6A RNA甲基化,大多与细胞增殖[1-2],免疫应答[4]关系密切。然而,对于m6A修饰在胚

大跃进 | 中国学者CNS发表超过100篇生命科学领域研究成果

  【50】2019年4月12日,中科院上海药物所徐华强,王明伟,浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

何川教授新发Nature综述:mRNA修饰介导的基因调控

  在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。  N6-methyladenosine(m6A)是真

去甲基化酶ALKBH5在胰腺癌中的应用(三)

总结本文作者通过RNA-seq, m6A-seq, MeRIP-qPCR, ChIP, CoIP,双荧光素酶实验等方法,研究发现去甲基化酶ALKBH5缺失会加重胰腺ai的发生和不良临床病理表现特征。ALKBH5的过度表达可降低了体外肿 瘤的增殖、迁移和侵袭

2019年中国学者86篇Cell,Nature及Science文章汇总

  2019年上半年很快就结束了,iNature盘点了中国学者在Cell,Nature及Science发表的成果,我们发现总共有86篇(截至2019年6月24日),具体介绍如下:  4-6月发表的文章  【1】2019年6月21日,西北工业大学王文,中科院昆明动物研究所/BGI 张国捷及丹麦哥本哈根