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人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展

2022年12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in the human gut的研究论文。该工作首次对人类肠道宏基因组的古菌病毒进行深入挖掘与全面分析,揭示了人类肠道中古菌病毒组的多样性,推动了人类肠道古菌病毒组的研究进展。 人类微生物组的组成和功能与宿主的健康相关。除细菌外,肠道微生物群中的非细菌成员(古菌、真菌和病毒)也在微生物群落的动态演替以及人类的生理、免疫、疾病等方面发挥重要作用。古菌是人体的共生微生物之一,曾在肠道,口腔和皮肤等部位被检测到,且与人类疾病相关。与细菌相比,古菌在人体内的丰度相对较低,且多不可培养,因而与人类相关的古菌常被忽视。病毒控制微生物群落的组成和代......阅读全文

人体肠道细菌基因组集研究成果

2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时

华大基因完成肠道微生物基因组关联分析

  从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期

Nature:CRISPR实施全基因组筛选鉴定肠道病菌感染靶标

  10月20日Nature上刊登的一项研究用CRISPR实施全基因组筛选,鉴定了新兴的威胁生命的胃肠道艰难梭菌(Clostridium difficile)感染的关键靶标。美国波士顿儿童医院的Min Dong博士和Liang Tao博士领导的研究小组的工作揭示了这种细菌最强效的毒素如何进入细胞,这

口腔、肠道微生物菌群元基因组关联分析

  2015年7月28日,北京协和医院和华大基因等机构的研究人员共同合作完成了类风湿关节炎(RA)口腔和肠道微生物元基因组研究。本项研究揭示口腔和肠道微生物菌群异常是RA病理生理和疾控的重要环节,并且为元基因组学辅助的RA个性化诊疗方案提供基础。研究成果于今日发表在《自然医学》杂志。  RA是一种致

人类肠道宏基因组的古菌病毒研究新进展

  2022年12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在《自然-通讯》(Nature Communications)上,发表了题为Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in

多样性增加281%,人类肠道菌群基因组图谱公布!

  近两年来,以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明,许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应,最终出现不得不提前终止治疗的情况。  而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症,能够极大地改善患者对该疗法

研究揭示环境对人肠道菌群和耐药基因组影响

  华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室和国家兽医微生物耐药性风险评估实验室刘雅红教授团队与中外合作者,发现人体和环境间存在广泛的菌株和基因交换,而且环境对人肠道菌群的影响可能会持续4~6个月。相关研究3月18日在线发表于《自然—通讯》。  生物圈中的微生物种类众多,其分布无处不在。同样

Cell子刊惊人发现:饮食会通过肠道菌影响表观基因组

  UW-Madison研究团队十一月二十三日在Molecular Cell杂志上发表文章指出,饮食会影响肠道菌释放的代谢物。这些代谢物作用于宿主近端结肠、肝脏和脂肪组织的组蛋白,通过表观遗传学途径改变这些组织的基因转录。  研究人员首先对无菌小鼠和肠道菌活跃的小鼠进行比较。他们发现,肠道菌群能改变

科研人员深度挖掘人类肠道宏基因组的古菌病毒

  北京时间12月30日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞团队在国际学术期刊《自然-通讯》(nature communications,IF=17.69)上发表了题为"Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of arch

张文宏受聘南大!

  7月2日上午,南京大学病毒与感染病研究所正式成立。国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏,被聘为兼职教授和名誉所长,并现场做了《人类传染病的过去现在及未来》的主题演讲。  演讲中,张文宏提到,从人类与传染病的斗争史来看,病毒将长期存在,今天有新冠病毒,明天可能还会有其他病毒

宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用

  中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水(Acid mine drainage, AMD)中的微生物群落进行研究,相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。  本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样

肠道菌群 | Science专刊:决定你健康状况的"第二基因组"

  肠道菌群与人体健康密切相关,二者之间的关系是目前研究的热点。随着研究者的不断深入,我们发现,对人体微生物的了解还远远不够,它们能帮助我们做什么,以及我们如何改变它们?  4月29日,美国《科学》杂志以“Microbiota at work”为主题发了一期专刊,从不同的方面介绍了人体微生物与健康的

张文宏:不是我说的

据东方网报道,12月20日下午开始,一段疑似张文宏的音频流传在微信朋友圈中,音频谈到当前新冠感染威胁、家庭防护推荐等多方面话题。但细心的网友发现,此段音频中包含有一些和张文宏医生之前观点相反的意见,甚至还有推销产品的嫌疑,因此,该段音频遭到质疑。这段音频是张文宏医生说的吗?张文宏向东方网回复:“不是

华大基因构建全球首个小鼠肠道微生物参考基因集

  2015年9月28日,中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集,为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。  人类的肠道中居住着种类繁多,数量惊人的微生物,而在这些微生物中,细菌的比例高达90%

肠道中

结直肠肿瘤中充斥着大量的白细胞,但这些细胞是有助于还是阻碍了癌症的发展,人们对此争论不休。虽然一些研究表明,白细胞可以有效地抑制肿瘤生长并对抗结直肠癌,但同样令人信服的证据表明,白细胞是恶性肿瘤的同谋——增强肿瘤并帮助其扩散。现在,新的研究澄清了这些肠道白细胞,即

肠道细菌能逃离肠道,引发慢性炎症?

肠道微生物与良好的健康和促进疾病有关,如自身免疫性疾病、炎症性肠病、代谢综合征,甚至神经精神疾病。对这些不良后果的一种流行解释是所谓的“leaky gut”假说——据说具有潜在破坏性的细菌会逃离肠道,引发慢性炎症反应,从而导致各种疾病。耶鲁大学免疫生物学助理教授诺亚·帕尔姆(Noah Palm)说:

Nature | 肠道菌群促进肠道兴奋性维持肠道生理功能

  神经系统调控机体内脏功能对维持健康至关重要。肠道蠕动对消化系统生理功能和宿主防御是非常关键的。肠道神经系统(enteric nervous system ENS)是调控胃肠道的内在神经网络,它调节肠道的各方面生理功能,包括肠道蠕动【1】。调控肠道生理功能的因素有很多,其中包括宿主特异性遗传因素、

张文宏:莫忽视科研行为本身

  “创新本身不能被预先设计,也没有既定的方向。”近日,在复旦大学管理学院医疗健康产业峰会圆桌对话环节,国家传染病医学中心主任、复旦大学附属华山医院感染科主任张文宏,围绕“细胞与基因领域技术创新的产业化和国际化”主题,发表了自己的看法。  创新转化为什么有时候很快,有时候又很慢?张文宏认为,如果仅仅

自体肠道重建联合移植治疗慢性肠道衰竭

  第139届美国外科协会(ASA)年会于2019年4月11日至13日在美国达拉斯举行。ASA成立于1880年,是美国历史上最悠久、最负盛名的外科组织,其成员不仅包括来自美国的知名外科医生,还包括来自世界各地的顶尖外科医生。  协会还设立了年度科学奖以鼓励外科领域的优秀人才,从而提高外科临床的诊疗水

从肠道菌群到肠道病毒群

  肠道菌群早以已经成为热点科技新闻概念,其核心要点是肠道内细菌是维持健康的重要因素。其实肠道菌群自己身体内也有另外一种生命,就是细菌病毒,又称为噬菌体。最近有研究发现,肠道内细菌感染的噬菌体对人体健康也具有重要价值,这些病毒无法裸露生活,都必须隐藏在细菌体内寄生。这里形成一个非常有趣的现象,人的肠

有益肠道菌群如何有效适应宿主肠道

  有益菌菌群的生理功能:   如果肠内有益菌菌群占优,肠内黏膜呈现粉红色,表示肠内环境相当良好。   1、吸收水分,粪便较软,较易排泄   在胃部分解消化的食物,经由小肠吸收营养后,成为粘稠状物体送至大肠。然后再经过18小时将水分及矿物质吸收,就变成容易排泄的粪便。肠道内环境良好时,粪便的软

肠道杆菌介绍

  肠道杆菌(Enteric bacilli)是一大群寄居于人和动物肠道中的革兰氏阴性无芽胞内杆菌,常随人与动物粪便排出,广泛分布于水、土壤或腐物中。  肠道杆菌属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae),分类尚未完全统一,过去主要依据生化反应和抗原结构进行分类。近十多年来,应用DNA同源

肠道杆菌介绍

肠道杆菌肠道杆菌(Enteric bacilli)是一大群寄居于人和动物肠道中的革兰氏阴性无芽胞内杆菌,常随人与动物粪便排出,广泛分布于水、土壤或腐物中。肠道杆菌属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae),分类尚未完全统一,过去主要依据生化反应和抗原结构进行分类。近十多年来,应用DNA同源

张文宏称新冠已成常驻病毒

  我们都知道新冠肺炎病毒已经存在长达大半年之久了,但是病毒依旧还在传染并未消停,更有消息表示新冠肺炎病毒以后将会成为常伴的病毒,近来张文宏称新冠已成常驻病毒跟着小编一起来看看是怎么回事吧!  转眼已是秋冬季,全球已与新冠病毒抗争了大半年。在预测第二波疫情成为必然、疫情还要延续相当长的时间之后,复旦

张文宏等获评2020“最美教师”

  为热烈庆祝第36个教师节,由中宣部、教育部、中央广播电视总台举办的“闪亮的名字——2020寻找最美教师”发布仪式日前在京举行。在发布仪式上,公布了10位最美教师、1个最美教师团队的先进事迹。 荣获2020年“最美教师”称号的教师有:复旦大学教授张文宏,中国人民大学教授王易,北京航空航天大学教

南京疫情跨省传播,@张文宏医生 解读!

  7月29日凌晨,@张文宏医生 在微博上发声:  南京疫情促使全国经受压力测试,为未来疫情防控提供更多思考。  近期南京疫情跨省传播,成为输入性疫情引发国内传播的新模式。在严格管控疫情和加速疫苗接种的今天发生多省疫情扩散引发公众对于未来的巨大不安,这份不安其实来自对于未来巨大不确定性的不安。  1

陈啸宏:药师要确保合理用药

卫生部副部长陈啸宏发言  第二届中国药师大会在北京召开。卫生部副部长陈啸宏指出,广大药师要以深化医药卫生体制改革为契机,保证生产、流通、使用各环节的药品质量,开展以患者为中心的药学服务等方面发挥重要作用。  为了进一步落实医改各项政策,深入探讨我国医改过程中的有关问题,推动药品生产、经营、使用领域药

刘宏涛:做科普当先立品牌

  金秋十月,中国科学院武汉植物园一年一度的“斗菊”大赛又进入了白热化的阶段。   “我们每年都到社区里去,给老百姓赠送菊苗。到秋天举办菊花展时,市民再把自己养的菊花带过来,参加我们的斗菊擂台赛。”中科院武汉植物园园艺中心主任刘宏涛说,“几年下来,这个活动已经发展成很受欢迎的品牌。”   200

肠道免疫系统由肠道微生物守护!

  科学家们早就知道肠道细菌对宿主有各种各样的作用,例如分解膳食纤维、制造维生素K和B7等等。然而,一项新研究揭示,微生物还有另一个作用。  布朗大学的研究小组发现,小鼠体内肠道微生物正在参与调控宿主免疫。与其说宿主的防御系统可能攻击这些有益细菌,不如说细菌可以与动物的免疫系统和平共存。  对立的外

肠道细菌或导致包括癌症在内的肠道疾病

  不要小看细菌,这些肉眼难以看见的微小生物,它们可能具有破坏性的力量。  据《新科学家》报道,如今越来越多的证据表明,一些肠道癌症是由细菌引起的。这种微生物似乎在人类的DNA中触发了一种不同类型的突变,而这种突变在结肠癌患者中高达十分之一。  “这是我们第一次发现能改变DNA并致癌的细菌。”荷兰H