随着CRISPR-Cas9技术平台在各个研究领域中的扩展,相信生物行业的很多人都熟悉了CRISPR,Cas9这些名词,但对于III型CRISPR-Cas系统、RT-Cas1、CRISPR样系统(MIMIVIRE)这些新词语,大家了解吗?
近期Nature,Science,Cell三大著名期刊分别发表了CRISPR的新成果,不仅发现了一些新型CRISPR系统,为改进原有系统提出了新建议,而且也有助于CRISPR系统在临床上的应用迈进新的一步。
Science杂志上,来自德克萨斯大学奥斯汀分校、斯坦福大学医学院和其他两家研究机构的科学家们首次发现细菌能够捕获来自诸如病毒之类的入侵者的RNA片段,并且将这种RNA片段整合到它们自己的基因组中。这些RNA片段有助细菌在未来识别和破坏危险的病毒。
研究人员指出细菌具有一个可以识别及破坏危险病毒的系统,系统利用了涉及核糖核酸(RNA)的一种新机制。它与捕获外源DNA的CRISPR/Cas系统非常相似。这一研究发现有可能促成一些更好的方法来阻止杀死农作物及阻碍奶酪和酸奶等乳制品生成的病毒。
Cell杂志上,来自东京大学、麻省理工学院与哈佛大学Broad研究所的研究人员揭示出了新凶手弗朗西丝菌Cas9(FnCas9)的结构,并利用这一结构信息对FnCas9进行改造构建出了一个变异体。
研究人员获得了FnCas9–sgRNA–靶DNA复合物的晶体结构,分辨率达到1.7 埃(Å)。通过比较FnCas9和其他Cas9直系同源物SpCas9 与SaCas9,揭示出了亲缘关系遥远的CRISPR-Cas9系统之间的保守特征及惊人的结构差异。他们发现FnCas9识别的是5′-NGG-3′ PAM,并利用这一结构信息构建出了一个识别5′-YG-3′ PAM的Cas9异构体。
Nature杂志上,研究人员在巨型拟菌病毒(mimiviruses)中也发现了与细菌和其他微生物采用的CRISPR系统相似的防御系统来抵御入侵者。
研究人员认为这种MIMIVIRE病毒防御系统,就像解开CRISPR免疫的运作机制促成了其改变用途成为一种基因组编辑工具一样,也将能找到一些新应用。也许是在基因组编辑,也许是在其他的领域。
此外Nature Biotechnology也公布了一项完全无需外源DNA的CRISPR技术,来自韩国的研究人员通过在植物外组装Cas9酶和它的导向RNA序列,并利用溶液,可使生成的蛋白质复合物进入到植物中。这一技术能够有效发挥作用敲除烟草、水稻、莴苣和拟南芥中的所选基因。 这一改良的CRISPR技术被认为是一种很好的方法来规避某些可能的批评。
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