发布时间:2016-07-04 13:25 原文链接: 基因组学将如何进入日常医学?

  随着大规模的DNA结果越来越多的可供病人和保健提供者使用,医学界在酝酿着一次平静的转换。在一连串的数据当中,医生、顾问和家庭正在梳理如何更好地理解这些信息,并将其用于医疗决策的制定。

  最近,在两大儿科医院举行的临床遗传学会议上,来自多家机构的专家提出了他们对于“基因组整合到临床实践”的第一份建议。这些建议发表于 Nature子刊《Genetics in Medicine》,是由费城儿童医院个性化医学遗传学中心主任Ian D. Krantz博士,和多伦多病童医院遗传医学中心Ronald D. Cohn共同指导完成。

  临床遗传学家Krantz说:“随着基因检测变得更加复杂,它正被应用在更多的医学专业和初级保健中。这些测试将广泛用来筛选健康的人群,并且我们的建议旨在帮助人们更好的将测试结果整合到临床实践中。”

  Krantz和共同作者、多伦多大学病童医院遗传医学中心的Sarah Bowdin博士,是两个临床遗传学智囊团的带头人。这篇论文的共同作者还包括智囊库的其他参与者:临床遗传学家、遗传咨询师和实验室专业人员和生物信息 学专家。Krantz说:“我们的合作者代表了这个领域的主要利益相关者。我们还将患者及其家长列入智囊团,将他们的经验纳入这些问题的日常处理。”

  Krantz补充说,他和Bowdin听说,同事们在临床基因组学和外显子组测 序项目中遇到了与其他机构一样的问题,于是就发起了这个智囊团。这些挑战是,如何最好地解释DNA结果?如何向患者和临床医生报告关于不确定的基因变异的 信息?如何报告与测试主要原因无关的二次结果?以及如何与其他中心共享这些结果。“因为每个机构都各自开发了自己的程序,所以我们认为,在我们的领域交换 经验,可以提高整体实践能力。”

  这些建议提出了事前测试(包括选择病人和获得保险范围)、病人和医生教育,解释序列数据,以及后续测试病人护理(包括如何返回测试结果,并提供数据 的重新评估)。Krantz补充说,另一个广泛的领域是表现型——为病人的临床特点建立一致的术语,这样,临床医生就可以更好地解释DNA结果的意义,在 各中心之间共享数据,并最终规范化病人的护理。

  Krantz将这些新的挑战与更直接的临床状况进行了比较。相比之下,目前临床基因组和外显子组测序产生了许多未知数:对于每个个体来说,测试结果产生了许多具有不确定意义的变异,以及二次发现——与病人基本条件无关的基因变异。

  面对大量的DNA数据,一些家庭告诉其他智库参与者,他们往往首选两个延时测试,以讨论测试结果——一个是得到主要的诊断结果,另一个测试是讨论医学上可操作的二次结果。

  Krantz补充说,至关重要的是,来自基因测试的数据是动态的——随着新的科学知识积累,数据的意义发生变化:一些不确定的研究结果,将变得更清 楚,并在未来将成为医学上可操作的,所以,医疗服务提供者需要设计某种方法,系统地给病人的基因组提供重新评估。他说:“我们需要让这些数据成为纵向的, 而不是静态的。”

  智囊库提出的一个新兴问题是,如何最好地将基因组结果整合到每个病人的电子健康记录中。Krantz说,这变得更加重要,因为临床测序可用于健康患者群体的一般检查,包括新生儿,可作为精密医学发展的一部分。

  Krantz补充说,跟一个家庭的对话,帮助他们理解了这个问题。他解释了一个具有多种医学问题的孩子的基因测试结果。意想不到的二次结果发现,这个孩子携带一个癌症易感性基因,了解这种情况之后,孩子父母询问是否可对他们的健康孩子进行检测。

  Krantz说:“我们制定这个文档,并不是一组公开的指导方针,而是作为建议,我们希望,随着我们这个领域的发展,会有所改变。”他补充说,未来智囊团将开会讨论新的挑战。

  基因组学在医学领域发挥了重要的作用。2014年12月,一项研究公布了针对超过100个患有广泛神经功能和发育障碍的儿童的家庭,进行基因组测序分析的大规模研究成果,这一成果公布在Science Translational Medicine.杂志上。

  随着癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的完成,现在是评估其影响和挖掘数据的时候了,以对癌症生物学和治疗获得更好的了解。2015年2月5日,《自然医学》(Nature Medicine)发表题为“The future of cancer genomics”的社论文章,对该项目对癌症研究领域的影响及数据挖掘进行了评估。

  2015年12月,国际著名学术期刊《Genome Biology》在线发表了斯坦福大学Matthew H Porteus教授的一篇评论文章。这篇文章回顾了基因组编辑的潜在治疗价值、基因组编辑及其工具箱的发展,讨论了非同源性末端结合介导的基因组编辑和同 源性重组介导的基因组编辑,可能具有的治疗价值,以及生殖细胞系基因组编辑所面临的挑战。

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