(1)上行感染：为最常见的感染途径。在机体抵抗力下降或尿路黏膜损伤(如尿液高度浓缩、月经期间、性生活后等)时，或入侵细菌的毒力大、黏附于尿路黏膜并上行传播的能力强时，尿道口及其周围的细菌即容易侵袭尿路而导致肾盂肾炎。由于女性的尿道远较男性短而宽，且尿道口离肛门近而常被粪便细菌污染，故更易致病。细菌沿尿路上行首先进入肾盂肾盏引起炎症，然后经肾盂、乳头部、肾小管上行到达肾实质。
(2)血行感染：较少见。在机体免疫功能低下或某些促发因素下，体内慢性感染病灶(如扁桃体炎、鼻窦炎、龋齿或皮肤感染等)的细菌乘机侵入血液循环到达肾引起肾盂肾炎。血行感染时，细菌首先到达肾皮质，并在该处形成多灶小脓肿，然后沿肾小管向下扩散到肾乳头和肾盂、肾盂黏膜，但炎症也可从肾乳头部有轻微损伤的乳头集合管(如尿液的结晶损伤等)开始，然后再向上、下扩散。
(3)淋巴管感染：更为少见。认为下腹部和盆腔器官的淋巴管与肾周围的淋巴管有多数交通支，在升结肠与右肾之间也有淋巴管沟通，因而当盆腔器官炎症、阑尾炎和结肠炎时，细菌可经淋巴管引起肾盂肾炎。
(4)直接感染：外伤或肾周器官发生感染时，该处细菌可直接侵入肾引起感染。
