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人体肠道细菌基因组集研究成果

2019年2月5日上午,深圳华大团队在国际知名学术期刊自然旗下子刊自然生物技术上发表了关于人体肠道细菌基因组集(Culturable GenomeReference, CGR)研究成果。该研究提供了1500多条高质量的人体肠道细菌基因组,为肠道微生物组研究提供了大量全新的参考基因组数据,同时将肠道菌群的功能分析提升到新维度,这也是首次通过大规模培养的技术手段获得如此多数量的高质量细菌基因组数据。这项由深圳华大生命科学研究院宏基因组学研究团队主导构建的人肠道细菌基因组集及菌株库,对于实现精准解密肠道菌群与疾病之间的关系具有重要的科研价值,同时也为人肠道菌株功能的深入探索提供了宝贵的基础资源。肠道细菌的厌氧培养方法 :在抽样前的最后一个月,从155名未服用任何药物的健康人类捐赠者收集粪便样本。。将样品立即转移到厌氧室(Bactron厌氧箱,Bactron IV-2,Shellab,USA),在补充有0.1%半胱氨酸......阅读全文

中科院新研究: 抗生素滥用增强肠道细菌耐药性

  抗生素滥用或过度使用会引发一系列问题。近日,中国科学院微生物所朱宝利研究员带领的研究团队对中国、丹麦和西班牙人的肠道微生物耐药基因进行了分析,结果发现,中国人肠道微生物的耐药基因类型较多,而且这三个国家的人群,肠道微生物的四环素耐药基因型都很高。科研人员据此推测,这种情况的产生很可能与兽用抗生素

多篇文章共同解读免疫系统与肠道菌群的奥秘

  近年来,随着科学家们研究的不断深入,越来越多的研究证据将机体的免疫系统与肠道菌群联系了起来,当然我们很多人并不清楚免疫系统到底和机体肠道菌群有着怎样的关联?免疫系统能够被肠道菌群调节,抑或者其能够主动调节机体肠道菌群的多样性从而来影响健康?  本文中就对二者之间的关联性研究进行了整理,如下:  

微生物所在人体肠道细菌耐药基因研究方面取得进展

  人体肠道中栖息着种类繁多的微生物,其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中(microbiome)蕴含大量的遗传信息,被称为是“人体的第二个基因组(the second genome of human body)”。人体肠道微生物对人体肠道内营养物质的代谢、人体自身的发育

你还在“谈菌色变”吗?

  生活中很多人“谈菌色变”,觉得细菌就是肮脏的代名词,是传播疾病的媒介。事实上,细菌也分为有益的和有害的,不仅我们生存的环境中到处都是细菌,而且我们的身体上就居住着无数的细菌。  我们生活的环境离不开细菌。从我们呼吸的空气,到辽阔的大海,都充满了细菌。  大约在30亿年前,地球本是无氧的环境。而地

深圳先进院首次揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病的相关性

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)研究团队,在人体微生物组研究领域取得进展,相关研究成果以A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes为题,发表在Microbiome(《

揭开肠道微生物诸多秘密的NCS重磅研究

  最近几年关于肠道微生物的研究越来越火热,日益深入的研究也逐渐揭开了肠道微生物的诸多秘密,越来越多的研究发现肠道微生物与人类健康密切相关。本文中小编为大家盘点了近期关于肠道微生物与健康相关的NCS重磅研究,分享给大家。  【1】Cell:震惊!肿瘤微生物组竟能决定癌症患者的生死  DOI:10.1

重磅!肠道菌群如何诱发类风湿性关节炎?

  仅在我们人体肠道中,就含有超过100万亿个细菌,这些细菌有助于人体消化食物,产生维生素以预防食物中细菌所诱发的疾病,同时刺激免疫系统。随着研究深入,科学家发现肠道微生物在许多慢性疾病和症状中,如炎症、肥胖等也起了关键作用。现在,越来越多的研究表明,肠道细菌通过影响它们寄主的信号通路可能引发癌症、

中国学者《Microbiome》揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病相关性

   中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)的研究人员发表了题为“A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes”的文章,通过人肠道噬菌体集揭示肠道噬菌体组和II型糖尿病的相关性,这首次证实

华大基因构建全球首个小鼠肠道微生物参考基因集

  2015年9月28日,中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集,为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。  人类的肠道中居住着种类繁多,数量惊人的微生物,而在这些微生物中,细菌的比例高达90%

Cell Reports:肠道有益细菌如何与人类细胞交流?

  交流,对于任何成功的关系都极其重要。东安格利亚大学(UEA)食品研究所(IFR)的研究人员发现了我们肠道有益细菌如何与我们的自身细胞进行交流。   这是理解“我们身体如何与肠道菌群保持密切关系”的关键一步,肠道菌群对于保持我们的健康、抗感染和消化食物,起着非常重要的作用。   这一研究成果发

中国首次鉴别出人体肠道中1093个耐药基因

  9月的北京,终于迎来了秋高气爽的好天气。这几天,中科院微生物所博士生杨犀的心情,正如这惬意的天气一样,变得明亮起来。  两年多来,每天走进实验室,他要面对计算机屏幕上成千上万个肠道微生物不同基因的组合条码,分辨其不同之处,并提取相同的点位。这一度让他和师兄胡永飞以及导师朱宝利烦闷之极。  直到刚

Nature,Science两大顶级杂志聚焦“第二基因组”

  人体内有两个基因组,一个是从父母那里遗传来的人基因组;另一个则是出生以后才进入人体、特别是肠道内的多达1000多种的共生微生物,其遗传信息的总和叫“微生物组”,也可称为“元基因组”,相当于人的第二个基因组,它们所编码的基因有100万个以上。两个基因组相互协调、和谐一致,保证了人体的健康。   

媒体误读 雾霾中的耐药基因其实并不那么可怕

  瑞典研究人员在日前的一篇论文中提到,从北京一次雾霾天的14份空气样本中检测出抗生素耐药性基因。国内有媒体在报道中就此推论出呼吸这样的空气会导致药物失去作用的结论。消息一出,引发舆论广泛关注,有人甚至担心呼吸这样的空气会被感染致病。那么,真会如此吗?本报带你一起探究真相。  疑问:空气中的耐药基因

新测序方法解析人体“第二基因组”

  来自华盛顿大学圣路易斯分校,耶鲁大学等处的研究人员发表了题为“The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota”的文章,针对被称为人体“第二基因组”的肠道微生物组展开了研究,研究人员利用一种称为LEA-seq的方法,对多个个体粪便中的微生

Cell、Nature Medicine:绘制第三大常见癌症肠道细菌全图谱

  很早,我们就知道癌症是由于不良生活习惯引起的,比如不健康的饮食或吸烟。近年来生活在我们身体内和身体上的微生物作为关键参与者进入了这个研究舞台,比如科学家们发现胃癌可以由单一细菌物种:幽门螺杆菌引起,但是关于全世界第三大常见癌症——结直肠癌的肠道细菌的影响,一直还没得到解答。  为了回答这个问题,

你的好心情可能是被肠道微生物「吃掉了」

  在生活中,如果你很容易因为一些事情焦虑、抑郁,久久不能自拔。这很可能跟最近新发现的一种微生物有关。这个微生物的饮食习惯极其变态,它以食用一种帮助我们缓解焦虑和抑郁的物质为生。到目前为止,它是科学家发现的第一种会食用大脑必需化学物质的微生物。   上个月,2016年美国微生物学会微生物年会在波士顿

科学家首次发现肠道微生物分泌蛋白可提高胰岛素水平

  记得老编辑有天对我讲,「有些投资人告诉我,现在微生物领域是投资热点,大家都在看项目,但是好的项目实在是太少了。」  近十年来,二代测序技术不仅催生了一大批专注于人体基因组的公司,也孕育了一大批关注人体肠道微生物的公司。几乎每周都有肠道微生物的重磅研究进展刊登在各个顶级期刊上,然后迅速刷爆朋友圈。

微生物与健康之间关系

  物种身上的微生物与其健康之间有没有联系?这是美国科罗拉多大学微生物学家罗布·耐特想找破解的谜团。耐特在世界各地从野生动物身上提取细菌样本,然后带到实验室进行分析。耐特是微生物医学领域的权威,被誉为“基因序列机器”。他首先把各种微生物的基因序列破译出来,然后通过计算工作与物种身上的微生物

“万能”的肠道微生物

   公元前300多年,西方“医学之父”希波克拉底曾扬言:“所有疾病始于肠道”。  两千多年后,医学工作者们发表了众多研究成果,他的观点正在一点一点地被证实。当我们谈到许多慢性疾病的发病机制时(比如慢性肠炎、糖尿病,甚至阿尔茨海默症、衰老、肥胖症、药物疗效等),我们逐渐意识到,肠道微生物几乎是绕不开

中国科学家发现“致胖细菌”追寻药食同源

  重新发现肠道细菌   微生物组学是当今生命科学最热门的领域之一,在此基础上,中国科学家首次确定了一种细菌是肥胖的病因。这个拿自己做试验的科学家成功减肥的故事,也从肠道微生物学的角度,寻找到一个诠释古老中医药理论的新途径……   合体的毛衣下没有隆起的肚腩,72公斤,对于身高173厘米、年满5

肠道菌群已成为科研界最为火爆的领域之一

  5月19日是世界炎症性肠病日,在2010年此日设立之初,和此病密切相关的肠道菌群在大多数人眼里还很陌生,可以说是人体中“被遗忘的器官”。然而,短短6年下来,肠道菌群已成为科研界最为火暴的领域之一。其相关研究成果经常占据《自然》《科学》和《细胞》杂志封面,而这些顶级杂志也不免专门为其编发增刊,比如

肠道菌群从被忽略到备受关注

  5月19日是世界炎症性肠病日,在2010年此日设立之初,和此病密切相关的肠道菌群在大多数人眼里还很陌生,可以说是人体中“被遗忘的器官”。然而,短短6年下来,肠道菌群已成为科研界最为火暴的领域之一。其相关研究成果经常占据《自然》《科学》和《细胞》杂志封面,而这些顶级杂志也不免专门为其编发增刊,比如

肠道菌群已成为科研界最为火爆的领域之一

5月19日是世界炎症性肠病日,在2010年此日设立之初,和此病密切相关的肠道菌群在大多数人眼里还很陌生,可以说是人体中“被遗忘的器官”。然而,短短6年下来,肠道菌群已成为科研界最为火暴的领域之一。其相关研究成果经常占据《自然》《科学》和《细胞》杂志封面,而这些顶级杂志也不免专门为

全球40家创新公司竞逐国内微生物组产业走向应用爆发期

  2016年,美国克利夫兰医学中心预言《2017十大医疗创新科技》,其中利用微生物组预防、诊断和治疗疾病领域高居榜首,这表明全球已掀起微生物研究的新热潮且取得瞩目成绩,同时在市场潜力与应用前景方面,微生物组学将焕发无限生机。   我们知道,所有机体包括人在内都与微生物是共生体,人体身上有超过1

中国科研人员构建最优质人肠道微生物参考基因集

  7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。  据介绍,人

人类肠道微生物基因集 为研究提供精准数据支持

  7月7日,由华南理工大学生物科学与工程学院博士研究生李俊桦为第一作者,与深圳华大基因研究院、丹麦哥本哈根大学等单位共同合作完成的《人肠道微生物组参考基因集》研究成果在《自然—生物技术》上发表。这是“华工—华大”基因组科学创新班学子在国际顶级学术期刊上以第一作者身份发表的第二篇文章。  据介绍,人

盘点食品界中渐渐崛起的基因测序

  2015年可谓是基因测序的元年,自精准医疗概念提出以来,基因测序在我国曾几度被央视报道。随着人类基因组计划的完成,基因测序技术不断提高,价格也不断降低,人类完成各种基因组测序成为了可能。无论在医疗行业还是在农业等领域,基因测序技术均大放光彩,殊不知,近年来基因测序在食品行业也渐渐崛起。本文综述了

4月2日世界自闭症日 解读CNS杂志自闭症领域重要成果

  目前,全球人群自闭症发病率逐年上升,来自美国最新数据显示,自闭症儿童发病率已由2009年的1/88,上升至现在的1/45;有数据表明,中国自闭症发病率达0.7%,目前中国自闭症患者超过1000万,其中12岁以下的儿童约有200多万。自闭症以男孩多见,其是脑部神经发育异常造成的一种终身性疾病,目前

华大基因完成肠道微生物基因组关联分析

  从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期

在预防和治疗人类疾病方面 免疫细胞占据了重要地位

  【1】Nat Commun:新研究发现一种新的非传统免疫细胞可以对抗病毒感染  由伯明翰大学领导的研究发现了一种新的非传统免疫细胞可以对抗病毒感染。这项研究于近日发表在《Nature Communications》上,聚焦于控制我们免疫系统的T细胞,该研究由他们与荷兰学术医学中心和俄罗斯科学技术