利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究或成可能
近日,中国科学院生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述,全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用。 随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加,如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能,发展基于或靶向RNA的新疗法,成为了当前研究的热点。相关分子标尺技术的应用不仅可更准确地理解黄病毒RNA的构象动态变化,为病毒性疾病的治疗提供新的靶点和策略,也有望推动RNA纳米技术的发展,为未来的生物医学研究提供更多可能性。 RNA分子因其固有的柔性和构象动态,一直以来都是结构生物学研究中的难点。传统的结构解析技术,如X射线晶体学、核磁共振(NMR)和冷冻电镜,虽然在解析蛋白质结构方面取得了显著进展,但在解析RNA结构和捕捉RNA动态变化方面仍面临巨大挑战。近年来,人们日益认识到,多方法联用、实验数据与计算模拟结合可拓展结构生物学的研究方法和研究思路。 该综述介绍了3种互补的分子标尺......阅读全文
人造碱基能像天然碱基参与DNA复制
据物理学家组织网近日报道,新加坡科学家在最新一期《德国应用化学国际版》期刊上发表论文称,他们开发出一种遗传代码扩增技术,并合成出两种能够配对的人造碱基。通过X射线结晶技术分析表明,人造碱基对拥有与天然碱基对几乎完全相同的结构特征。使用新碱基对可以合成全新DNA片段,更好地检测病毒感染情况。
生成式AI设计出非天然蛋白质
加拿大多伦多大学研究人员开发了一种人工智能系统,可以使用生成扩散来创建自然界中不存在的蛋白质。该系统有望使治疗蛋白的设计和测试更加高效和灵活,从而加速人类药物开发。研究发表在最新一期《自然·计算科学》杂志上。 蛋白质由氨基酸链组成,氨基酸链折叠成的三维形状反过来又决定了蛋白质的功能。这些折叠的
利用分子标尺技术对长链RNA的结构和构象动态开展研究或成可能
近日,中国科学院生物物理研究所方显杨课题组在《结构生物学的当前观点》发表综述,全面总结了利用非天然碱基对系统赋能分子标尺技术及其应用。 随着全球对由RNA病毒引起的病毒性疾病的关注度增加,如何通过深入理解这些病毒RNA的结构来调控其功能,发展基于或靶向RNA的新疗法,成为了当前研究的热点。相关
半合成生物体能生成非天然蛋白质
英国《自然》杂志29日发表的一篇论文中,美国斯克里普斯研究所公布了合成生物学最新进展,他们培育了一种既能存储又能检索的人造遗传信息的半合成生物体,其生成非天然改造蛋白质,效率与天然几无差距。该成果将成为人们创造新蛋白质和新功能的平台,但合成生物学目前的快速发展却引发了担忧。 遗传密码由腺嘌呤、
稀有碱基是天然还是人工合成?
又称稀有碱基,这些碱基在核酸分子中含量比较少,但他们是天然存在不是人工合成的,是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如:5-甲基胞苷、5,6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷:假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同,即尿嘧啶5位碳与核苷形成
人造碱基能像天然DNA那样连接
美国印第安纳大学和应用分子进化基金会等机构科学家证明,他们造出的两种人造DNA“字母”Z和P,能像天然DNA那样组合连接在一起,将来有望把这两个新成员纳入到活细胞中。相关论文发表在最近的《美国化学协会会刊》(JACS)上。 合成生物学家一直在竞相研究遗传基本单位的人造版。美国应用分子进化基金
科学家用人工细菌合成非天然蛋白质!
合成生物学家试图创造具有自然界中所没有的形式和功能的新生命。尽管科学家们离制造出完全人工的生命形式还有很长的路要走,但他们已经制造出了半合成的生物体,它们拥有扩展的遗传密码,使它们能够制造出以前从未见过的蛋白质。在一项近日发表在《JACS》上的研究中,研究人员已经优化了一种半合成细菌,可以有效地
分子遗传学词汇碱基插入
中文名称:碱基插入英文名称:base insertion定 义:DNA序列中增加碱基对导致突变。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇碱基缺失
中文名称:碱基缺失英文名称:base deletion定 义:DNA序列中缺少了碱基对导致突变。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇互补碱基
互补碱基,碱基间的一一对应的关系叫做碱基互补配对原则就是Adenine(A,腺嘌呤)一定与Thymine(T,胸腺嘧啶)配对,Guanine(G,鸟嘌呤)一定与Cytosine(C,胞嘧啶)配对,反之亦然。碱基指嘌呤和嘧啶的衍生物,是核酸、核苷、核苷酸的成分。DNA和RNA的主要碱基略有不同,其重要
分子遗传学词汇碱基比
中文名称:碱基比英文名称:base ratio定 义:碱基在核酸分子中的比例。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇碱基置换
中文名称:碱基置换外文名称:substitution定义:碱基置换(substitution)包括两种类型:转换(transition)是由嘌呤置换嘌呤或嘧啶置换嘧啶。颠换(transversion) 是指嘌呤置换嘧啶或嘧啶置换嘌呤。如碱基置换发生于编码多肽的区,则因可影响密码子而使转录、翻译遗传信
分子遗传学词汇碱基配对
中文名称:碱基配对释 义:DNA双螺旋结构和RNA的基础作 用:复制、转录和翻译作用定 义:核酸链间腺嘌呤和尿嘧啶(RNA)或胸腺嘧啶(DNA)以及鸟嘌呤和胞嘧啶的专一氢链结合。分子杂交技术就是根据碱基配对的原理设计的。碱基配对后形成碱基对(basepair,bp
分子遗传学词汇碱基对
中文名:碱基对外文名:Base Pair定义:碱基对,是一对相互匹配的碱基(即A—T, G—C,A—U相互作用)被氢键连接起来。它常被用来衡量DNA和RNA的长度(尽管RNA是单链)。它还与核苷酸互换使用,尽管后者是由一个五碳糖、磷酸和一个碱基组成。
“冷门”密码子编码为非天然蛋白质制造提供新平台
仅仅用20种氨基酸“积木”就排列组合出千千万万种蛋白质,从而演绎出丰富多彩的生命图景,这正是大自然的“造化”。日前,浙江大学生命科学研究院研究员林世贤团队发明了“稀有密码子重编码技术”,尝试让细胞调用20种以外的非天然氨基酸来制造蛋白质。“稀有密码子重编码技术”(RCR)与“基因密码子拓展技术”(G
在蛋白质中加入新的非天然氨基酸,改写遗传密码!
宇宙无垠,生命的可能无穷无尽。在神话故事中,无论是女娲造人,还是上帝创生,都是由一个高等的存在去创造出自然万物。有趣的是,随着人类对遗传进化的认知发展,科学家们也逐渐可以操控一个生物的基因组,使其表达特定基因,行使特定功能。 这些基因水平上的操作,就像是裁缝裁剪布料一样,只能改变样式,而无法从
分子遗传学词汇碱基类似物
中文名称:碱基类似物外文名称:base analog所属分类:化学物质定义:化学结构与核酸的碱基成分类似的化合物。通常指人工合成的,如嘌呤类似物有8-吖鸟嘌呤,6-巯基嘌呤,二氨基嘌呤;嘧啶类似物有5-溴尿嘧啶,5-氟尿嘧啶等。多数作为碱基、核苷、核苷酸的代谢颉颃物质而起作用,对核酸的合成起阻碍作用
分子遗传学词汇碱基类似物
中文名称:碱基类似物外文名称:base analog所属分类:化学物质定义:化学结构与核酸的碱基成分类似的化合物。通常指人工合成的,如嘌呤类似物有8-吖鸟嘌呤,6-巯基嘌呤,二氨基嘌呤;嘧啶类似物有5-溴尿嘧啶,5-氟尿嘧啶等。多数作为碱基、核苷、核苷酸的代谢颉颃物质而起作用,对核酸的合成起阻碍作用
DNA分子杂交技术的原理碱基互补配对
怎么看出来是否杂交上,这个是要在探针上做标记(标记可以有很多种,生物的、荧光的、放射性的等等),杂交后是要洗脱的,只有这种特异性的杂交才被保留下来,再通过检测探针上的标记来看出是否杂交上。比如上面的“钥匙”,就像你用一串的“钥匙”去试,但你可以先在要的那个“钥匙”上做个标记,你不需要认识“钥匙”
非沃森克里克碱基配对的定义
中文名称非沃森-克里克碱基配对英文名称non-Watson-Crick base-pairing定 义与标准的G与C和A与T(或A与U)不同的碱基配对方式。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
非极性分子的判断
化合价法组成为ABn型化合物,若中心原子A的化合价等于族的序数,则该化合物为非极性分子。如:CH4、CCl4、SO3、PCl5等。受力分析法若已知键角(或空间结构),可进行受力分析,合力为0者为非极性分子。如:CO2、C2H4、BF3等。同种原子组成的双原子分子都是非极性分子。不是非极性分子的就是极
细胞化学词汇非沃森克里克碱基配对
中文名称:非沃森-克里克碱基配对英文名称:non-Watson-Crick base-pairing定 义:与标准的G与C和A与T(或A与U)不同的碱基配对方式。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
研究隐藏在天然草本减肥药里的“非天然威胁”研究
前言:“天然草本”一直是减肥保健食品或膳食补充剂(诸如减肥茶、减肥咖啡)常用的推广亮点,然而随着国家对于保健品产品安全的监管愈发严格,我们时而能看到新闻报道中某某保健品被查出违法添加合成药物的报道。这些案件中,西布曲明是经常出现的违规添加药物。 西布曲明是一种用于肥胖症治疗的药物,主要是通过降低食欲
哺乳动物细胞真核表达产物接近天然高等生物蛋白质分子
哺乳动物细胞真核表达系统在表达过程中有翻译后修饰和折叠的功能,这一特点使其蛋白更接近天然蛋白,具备天然蛋白必须的空间结构和修饰,与天然蛋白有相同的生物活性,哺乳动物细胞表达系统在功能蛋白、抗体生产、临床疫苗的研发和生产中应用较为广泛。 原核表达系统具有表达水平高、操作简单、周期短、易于大规模高密
人造碱基能像天然DNA那样连接-有助合成生物学研究
美国印第安纳大学和应用分子进化基金会等机构科学家证明,他们造出的两种人造DNA“字母”Z和P,能像天然DNA那样组合连接在一起,将来有望把这两个新成员纳入到活细胞中。相关论文发表在最近的《美国化学协会会刊》(JACS)上。 合成生物学家一直在竞相研究遗传基本单位的人造版。美国应用分子进化基金会
Nature:“生命字母表”中的新成员
众所周知,地球上的一切生命都可看作是五个字母(A, G, C, T, U)的编码组合,这五个字母代表了核苷酸内的五种不同碱基。日前,科学家构建出了可以将非天然 DNA 碱基对稳定代代相传的新型有机体,这一成果意味着我们将对生命的基础重新定义。 一直以来,所有生命有机体都是通过核酸内
提出构建非天然手性环状单萜新策略
近日,中科院大连化学物理研究所研究员陈庆安团队在非天然手性环状单萜构建研究方面取得新进展。该团队基于仿生催化理念,通过廉价Ni金属催化剂,利用大位阻手性氮杂环卡宾配体,高效合成了一系列非天然手性环状单萜及其衍生物。相关研究成果发表在《自然-催化》。萜类化合物是一类广泛存在于生物体内并具有异戊二烯单元
国际团队首获生物学分子标尺-为新型药物设计开辟路径
由英国圣安德鲁斯大学和加拿大圭尔夫大学研究人员领导的国际团队,用尖端的X射线和紫外线研究成果揭示了帮助逃出人类免疫系统的细菌生存的分子标尺的工作机制,研究成果发表在《自然·结构和分子生物学》杂志上。这标志着我们在生物学的基础理解上,又向前迈进了重要一步。 生物能用分子标尺控制生物聚合链长度的概
胶原蛋白质量新标尺:羟脯氨酸自动化检测方案
导读 胶原蛋白,这个被称为“生命支架”的神奇分子,正悄悄改变着我们的生活。从抗皱面霜到组织修复,它无处不在。但你知道吗?有一种“隐藏指纹”——羟脯氨酸,正默默守护着它的质量底线。今天,岛津带你揭开胶原蛋白质量检测的神秘面纱! 胶原蛋白的“隐藏指纹”:羟脯氨酸 胶原蛋白是人体结缔组织的“钢筋
低成本、快速合成各种天然和非天然碳水化合物
斯克里普斯研究所(TSRI)的研究人员在《Nature Communications》描述了一种可作用于不同葡聚糖修饰细胞的葡聚糖-蛋白质相互作用筛选新工具。这项突破将用于研究葡聚糖在人类疾病(如癌症)中的重要作用。图片来源于网络 一般情况下活细胞内布满葡聚糖(glycans),这种支链碳水化