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三代测序的DNA提取和宏基因组学分析(一)

改进的人类肠道微生物组的高分子量DNA提取,纳米孔测序和宏基因组学装配Improved high-molecular-weight DNA extraction,nanopore sequencing and metagenomicassembly from the human gut microbiomeNature Protocols [IF: 10.419]DOI:https://doi.org/10.1038/s41596-020-00424-x发表日期:2020-12-04第一作者:Dylan G. Maghini1通讯作者:Ami S. Bhatt(asbhatt@stanford.edu)1,2合作作者:Eli L. Moss,Summer E. Vance主要单位:1美国斯坦福大学遗传学系(Department of Genetics, Stanford University, Stanford, CA, USA......阅读全文

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

基因测序“摩尔定律”初现,“三代测序”要革“二代”的命?

  在“二代测序”(NGS)尚未迎来投资热潮的情况下,技术突破捷报连连的“三代测序”(3GS)又进入到了投资人的视野中。1986年,第一台商用基因测序设备正式出现,到第二代测序设备出现,期间间隔了19年时间。而第二代设备问世,到第三代设备的诞生,仅仅用了5年,基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。

PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长

DNA测序40周年:DNA测序的过去、现在和未来(上篇)

  在DNA测序过去的40年中,我们见证了诸多技术的变革和测序规模的极度增长。从几千个碱基到第一个人体基因组,乃至当前数以万计的人体和无数其它的基因组。包括作为大量分子现象的“计数器”在内,DNA测序被广泛和创造性地应用于各个领域。从长远来看,我们可以预测DNA测序技术所带来的影响将会与显微镜的使用

PacBio单分子测序最新科研动态

DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度

第三代测序技术:PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长

CFDA:关于《胎儿染色体非整倍体检测试剂盒指导原则》

关于《胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)指导原则》(征求意见稿)公开征求意见的通知  各有关单位:  根据我中心2016年度医疗器械技术审查指导原则编写的任务安排,我中心组织编写了《胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)指导原则》(

法医DNA检测仪器及其发展动向分析

摘    要:实践证明,法医DNA检测技术和相关仪器在犯罪嫌疑人认定、亲权鉴定和系列串并案侦破中发挥了显著作用,是我国公安一线侦察破案和打击犯罪的重要技术手段。以法医DNA检测技术为主线,对相关仪器的产生背景、发展历程、工作原理、各类技术优劣,以及国内外研究现

测序简史(三)

什么是miRNA测序成熟的microRNA(miRNA)是17~24nt的单链非编码RNA分子,通过与mRNA相互作用影响目标mRNA的稳定性及翻译,最终诱导基因沉默,调控着基因表达、细胞生长、发育等生物学过程。基于第二代测序技术的microRNA测序,可以一次性获得数百万条microRNA序列,能

Pacbio单分子实时测序技术于药用植物基因组研究应用

  药源短缺成为限制临床治疗和新药研发的最大瓶颈,因此,开发新的药物来源途径是迫切需要解决的问题。利用现代生物技术和次生代谢工程手段是未来生产药物最有潜力的发展方向。我国药用植物有1 万多种,大多数药用植物遗传背景不清楚,基因组信息缺乏,遗传信息和功能基因的研究亦极为薄弱。例如人参属(Panax)

法医DNA检测技术的现状及展望

法医DNA检测技术的现状及展望庞晓东 陈学亮 荣海博 俞丽娟 管桦 张涛公安部第一研究所DNA检测技术的应用,为法医学带来了一场技术革命。通过对遗传物质DNA的序列多态性及长度多态性的检验,即可实现个体识别及亲权鉴定,该技术正在成为当前法医物证鉴定最

复旦大学李辉团队:遗骸DNA检测技术助英魂回归故里

  1945年,在抗日战争末期的山西平遥,两位年轻的红军英雄在与侵略者的战斗中不幸牺牲。在当时局势尚未安稳的情况下,两位烈士只得暂时安葬于当地的丰盛村后山。  不久以后,其中一位烈士由其家人接回了故乡。另一位烈士则继续默默守护着这座他为之献出生命的小山村,同时也等待着家人的到来。然而,战乱时期分离的

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

下一代测序技术将改变生物学现状

  新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技

最具破坏性的葡萄病害,葡萄枝干病害防治获进展

  葡萄(Vitis vinifera L.)是世界四大水果之一,具有很高的经济价值。我国葡萄种植面积为79.79万hm2,居世界第二,产量高达1349万t,居世界首位(联合国粮农组织2018年数据)。在全球葡萄产业高速发展的同时,葡萄病害问题日益严重,其中葡萄枝干病害被认为是过去30年来最具破坏性

英开发出简化的基因组测序新方法

  据物理学家组织网12月12日(北京时间)报道,英国研究人员简化了基因组测序的标准流程,首次无需进行文库制备便完成了DNA(脱氧核糖核酸)单分子测序,而且新方法只要很少量的DNA就能获得序列数据,用量可低至不到1纳克(10亿分之一克),仅为常规测序方法的500分之一到600分之一。   文库制备

基因测序领域之成果、政策大盘点

1. 利用CRISPR/Cas9进行NGS建库和细菌克隆。 (NGS建库新方法)Cas9本质上是一种核酸酶,虽然科学家发现Cas9在真核细胞的基因靶向和编辑中具有重要作用,但是新的研究也在将Cas9用于体外和微生物细胞中来剪切DNA。3月份,加州大学旧金山分校(UCSF)Joe DeRisi领导

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(一)

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷伦科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系统采用革命性设计,是唯一一款能够自动进行高分子量 (HMW)

5大类分子诊断技术全解析

随着基因组学、蛋白组学、代谢组学等新兴学科的发展,分子诊断的内涵已经从DNA/RNA拷贝、突变等检测,拓展到核酸与DNA片段、蛋白与多肽、抗原与抗体、受体与配体等生物大分子的检测。从目前市场分子诊断产品来看,基于核酸诊断技术的产品仍占主要。截止2019年3月,分子诊断产品获批数量达1197项。按照技

分子诊断IVD设备的发展史(二)

托摩根核酸提取仪 MM96目前,现场分子诊断还存在诸多问题。免疫检测中可用试纸条等材料,检测方便,但是分子诊断没有这类材料可用,主要原因是样品前处理无法达到这种检测目的。当现场检测时,在很开放的环境下,如何提取纯化DNA,目前仍没有简易方法。现场检测的需求,目前在医院的临检中心还不大,对于基层的卫生

完整线粒体mtDNA提取神器SageHLS在测序合成的应用

有关线粒体DNA:线粒体是一种存在于大多数细胞中的由两层膜包被的细胞器,细胞中制造能量的结构,是细胞进行有氧呼吸的主要场所。线粒体病是遗传缺陷引起线粒体异常,致使ATP合成障碍、能量来源不足等导致的一组异质性病变,又称为线粒体细胞病。常见的线粒体疾病有Leber遗传性视神经病变(LHON)、线粒体脑

PacBio单分子测序揭示丹参叶绿体DNA修饰的相互作用

  2014年6月10日,中科院药用植物研究所(IMPLAD)刘昶团队在《PLOS ONE》杂志上发表了利用PacBio测序技术揭示丹参(Salvia miltiorrhiza)叶绿体DNA修饰之间复杂相互作用的相关文章,该文章报道了丹参叶绿体中编码及非编码RNA的表达情况。这也是国内PacBio第

4大基因测序技术在无创性产前检测中的应用

  近年来,通过高通量测序技术检测孕妇外周血中游离胎儿DNA(cfDNA)筛查胎儿染色体多倍体异常的无创性产前检测( noninvasive prenatal testing, NIPT)技术正越来越多地用于临床,其具有安全性、高效性及准确率高的特点,正在给产前诊断技术带来革命性的变化。NIPT技术

体外诊断IVD-基因测序技术概述(T16)

     分子诊断的主要技术有核酸分子杂交(FISH)、聚合酶链反应(PCR)、基因测序技术和生物芯片技术(gene chip)。      基因测序是通过血液、其他体液或细胞对 DNA 分子信息做检测,从而检查 DNA 序列有无缺陷,找到

中国精准医疗无人区,有人护!

——访伯科创始人郭诚博士  日前一则“打破国外垄断!伯科生物推出自主知识产权的生物液相芯片杂交捕获与探针原位合成技术”引起了业界广泛关注,细细阅读后,我好奇地开始探究“伯科”了。伯科创始人是谁?这一探针合成技术优势在哪里?能为中国精准医疗带来什么变化?  ……全球有机化学殿堂—美国哥伦比亚大学Hav

扒一扒进口基因测序仪中的一朵“奇葩”

   本文由原创作者 矮小森 授权 分析测试百科网发表,从中我们可以闻到NGS战场上的硝烟,感受到科学奇才们的大胆创意和持续的斗志。   说起基因测序仪,很多人都会第一时间想起进口的品牌和产品。这没办法,因为目前能够有自主知识产权和生产能力

下一代测序技术将改变生物学现状(一)

新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技术的论文[1

普通PCR技术和数字PCR技术,什么区别?

PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。按照PCR技术的演进,人们习惯性将PCR技术划分为三代:普通PCR技术、实时荧光定量PCR技术(qPCR)以及数字PCR(dPCR)技术。以前也介绍了很多关于qPCR相关知识,这期给大家分享另外两种PCR技术

Techniques:培养、鉴定、和16s测序

  微生物识别和诊断的分子技术  依赖培养的方法太慢,于是可以使用一些分子信号,如核苷酸、蛋白质、代谢化合物。  16s rRNA gene PCR在诊断微生物方面广泛使用。PCR-based 方法更为敏感和定量化:  1.qPCR:对扩增进行定量。扩增时在特定的靶向探针上加上荧光染料,裂解后造成荧