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开发出非标记液滴单细胞微生物生长表型筛选技术

微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤。精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了低成本、非标记的微型液滴微流控平台。该平台可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤完成单细胞水平的微生物生长表型筛选,并在大肠杆菌中示范该方法的准确度和可靠性,为工业菌株的快速筛选提供了有力手段。相关研究成果发表在《传感器和执行器B:化学》(Sensors and Actuators B: Chemical)上。 优质菌株的选育需满足“长得快”和“产量高”两个特征。传统的宏观体系通过测量生物量和产物浓度等指标获取生长和代谢表型特征,但通量低且难以真实反映菌株状态。单细胞水平的微生物表型筛选能够精确评估微生物生长状态和代谢特征,进而实现优势菌株选育。目前,单细胞水平的高通量表型筛选仅限于代谢表型,如通过荧光激活液......阅读全文

开发出非标记液滴单细胞微生物生长表型筛选技术

  微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤。精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了低成本、非标记的微型液滴微流控平台。该平台可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤完成单细胞

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测...

利用表型组学辅助筛选技术开发高效植物育种表型预测因子2019年7月,Plant Phenomics刊发了由来自美国爱荷华州立大学(Iowa State University)的Kyle Parmley等人撰写的题为Development of Optimized Phenomic Predi

中科院青岛能源所开发微型液滴微流控平台

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498099.shtm微生物生长表型筛选是工业育种、酶定向进化和合成生物学等领域面临的限速步骤,精准的单细胞精度生长表型测量是突破上述瓶颈的关键。近日,中科院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心开发了一种低成

微生物所开发新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用

  微生物所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国

青岛能源所开发新技术助力工业菌株快速筛选

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498816.shtm近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所(以下简称“青岛能源所”)单细胞中心开发一种低成本、非标记的微型液滴微流控平台,可通过单细胞微液滴培养、液滴自荧光检测、目标微液滴自动分选等步骤

利用细胞的功能和小鼠的表型筛选

利用细胞的功能筛选 与典型的受体-配体成键化验相比, 使用细胞的功能筛选有几个优点. 它可以识别拮抗肌和主缩肌的不同成键方式, 这通过测键能是分不开的. 同时, 在多步信号传递中有能筛选大量靶蛋白的优点. 由于有关于细胞的化合物吸收, 新陈代谢, 排泄, 以及细胞毒素等的信息, 可以忽略体外筛选

利用细胞的功能和小鼠的表型筛选

利用细胞的功能筛选与典型的受体-配体成键化验相比, 使用细胞的功能筛选有几个优点. 它可以识别拮抗肌和主缩肌的不同成键方式, 这通过测键能是分不开的. 同时, 在多步信号传递中有能筛选大量靶蛋白的优点. 由于有关于细胞的化合物吸收, 新陈代谢, 排泄, 以及细胞毒素等的信息, 可以忽略体外筛

植物育种表型筛选技术方案与案例分享

表型筛选是在植物育种过程中将植物表现的优良性状筛选出来,并最终能够固定在植株上,从而培育出优良的品种。标准的生化检测技术,如分光光度法或高效液相色谱,已被用于植物育种过程中的表型筛选。这些方法结果准确,但它们具有破坏性、耗时、劳动密集且繁琐、成本高,并且不能满足大规模筛选程序的需要。植物育种过程需要

单细胞拉曼结合重水标记技术实现土壤解磷微生物筛选

  磷是一种至关重要但不可再生的资源。磷肥是作物生长必须三大营养元素(氮、磷、钾)之一,但磷矿是有限资源,据估计,以目前的磷矿储备,大概还能继续开采100年,因此,磷又被称为“正在消失的元素”。随着长期大量的磷肥施用,土壤中积累了大量固定态磷,大大降低了磷素的生物有效性,加剧了磷资源短缺的问题,对土

PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素...

PlantScreen表型助力转录组水平amiRNA筛选鉴定拟南芥激素运输功能基因研究信号分子的运输在调节植物生长、发育和环境应答方面起到非常重要的作用。最显著的例子就是植物激素的空间分布控制植物发育模式。以色列特拉维夫大学Eilon Shani研究团队使用amiRNA进行转录组多目标正向遗传筛

新型微流控界面纳升注射技术还可以这么拓展应用?

  中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国

开发新型微滴反应筛选技术并开展单细胞分析应用

  中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的微流控界面纳升注射技术(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。针对这一技术创新,团队申请了多项中国

微生物鉴定与细胞表型芯片分析系统

  微生物鉴定与细胞表型芯片分析系统是一种用于基础医学、临床医学、预防医学与公共卫生学领域的分析仪器,于2013年7月23日启用。  技术指标  鉴定板使用96孔鉴定板,GN和GP细菌可实现在一块鉴定板上完成鉴定;加样操作:由系统自带的八道电动排枪内置程序完成;鉴定符合率:采用动态数据库,符合率≥8

怎样从土壤中筛选微生物

原理: 目前尚无一种培养基可以养出所有的微生物,但我们可以设计一种培养基,其组成份适合所要分离的微生物,而不利其他微生物的生长,如此一来,即使我们想分离的微生物为数不多,也可以将它们分离出来,这就是选择性培养基。本实验就是使用选择性培养基来分离土壤微生物,并计数它们的数量以及观察在不同的选择性培养基

日本培养出单细胞微生物

  英国《自然》杂志17日发表一项最新研究:日本科学家团队经过十年探索,终于利用深海沉积物培养出一种神秘单细胞微生物,研究团队随后对其进行了表征。这种不同寻常的微生物,将帮助人类揭示复杂的真核生物的起源。   古菌构成了一个单细胞原核生物域,新近发现的阿斯加德古菌,据信为更加复杂的真核生物的

单细胞蛋白质的微生物

  生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。  糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。  正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。  甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。  甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为甲醇利用菌

Science特刊论述如何利用单细胞等技术解析基因型与表型

  人类细胞内的DNA,即我们熟知的基因型,为指导一系列机体的构建过程提供了蓝图。虽然我们常常认为人类基因组是稳定的,但不同个体之间仍存在着诸多差异。人类可观察到的表型由多个性状组成,这些性状则由单基因组中的许多遗传变异所引起。毛发、瞳孔及皮肤颜色,身高,体型和行为都代表着这些多基因性状。但许多这些

单细胞DNA测序揭示微生物“暗物质”

  据《自然》杂志网站7月14日(北京时间7月15日)报道,天文学家们认为,宇宙总物质量的23%由弥漫于其间且肉眼看不见的“暗物质”组成;现在,美国科学家进行了微生物“暗物质”研究,他们用单细胞DNA测序技术对多种微生物的基因组进行测序后发现,微生物远比我们所知道的要丰富多样,研究同时揭示了不同物种

微观世界的追光者

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503168.shtm仰望夜空,闪闪的星辰让人心驰神往,在生命科学领域,瀚如星海的细胞世界更是科学家们孜孜不倦的追求。中国科学院青岛生物能源与过程研究所研究员、单细胞中心主任徐健便是万千“追星”科学家中的一

单细胞蛋白质的微生物及用途

  微生物  生产单细胞蛋白质的微生物种类很多,有酵母菌、细菌、霉菌和担子菌等。  糖质原料:酵母属和假丝酵母属为主要生产菌。  正烷烃:假丝酵母为最主要利用菌。  甲烷:能利用甲烷作为唯一碳源的微生物,主要是细菌,如甲烷假单胞菌等。  甲醇:主要以细菌为主,放线菌、酵母菌和霉菌次之。甲烷利用菌也为

Science-Advances:我国科研人员研发高通量流式拉曼分选仪

  单细胞拉曼光谱(SCRS)能非标记、非侵入性、无损、全景式地揭示细胞代谢状态,因此基于拉曼光谱的单细胞分选(Raman-Activated Cell Sorting,RACS),在单细胞研究中有广阔的应用前景(Biotechnol Adv,2019)。但是,拉曼谱图采集时间长、分选通量低等问题,

植物表型成像系统植物表型和植物表型组学的概念

  植物表型分析是理解植物基因功能及环境效应的关键环节,随着植物功能基因组学和作物分子育种研究的深入,传统的表型观测已经成为制约其发展的主要瓶颈,而高通量的植物表型组分析技术和植物表型组学研究是解决这一困境的有效途径。虽然植物表型组分析正在成为国内外研究的热点,相关概念仍然较为模糊,阻碍了这一新兴学

诱变育种应注意的问题有哪些?

  (1)挑选优良的出发菌株 出发菌株就是用于育种的原始菌株。出发菌株适合,育种工作效率就高。参考以下实际经验选用出发菌株:①以单倍体纯种为出发菌株,可排除异核体和异质体的影响;②采用具有优良性状的菌株,如生长速度快、营养要求低以及产孢子早而多的菌株;③选择对诱变剂敏感的菌株。由于有些菌株在发生某一

工业微生物产生菌的分离筛选(二)

富集(enrichment)培养是在目的微生物含量较少时,根据微生物的生理特点,设计一种选择性培养基,创造有利的生长条件,使目的微生物在最适的环境下迅速地生长繁殖,数量增加,由原来自然条件下的劣势种变成人工环境下的优势种,以利分离到所需要的菌株.富集培养主要根据微生物的碳、氮源、pH、温度、需氧等生

工业微生物产生菌的分离筛选(1

菌株分离(separation)就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选,进而得到所需微生物的过程。菌株分离、筛选(screening)虽为两个环节,但却不能绝然分开,因为分离中的一些措施本身就具有筛选作用。工业微生

工业微生物产生菌的分离筛选(二)

    富集(enrichment)培养是在目的微生物含量较少时,根据微生物的生理特点,设计一种选择性培养基,创造有利的生长条件,使目的微生物在最适的环境下迅速地生长繁殖,数量增加,由原来自然条件下的劣势种变成人工环境下的优势种,以利分离到所需要的菌株.富集培养主要根据微生物的碳、氮源、pH、温

工业微生物产生菌的分离筛选(一)

菌株分离(separation)就是将一个混杂着各种微生物的样品通过分离技术区分开,并按照实际要求和菌株的特性采取迅速、准确、有效的方法对他们进行分离、筛选,进而得到所需微生物的过程.菌株分离、筛选(screening)虽为两个环节,但却不能绝然分开,因为分离中的一些措施本身就具有筛选作用.工业微生

工业微生物产生菌的分离筛选(2)

第二节   含微生物样品的富集培养富集(enrichment)培养是在目的微生物含量较少时,根据微生物的生理特点,设计一种选择性培养基,创造有利的生长条件,使目的微生物在最适的环境下迅速地生长繁殖,数量增加,由原来自然条件下的劣势种变成人工环境下的优势种,以利分离到所需要的菌株。富集培养主要根据微生

工业微生物产生菌的分离筛选(3)

第三节   微生物的分离经富集培养以后的样品,目的微生物得到增殖,占了优势,其他种类的微生物在数量上相对减少,但并未死亡。富集后的培养液中仍然有多种微生物混杂在一起,即使占了优势的一类微生物中,也并非纯种。例如同样一群以油脂为碳源的脂肪酶产生菌,有的是细菌,有的是霉菌,有的是芽孢杆菌,有的不产芽孢,

工业微生物产生菌的分离筛选(4)

 二、通过控制培养和培养条件进行分离各种微生物对营养要求和培养条件是不同的,在分离筛选时若在这两个方面加以调节控制,就能获得更好的分离效果。1.培养基的营养成分各种微生物对碳源、氮源要求各异,有的对营养还有特殊的要求,事先了解被分离微生物的营养要求,从而设计一个合理快速的分离培养基,能够收到事半功倍