如何利用已知基因设计特异性引物

首先在NCBI进行blast比对,找到基因的特异序列,与其他基因同源性低的区域,然后再这些区域设计引物。还有一种方法是先在基因上设计引物,然后再blast比对引物,看看在你的目的物种中是否有同源基因。......阅读全文

设计基因调控回路延缓衰老

人类的寿命与个体细胞老化有关。3年前,美国加州大学圣地亚哥分校的一组研究人员破译了衰老过程背后的基本机制。在确定了细胞衰老过程中遵循的两个不同方向后,研究人员通过基因操作这些过程来延长细胞的寿命。据发表在最新一期《科学》杂志上的论文,他们现在利用合成生物学扩展了这项研究,设计了一种解决方案,可防止细

“设计精子”将定制基因导入后代

  英国北米姆斯皇家兽医学院的科学家们,在12月2日的The FASEB Journal杂志上发表的一项最新研究中,通过一个病毒载体将新的遗传物质导入小鼠精子中,让这些基因在胚胎中表达并起作用。这项发现——如果在人类中是成功的——能为遗传医学带来新的希望。   “新遗传学”承诺,通过利用“设计

基因转染和实验设计原则

磷酸钙-DNA共沉淀法核酸以磷酸钙-DNA共沉淀物的形式出现时,可使DNA附在细胞表面,利于细胞吞入摄取,或通过细胞膜脂相收缩时裂开的空隙进入细胞内,进入细胞的DNA仅有1%~5%可以进入细胞核中,其中仅有不到1%的DNA可以与细胞DNA整合,在细胞中进行稳定表达,基因转导的频率大约为10-4,这项

如何设计基因cds序列的pcr引物

提取细胞总RNA然后用试剂盒反转录成cDNA,用cDNA作为模板扩增基因的CDS区,然后想要转染进细胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部复制下来,在primer5.0中。正向引物直接从CDS的第一个核酸开始(比如18bp),反向引物从CDS最后一

科学家设计基因调控回路延缓衰老

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/499595.shtm

如何利用已知基因设计特异性引物

首先在NCBI进行blast比对,找到基因的特异序列,与其他基因同源性低的区域,然后再这些区域设计引物。还有一种方法是先在基因上设计引物,然后再blast比对引物,看看在你的目的物种中是否有同源基因。

全基因组设计培育高产优质抗病粳稻

近日,江苏里下河地区农业科学研究所李爱宏团队联合中国农业科学院植物保护所宁约瑟团队、扬州大学杨泽峰团队在《基因组生物学》发表研究论文。    该研究收集了我国江苏省、浙江省和山东省等地大面积推广的198份粳稻品种并进行基因组重测序分析,解析了华中地区优良粳稻品种的基因组信息和优势基因位点的遗传学

基因组研究让水稻育种走向精准设计

  由中国主导的国际间科研大协作项目“3000份水稻基因组研究”26日结出硕果——北京时间当日凌晨1时,国际顶级学术期刊《自然》正式发表《3010份亚洲栽培稻基因组研究》。该研究针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨,揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构,剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传

全基因组设计培育高产优质抗病粳稻

近日,江苏里下河地区农业科学研究所李爱宏团队联合中国农业科学院植物保护所宁约瑟团队、扬州大学杨泽峰团队在《基因组生物学》发表研究论文。    该研究收集了我国江苏省、浙江省和山东省等地大面积推广的198份粳稻品种并进行基因组重测序分析,解析了华中地区优良粳稻品种的基因组信息和优势基因位点的遗传学

贺林:-基因测序发展需要更多顶层设计

  创新启示录:基因测序产业应用前景广泛  《中国出生缺陷防治报告(2012)》指出,我国出生缺陷发生率为5.6%,每年新增出生缺陷患儿89.6万,其中结构畸形25万,防治形势严峻。这些实际仅是来自刚出生时的统计数据,如果把后发的也进行统计,出生缺陷人数要远远高于此数。  “冰岛的人口不过30万人,

基因测序产品的设计应听取临床医生建议

今天我想跟各位群友分享的主要内容是:基因测序产品本身在设计和应用过程当中应该主要考虑的一些问题。一、基因测序的发展史我们知道基因测序技术它从人类基因组计划开始,通过一代测序发展起来,当年我自己也做过一代测序,做一段基因的一代测序非常不容易,要设计引物,跑PCR验证,遇到一些片段引物非常难设计。这个过

临床基因扩增实验室设计有哪些要求

临床基因扩增实验室设计、建设SICOLAB区域划分要求:如下1、原则上,临床基因扩增实验室(标本前处理区、试剂储存和准备区、标本制备区、扩增区、扩增产物分析区)并有独立的通风系统、缓冲间。2、根据使用仪器的功能,区域可适当合并,例如使用实时荧光PCR仪,扩增区、扩增产物分析区可合并;采用样本处理、核

基因编辑鼠的构建-Guide-RNA设计和筛选

众所周知,CRISPR/Cas9被业内誉为“基因剪刀”,它可以高效地实现靶基因的编辑,自问世以来就备受关注和青睐。CRISPR/Cas9系统是由CRISPR相关基因和Cas9组成,Cas9核酸酶会在向导RNA(Guide RNA, gRNA)的指引下,在完整基因组上的特定位点完成切割反应,同

CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计

sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有:1、http://crispr.mit.edu/ ;2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/;等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要,但仍然存在很多不足和缺陷。例如:1、数据分析周期长;2、无具体的脱靶数据;

药物设计,设计什么?

  上周《Nat. Rev. Drug Discov.》一篇分析显示设计符合类药性(drug-like)规则的候选药物并不能真正增加这些药物在开发路程上的成功率。那么现在药物需要如何设计才能保证一定的成功率呢?  首先药物设计不是大学教科书里讲的活性分子设计,设计活性化合物要容易无数倍。新药在今天的

植物抗病基因的人工改良设计的视野被拓宽

  近日,南京农业大学植物保护学院陶小荣教授团队在植物学知名期刊《Plant Biotechnology Journal》发表题为《Stepwise artificial evolution of an Sw-5b immune receptor extends its resistance spe

深圳先进院等团队发现新电池材料设计基因

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院集成技术研究所功能薄膜材料研究中心研究员唐永炳团队联合泰国同步辐射光源研究所研究员Kidkhunthod等人,发现了具有三棱柱配体场的正极材料结构基因(TMO6,TM为过渡金属原子)。相关研究成果以K-Ion Battery Cathode Design Uti

增强抑癌基因表达中国团队设计抗癌新策略

   【新华社华盛顿5月26日电】新一期美国《科学·转化医学》杂志刊发中国科研人员的研究报告,介绍了一种抗癌新策略。他们利用新方法让可抑制癌症的基因得以充分表达,取得了阻止肿瘤发展和扩散的效果。    研究发现,3种人体中可以抑制癌症的基因在多种肿瘤中不能充分表达,无法有效干预癌细胞的增殖和转移。

增强抑癌基因表达-中国团队设计抗癌新策略

  新一期美国《科学·转化医学》杂志刊发中国科研人员的研究报告,介绍了一种抗癌新策略。他们利用新方法让可抑制癌症的基因得以充分表达,取得了阻止肿瘤发展和扩散的效果。  研究发现,3种人体中可以抑制癌症的基因在多种肿瘤中不能充分表达,无法有效干预癌细胞的增殖和转移。南开大学药学院教授杨诚对新华社记者介

转基因作物田间试验的设计与管理实验

实验材料转基因株系实验步骤3.1 释放试验的地理位置要求释放地点应是宜于种植该作物的一个隔离区,其动植物区系与周围农田没有差别,而且没有稀有或受保护的植物或动物物种,也必须确保释放地点较远的区域没有政府机构认定的群落生境或保护区。试验区要求地势平坦,既要能减少基因逃逸的危险,又要便于耕作,使试验尽可

转基因作物田间试验的设计与管理实验

实验材料:转基因株系    实验步骤:3.1 释放试验的地理位置要求释放地点应是宜于种植该作物的一个隔离区,其动植物区系与周围农田没有差别,而且没有稀有或受保护的植物或动物物种,也必须确保释放地点较远的区域没有政府机构认定的群落生境或保护区。试验区要求地势平坦,既要能减少基因逃逸的危险,又要便于耕作

所有的看家基因(housekeeping-genes)的列表+引物设计服务

以下是所有的看家基因的列表,大家在设计引物时,可以直接采用这些基因的序列,本表来自于Trends in Gentics上一篇文献,内容全面,所有的看家基因均标注了基因银行号(Genbank),可以直接到pubmed中查询得出。引物设计可以推荐用primer 5,也可以直接与我们联系设计,有关事宜,请

设计cas9条件性基因敲除小鼠

其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠,即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步:第一步,选择外显子。第二步,设计sgRNA。第三步,设计SSODN。听起来蛮简单的哈?下面我们详细讲讲。第一步,选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。

RNA引物设计怎么设计

一般就是设计引物能够跨越至少一个exon-exon junction的,就是引物在两个exon的交界处,这样pcr的时候就不会有DNA污染现在NCBI可以直接有引物设计,还可以选择上述的设计方式或者可以通过找到cDNA序列然后自己在primer3上设计也可以

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp;2、引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近;3、引物所对应的模板序列的Tm值最好在72℃左右,至少要在55-80℃之间,Tm值曲线以选取72度附近为佳,5'到 3

引物设计的引物设计原则

1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。2、G十C含量:应在40%一60%之间,PCR扩增中的复性温度一般较Tm值低等于引物的Tm值减去5—10度。引物长度小于20时,

Fluidigm和Genomenon合作开发基因组面板设计服务

   分析测试百科网讯 2018年6月7日,Fluidigm宣布已与Genomenon达成共同营销协议,为翻译和临床疾病研究人员提供基于证据的基因组面板设计服务。   根据合作伙伴的说法,研究人员将能够利用Fluidigm的自动微流控系统加快设计针对疾病的新一代测序,基因分型和实时PCR板。

黄瓜变异组研究奠定全基因组设计育种基础

  中国农业科学院蔬菜花卉研究所领导的国际黄瓜变异组研究团队,对115个黄瓜品系进行深度重测序,构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。相关成果10月20日在线发表于《自然·遗传学》杂志。   据国际黄瓜基因组计划首