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《植物学报》英文版基因信息被TAIR数据库收录

《植物学报》英文版(Journal of Integrative Plant Biology,JIPB)已和国际最完善的物种基因功能数据库TAIR建立正式合作关系,TAIR将于2010年5月开始收录发表于JIPB的所有关于拟南芥的基因数据(含过刊)。今后,读者将可以直接从TAIR点击发表于该刊的所有拟南芥的基因功能数据。 拟南芥是植物研究重要的模式生物。TAIR是英文The Arabidopsis Information Resource的缩写,是位于美国斯坦福大学的拟南芥信息资源网,提供最为权威的拟南芥基因组注释,从中可查阅拟南芥基因组中所有的2万6千个基因的最新功能信息,囊括了包括全基因组序列、基因结构、表达、翻译、代谢途径、T-DNA敲除突变体、分子标记和已发表文章等海量信息。 TAIR是从事模式植物拟南芥研究的国内外科研人员的最重要的参考网站,在业内具有广泛的影响。加入TAIR,必将进一步扩大JIPB在......阅读全文

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

云序生物最新“RNA 甲基化”研究汇总-拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

云序生物最新“RNA 甲基化”研究汇总-拟南芥篇

  关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育期,

“RNA 甲基化”研究汇总——拟南芥篇

关于RNA甲基化修饰的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上频频亮相,并一次次刷新人们对生命科学的认知。拟南芥作为植物界中研究RNA甲基化修饰的先行者,许多学者将它作为研究对象,并与最新m6A、m5C RNA甲基化测序技术结合,证实到RNA甲基化广泛存在于拟南芥各个发育

拟南芥基因研究显示:环境对遗传多样性影响巨大

一项针对多种拟南芥的基因研究表明,环境因素对物种遗传多样性和基因组的影响比之前人们预期的更大。相关论文发表在7月20日的《科学》杂志上。 除了实验室中科学家的“最爱”,世界各地还分布着多种野生拟南芥。它们的生长速度、叶子颜色以及发枝方式都是不同的。在最新的研究中,由德国马普发育生物学研究所

Science:揭示一种促进被子植物种间遗传隔离的分子机制

  2019年5月31日,北京大学生命科学学院、北大-清华生命科学联合中心瞿礼嘉教授课题组的研究论文“Cysteine-rich peptides promote interspecific genetic isolation in Arabidopsis”以长文形式在线发表在国际著名期刊Scien

农杆菌介导转化拟南芥

实验概要1. 学习真核生物的转基因技术及农杆菌介导的转化原理。2. 掌握农杆菌介导转化拟南芥 的实验方法,了解拟南芥的生理特点及在基因工程实验中应用实验原理拟南芥(Arabidopsis thaliana)是一种十字花科植物,二年生草本,高7~40厘米,花期3~5月。广泛用于植物遗传学、发育生物学和

促进被子植物种间遗传隔离的机制研究取得重要进展

  物种之间的遗传隔离是维持一个物种不与其他物种混杂的关键,有多种因素可以导致物种间的遗传隔离。160年前,英国博物学家达尔文用实验验证了一种植物的花粉在与其他物种花粉的竞争中“胜出”的现象,即后来称为“同种花粉优先”的现象。这种现象非常重要,维护了物种的纯系遗传。然而,在过去的一个多世纪中,人们对

促进被子植物种间遗传隔离的机制研究取得重要进展

  物种之间的遗传隔离是维持一个物种不与其他物种混杂的关键,有多种因素可以导致物种间的遗传隔离。160年前,英国博物学家达尔文用实验验证了一种植物的花粉在与其他物种花粉的竞争中“胜出”的现象,即后来称为“同种花粉优先”的现象。这种现象非常重要,维护了物种的纯系遗传。然而,在过去的一个多世纪中,人们对

2006年中国植物科学若干领域重要研究进展

4  光合作用与碳循环 光系统Ⅱ (PSⅡ)是叶绿体类囊体膜中的一个色素蛋白复合体,在光合作用 光反应过程中起重要作用。为了阐明 PSⅡ 的组装过程,中国科学院植物研究所张立新研究组对 PSⅡ 低 含量的拟南芥突变体(lpa1)进行了研究。结果表明,体外蛋白质标记实验显示 lpa1

不同植物SBP-box基因家族的比较分析

实验概要本研究利用生物信息学资源和工具,对双子叶和单子叶模式生物拟南芥和水稻中的SBP-box基因家族进行了比较分析。利用两个物种的SBP-box基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树。在系统发生树的末端节点上鉴定出12对旁系同源基因。利用非同义替换率与同义替换率(KalKs)分析了同源基因分离之后所

昆明植物所揭示植物春化现象的分子调控机制

  春化(vernalization)是指一、二年生种子作物在苗期需要经受一段低温处理,才能开花结实的现象。冬性草本植物(如冬小麦)一般于秋季萌发,经过一段营养生长后度过寒冬,于第二年夏初开花结实,这是因为冬性植物需要经历一定时间的低温才能形成花芽。春化也是植物适应性进化的结果。生长在低纬度地区的拟

我国学者研究发现拟南芥为油菜育种开辟新路径

  对于油菜种植者来说,收获油菜种子是他们一年的辛劳获得回报的时刻。然而由于油菜果荚的开裂,他们实际收获的种子往往达不到预期产量。他们更担心收收获时遇到反常气候,因为极端气候变化会导致果荚过早开裂,进一步降低种子产量,从而影响经济收入。因此,他们更倾向于选择抗开裂的油菜品种,这也对于油菜育种家提出了

基于LED光源的科研级植物培养方案(五)

植物培养是生物实验室最重要的常规基础实验之一。以前的研究中,只要求培养系统能够使种子萌发、基本满足植物的生长即可。但在真正严格的植物生理生态研究中,传统培养箱由于种种原因是远远不能达到要求的。本文将系统介绍一系列基于LED光源的科研级植物培养方案,包括SL3500植物培养LED光源、FytoScop

lncRNA在农业领域的研究成果

  miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar --没想到在农业上大展身手啦   你没看错!不是标题党。说到miRNA的好Homie,非编码RNA界的NewStar,想必聪明博学的你就已经猜到了是lncRNA。今天大阅哥要给大家挖一挖lncRNA在农业上的研究进展。为了写这篇主题

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

Nature子刊:什么基因决定了种子休眠

  生物活性赤霉素(GAs或二萜)是陆地植物中的必需激素,其控制植物生长和发育的许多方面。在开花植物中,13-OH GAs(具有低生物活性-例如GA1)和13-H GAs(具有高生物活性-例如GA4)经常在同一植物中共存。然而,天然拟南芥13-羟化酶GA的特性及其生理功能仍然未知。  2019年9月

OsAGAP在拟南芥中的功能分析

实验概要本实验对水稻小G蛋白ArfGTPase激活蛋白OsA GAP在拟南芥中的功能进行了分析,首先构建了OsAGAP在拟南芥中的正义表达载体,利用农杆菌介导的真空抽滤法转化拟南芥,筛选拟南芥阳性苗,然后用组织PCR和 Southern杂交做了检测。实验材料1. 所用拟南芥((Arabidopsis

有关TILLING技术介绍及相关的文献下载

TILLING 技术是于上个世纪 90年代末期,美国 Fred Hutchinson癌症研究中心基础科学研究所的 Steven Henikoff领导的研究小组发展起来的( 1)。目前, TILLING技术作为种研究方法已经应用于多种生物中,如拟南芥、玉米、水稻、百脉根、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫等。对

乙烯和脱落酸对HrpNEa诱导拟南芥抗蚜与抗旱的对比实验

实验概要本研究描述了脱落酸(abscisic acid,ABA)和乙烯在HrpNEa诱导下不同情形各自的作用。实验原理HrpNEa是植物病原细菌E. amylovora产生的一种多效型蛋白,用其处理拟南芥能激发脱落酸和乙烯信号介导的抗旱和抗虫过程。ABA和乙烯两种激素都参与了种子萌发和根生长,但在植

中国科学家主导完成盐芥基因组研究

  由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541

南京大学栾升教授权威期刊连发新研究成果

   现任职于加州大学伯克利分校及南京大学的栾升(Sheng Luan)教授,主要研究方向是利用拟南芥和水稻作为模式材料探讨逆境条件下植物如何进行生长发育的分子机制,侧重于挖掘植物对光、干旱、高盐、营养缺乏等非生物胁迫的防御反应中的关键基因,阐明基因的作用机理及其功能,并力图建立植物应答胁迫的信号传

我国首次在天宫二号完成植物生长全过程实验

   我国首次在天宫二号完成植物生长全过程实验 在中科院植物生理生态研究所实验室里拍摄的拟南芥,用于与天宫二号上种植的同一品种拟南芥进行对比研究。天宫二号在轨运行两年多来,开展了众多空间科学和应用实验,其中包括完成我国首次高等植物“从种子到种子”的空间长周期培养实验,为发展空间植物培养技术、探索保障

Cystatin基因家族的生物信息学分析

实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用,在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因

远红光在波动光的弱光阶段加速光合作用

2019年10月16日,Plant and CellPhysiology杂志在线发表日本东京大学理学院生物科学系Masaru Kono的最新研究成果文章:远红光在波动光的弱光阶段加速光合作用(Far-Red Light Accelerates Photosynthesis in the Low-Li

实验室“标配”拟南芥研磨提取核酸引发的讨论

给大家分享的内容是——拟南芥研磨提取核酸。那接下来,就让我们先睹为快,看看这个案例的情况。 实验:拟南芥研磨提取核酸 实验地点:某大学 实验样品:拟南芥 实验步骤:1、在2ml圆底离心管底放入拟南芥样品,每管样品量不超过单管体积的1/3; 2、在离心

水稻WRKY基因家族成员功能研究取得阶段性进展

  植物在权衡生长投入和抗逆消耗的过程中存在精细的分子调控机制,其中较为普遍的是通过改变转录调控因子的表达来影响下游功能蛋白的活性进而建立新的代谢平衡。WRKY家族是一类典型的编码转录调控因子的基因家族,在拟南芥和水稻中分别拥有七十多和一百一十多个成员,已报道的WRKY基因功能广泛地涉及植物与病原微

实验室“标配”拟南芥研磨提取核酸引发的讨论

给大家分享的内容是——拟南芥研磨提取核酸。那接下来,就让我们先睹为快,看看这个案例的情况。实验:拟南芥研磨提取核酸实验地点:某大学实验样品:拟南芥实验仪器:TL2020高通量组织研磨仪实验步骤:1、在2ml圆底离心管底放入拟南芥样品,每管样品量不超过单管体积的1/3;2、在离心管中加入3mm硬质不锈

中国科学家主导完成盐芥基因组研究

  由中科院遗传与发育生物学研究所、深圳华大基因研究院等多家单位共同完成的盐芥(Thellungiella salsuginea)基因组研究成果在《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表(http://www.pnas.org/content/early/2012/07/05/12099541

生命科学研究中常见模式生物简介(一)

模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有有真菌中的酵母,原核生物中的大肠杆菌,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑马鱼,哺乳纲的