单细胞测序基准数据集通常具有以下特点:
高质量和准确性:数据经过严格的质量控制和处理,具有较低的噪声和错误率,以确保分析结果的可靠性。
多样性:涵盖多种细胞类型、组织来源和实验条件,能够全面评估分析方法在不同情况下的性能。
标注详细:包括已知的细胞类型、标记基因、细胞状态等信息,为评估分析结果的准确性提供明确的参考标准。
规模适中:既不会过小导致缺乏代表性,也不会过大而难以处理和分析,能够在合理的计算资源和时间内完成评估。
可重复性:数据采集和处理的方法有明确的记录和描述,使得其他研究人员能够重复相同的实验和分析,以验证结果的一致性。
公开可用性:可以被广大科研人员免费获取和使用,促进方法的比较和改进。
标准化处理:例如数据格式的统一、基因注释的一致性等,方便不同分析方法和软件的应用和比较。
近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员林达等报道了新开发的单细胞多组学技术——Uni-C。该方法可在一个细胞中同时解析基因组大尺度结构变异(如SV、CNV、ecDNA)、小尺度突变(SNP/I......
记者杨舒从中国农业科学院生物技术研究所获悉,该所作物耐逆性调控与改良创新团队日前联合国内外研究机构,构建了首个水稻的多器官单细胞多组学图谱,系统解析了水稻不同细胞类型的功能及其对复杂性状的调控作用,有......
作为当前生物医学研究的前沿热点领域,单细胞蛋白质组学通过在单细胞层面上探索蛋白质表达模式,精确揭示细胞异质性,为解码生命过程和疾病发生机制提供了独特视角,已成为赋能精准医疗和生物医药创新的关键技术,是......
BeaconDiscovery™单细胞功能表征平台将帮助研究者解锁活体单细胞功能分析的全部潜力。它采用Beacon®的光电定位(OEP)和微流体芯片光技术,使研究人员能够实时探索多模态和动态细胞反应,......
2025年4月26日,由北京市科学技术研究院分析测试研究所(北京市理化分析测试中心)、创新方法研究会科学工具专业委员会、北京理化测试技术有限公司主办,北京市科学技术研究院生物技术与健康研究所、宁波华仪......
喉气管狭窄(LTS)作为临床上棘手的上呼吸道疾病,其典型特征是细胞外基质(ECM)异常沉积导致的气道狭窄。随着COVID-19等公共卫生事件中气管插管应用的增加,医源性LTS的发生率显著上升。尽管手术......
由于无法对蛋白实现扩增,因此在单细胞多组学的研究中,单细胞蛋白质组学是最具挑战的研究,近年来已取得突飞猛进的进展。除了质谱仪检测灵敏度的提升,在前端取样、预处理和分离方面的巨大进步是重要因素,这和微流......
过去几年里,单细胞蛋白质组学技术取得了长足发展,单细胞蛋白质组学逐渐走向成熟,后续有望广泛应用于肿瘤异质性分析、免疫学研究、发育生物学、神经科学以及精准医学等领域。然而,从技术发展成熟到实际场景应用分......
近年来,单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)在揭示复杂生物系统和探索遗传学及临床研究中取得了突破性进展。然而,仅依赖单一的转录组信息往往难以区分分子相似但功能差异显著的细胞类别。因此,融合多种模......
近日,中国农业科学院棉花研究所乡村振兴科技创新团队牵头构建了首个结合单细胞转录组、空间转录组及空间代谢组的棉花纤维起始发育图谱。利用该图谱可以识别关键基因的表达模式及其与代谢途径的关系,深入剖析纤维发......