利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究或成可能

　　近日，中国科学院生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述，全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用。

　　随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加，如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能，发展基于或靶向RNA的新疗法，成为了当前研究的热点。相关分子标尺技术的应用不仅可更准确地理解黄病毒RNA的构象动态变化，为病毒性疾病的治疗提供新的靶点和策略，也有望推动RNA纳米技术的发展，为未来的生物医学研究提供更多可能性。

　　RNA分子因其固有的柔性和构象动态，一直以来都是结构生物学研究中的难点。传统的结构解析技术，如X射线晶体学、核磁共振（NMR）和冷冻电镜，虽然在解析蛋白质结构方面取得了显著进展，但在解析RNA结构和捕捉RNA动态变化方面仍面临巨大挑战。近年来，人们日益认识到，多方法联用、实验数据与计算模拟结合可拓展结构生物学的研究方法和研究思路。

　　该综述介绍了3种互补的分子标尺技术，包括电子顺磁共振（EPR）、X射线散射干涉（XSI）和荧光共振能量转移的基本原理，并展示了如何利用NaM-TPT3非天然碱基对系统对长链RNA进行位点特异性标记的方法，从而实现在纳米尺度上测量RNA分子内和分子间的距离分布。

　　该标记方法克服了传统RNA标记技术对RNA的长度和标记位点的限制，具有反应高效、纯化步骤简便和无需变性条件等优点，使得利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究成为可能。

　　相关论文信息：

　　 https：//doi.org/10.1016/j.sbi.2024.102944