蛋白组学入门问题酶解篇
蛋白组学入门问题-转自上海生科院 酶解篇1. 用 Trypsin 酶解蛋白质时，碳酸氢氨的浓度应该是多少？ 酶解时碳酸氢氨的浓度一般在 10 ～ 50 mM 之间。碳酸氢氨的作用主要是提供一个碱性的水解环境，因为 Typsin 的活力在 pH8 ～ 9 之间最高。最常用的碳酸氢氨浓度有 20 mM ， 40 mM 。盐浓度过大时，后续的冻干过程中会有较多的盐析出；盐浓度过小时，则不能有效的提供碱性 pH 的水解环境（尤其是在样品的 pH 值低，而且体积大时）。为了确定酶解体系的 pH 值，可以用 2. Trypsin 储存液的作用是什么？ Trypsin 在 pH8 ～ 9 活力最高，所以为了防止酶的自水解， Trypsin 母液要处于一个酸性的环境里以便长期保存。 Trypsin 储存液的 pH 大约是 5.3 ，是用来稀释母液用的。如果所需的酶量较大，可以直接用碳酸氢氨溶液来稀释母液。如果酶解的样品少，可以用储存液来稀释，......阅读全文
植物园生物酶解提高酱渣蛋白质功能特性研究取得进展
油是中国和多个亚洲国家日常饮食中常用的传统调味品，年消费量巨大。大豆发酵制备酱油的主要副产物为酱渣，占到加工产量的10%左右，目前主要用于饲料加工，市场价值极其低廉。酱渣是丰富的植物蛋白质来源，蛋白质含量约占到酱渣总质量的20%。目前，这部分蛋白质因功能特性极差而难以得到有效利用。对这部分蛋白质
纤维素酶能否酶解纤维素
成熟棉纤维的主要成分是纤维素，纤维素是天然高分子化合物，由葡萄糖分子按β-1，4糖苷键连接而成。棉纤维中大分子的排列比较复杂，纤维内某些区域由于大分子的横向吸引使大分子排列比较整齐密实，缝隙孔洞较少，这称为结晶区。相反，另一些区域大分子排列比较紊乱，堆砌比较疏松，其中有较多的缝隙孔洞，密度较低，这称
蛋白质质谱鉴定技术概述及常见问题解决方法
蛋白质（Protein）是生物体中含量最高，功能最重要的生物大分子，存在于所有生物细胞，作为生命的物质基础之一，蛋白质在催化生命体内各种反应进行、调节代谢、抵御外来物质入侵及控制遗传信息等方面都起着至关重要的作用，因此蛋白质也是生命科学中极为重要的研究对象。 现代研究结果发现越来越多的多肽
“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术
1999年，Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun)，其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物，然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索，从而确定蛋白质的种类，可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称
质谱法进行高通量蛋白鉴定的主要方法
蛋白质组（Proteome）指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定，可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析（如Edman降解法）费时费力、通量低，存在不容
质谱法进行高通量蛋白鉴定的主要方法介绍
蛋白质组（Proteome）指由一个基因组或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱鉴定，可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。传统的方法如蛋白质微量测序、氨基酸组成分析（如Edman降解法）费时费力、通量低，存
磷酸化蛋白质组鉴定技术路线及经典案例介绍
今天，小编跟您聊聊磷酸化蛋白质组鉴定！ 蛋白质翻译后修饰（PTMs）几乎参与了细胞所有正常生命活动的过程，并发挥十分重要的调控作用。蛋白修饰已经成为国际上蛋白质研究的一个极其重要的领域，目前研究比较成熟的有磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。 蛋白质磷酸化是生物体中最常见、最重要的
酶解河蚌肉的嫩度测定
河蚌是我国常见的一种淡水软体动物，其营养丰富，含蛋白质56%，其中必需氨基酸模式相对较合理，可以作为一种蛋白源为人类提供营养。据现有研究可知，河蚌肉有清热解毒、明目利湿、化痰去赤眼、收敛生肌之功效。由于河蚌肉的裙边肉质紧密，常规的煮制工艺加工出的河蚌肉制品韧性过高、咀嚼性差。采用合适的蛋白酶对其加以
生物酶解技术的材料介绍
酶是催化特定化学反应的蛋白质、RNA或其复合体，是生物催化剂，能通过降低反应的活化能加快反应速度，但不改变反应的平衡点。绝大多数酶的化学本质是蛋白质。具有催化效率高、专一性强、作用条件温和等特点。酶是二级学科，应用于生物化学与分子生物学一级学科。 酶（enzyme），早期是指in yeast
蛋白质组学鉴定技术流程
蛋白质组（Proteome）的概念，蕞早由澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams于1994年首先提出的，是指一个基因组（Genome），或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质组学（Proteomics）以细胞、组织或生物体全体蛋白质为研究对象，通过高通量的色谱质谱联用技术
磷酸化蛋白质组学研究获进展
中科院大连化物所生物技术部1809组封顺、叶明亮、邹汉法等人关于新型金属离子固定化亲和色谱固定相应用于磷酸化蛋白质组学的研究成果(Immobilized Zirconium Ion Affinity Chromatography for Specific Enrichment of Phosphop
Proteome软件公司推出MassQC
Proteome 软件公司1月11日推出了基于Web的质谱质量控制工具软件包——MassQC。 MassQC是一个在线质量控制工具，它可帮助你获得更多重现性的LC-MS/MS实验，同时减少你花费在评估仪器性能上的时间。MassQC通过反复检查提高重现性，可对少量的未知蛋白质进行标准测试，无
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（二）
FIGURE 2. Comparison of DDA and DIA raw data. (A) Comparison of MS1 base peak chromatograms. (B) Comparison of zoomedin chromatograms. (C) Composi
Proteome－and－Phosphoproteome－Quantification－by－DIA－on－Orbitrap－（一）
Overview1) Purpose: Data Independent Acquisition (DIA) has been applied for large-scale protein and PTM quantification on the Thermo Scientific ™
蛋白质组质谱新方法一览
2003年人类基因组精细图绘制完成，是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥？因为中心法则告诉我们，基因的产物——蛋白质，是生命活动的最终执行者。与基因组类比，研究生物体内全套蛋白质的科学，就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年，人类蛋白质组计划启动，令人激动
绿茶成分可解蛋白质异常沉积毒性
德国研究显示绿茶成分可解蛋白质异常沉积毒性 德国马克斯·德尔布吕克分子医学中心4月14日报告的一项最新研究成果显示，绿茶中活性物质EGCG(表没食子儿茶素没食子酸酯)可解除与老年痴呆症等疾病有关的蛋白质异常沉积带来的毒性。 研究人员说，β淀粉样蛋白是由蛋白质的错误折叠导致的，它的异常
蛋白酶解的首选变性剂——RapiGest－SF
在生物药肽图分析、蛋白质修饰分析、蛋白质组学研究等诸多工作中，蛋白质的变性与酶解是样品处理的必经之路。RapiGestTM SF正是在这个实验步骤中，用以辅助蛋白酶解的变性试剂[1,2,3]。RapiGest SF有以下优点：■ 综合水相、有机相溶液条件下，最高效的辅助酶解变性剂。■ 作用过程中，不
基于液质联用的单细胞蛋白质组学研究进展
摘要 蛋白质是细胞功能的主要执行者，由于其无法在体外进行扩增，单细胞蛋白质组学技术相较单细胞基因组学和转录组学技术而言发展相对滞后。传统的蛋白质组学技术可获得大量细胞蛋白表达的平均值，但忽略了细胞亚型及细胞异质性等信息。单细胞水平的蛋白质分析有助于阐明细胞不同表型与异质性的分子基础。随着质谱仪
以酶治污－解皮革行业后“固”之忧
“肉渣固废的酶解利用技术在我们公司的小试应用，已经获得了含有脂肪酸和甘油的酶解液；下一步计划重新寻求方向，比如可不可以回收肉渣中的蛋白进行利用……”不久前，河北省辛集市梅花皮业有限公司（以下简称“梅花公司”）企管部经理罗恒一给河北省微生物研究所研究室主任郑翔打电话，专门就肉渣固废中蛋白质的提取及
生物酶解技术的应用范围介绍
生物酶解技术是以食品科学与营养系食品科学研发的，是国内现代生物活性物质提取的先进生物技术。 生物酶解技术应用于人类健康、农业、工业与环境，在其它领域也有一些应用，应用范围广阔。在人类健康领域的应用最多，已经成功形成生产力用于人类健康工程。生物酶解技术的基础学科依据是通过酶的作用使物质得到充分分
生物酶解技术的原理是什么
生物酶解技术，就是利用生物酶催化的酶促反应所具有高度专一性的特点，选择相应的酶（通常是水解酶），将聚合物形式的生物大分子分解为其组成成分单体的技术。生物酶解技术具有反应单一、反应条件温和、反应效率高、不存在或极少存在逆反应的优点。
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗
蛋白质组鉴定技术
如果目前分离蛋白质组的最好技术是2-DE，那么随之而来的挑战是数百数千个蛋白如何被鉴定. 在这里，我们不考虑传统的蛋白鉴定方法，如免疫印迹法、内肽的化学测序、已知或未知蛋白的comigration分析，或者在一个有机体中有意义的基因的过表达. 并不是因为这些方法无效，而是因为它们通常耗时、耗力，不
蛋白质组是什么
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(genOME)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组的概念
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(Genome)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个
蛋白质组服务介绍
基因是生物体的基本遗传单位。然而，基因本身并不能直接行使功能，其功能的发挥最终需要通过表达出的蛋白质体现出来。蛋白质是细胞所有功能的主要执行者，其功能的发挥决定了人体健康与疾病的各种状态。蛋白质组是在宏观的角度全面、系统地解析蛋白质状态与功能的科学，是“后基因组”时代的核心研究内容。蛋白质组是比基因
蛋白质组研究系统
4700 TOF/TOF蛋白质组分析系统4700TOF/TOF蛋白质组分析系统是全球第一台TOF/TOF 串联飞行质谱仪，它作为目前的最新质谱技术，它一问世即被世界各大蛋白组研究中心和著名蛋白质实验室所争相采用。它由两级TOF和高能碰撞池组成，其工作原理是离子在MALDI源中产生并被加速和聚焦；对于
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...（一）
创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析摘要 数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。本研究基于静电场轨道阱Q-qIT-OT 三