布鲁克发布timsTOFHT，具有更宽的动态范围

　　● 采用第 4 代 TIMS XR cell，具有更宽的动态范围，进样 1 微克蛋白，可以在 60 分钟内鉴定超过 10 万条肽段（1% FDR）；

　　● 增加的动态范围与 14 位 Digitizer 可提供出色的定量蛋白质组学结果（CVs值<5%）；

　　● 共同销售 CellenONE PICO 液体分配系统，推进单细胞蛋白质组学 (SCP) 应用；

　　● 全新 PaSER™实现实时数据流和智能数据采集控制；

　　● timsTOF Pro 2 带动 4D-代谢组学革命，并与领域内的先驱者合作推动小分子生物标志物的发现。

　　2022 年 6 月 6 日美国明尼苏达州明尼阿波利斯市 —— 在第 70 届 ASMS 会议上，布鲁克宣布推出新的 timsTOF HT 系统，进一步拓展了革命性的 4D-多组学 timsTOF 平台。timsTOF HT 采用新型第 4 代 TIMS（trapped ion mobility separation，捕集离子淌度分离）XR cell 和14 位 Digitizer，可实现更宽动态范围、更深的肽段覆盖率和更准确的定量分析。该系统在 4D 血浆、组织蛋白质组和表观蛋白质组学中表现出色。

　　这些系统性能的提升不以牺牲超高灵敏度和高通量蛋白质组学分析（例如每天分析 50 个样本（SPD）或是高达 200 SPD 时的超高稳定性为代价，也不影响结果的可靠性（肽段和蛋白水平控制 1% FDR（错误发现率）），并且避免了靶向免疫识别方法中固有的抗原交叉反应性。利用 dia-PASEF 技术，timsTOF HT 质谱仪可以从微克级样本中，在 60 分钟梯度内鉴定超过 100k 独特的肽段其定量分析 CV 值更是低于 5%。此外，timsTOF HT 还针对高通量、高深度和无偏血浆蛋白质组学和液体活检生物标记研究进行了优化。

　　耶拿大学的 Florian Meier 教授说：“我们与布鲁克的合作实现了流程化组织蛋白质组学分析，这是临床蛋白质组学的一个关键领域。由于组织切片和活检常包含非常异质的细胞群，因此对他们的分析极具挑战性。timsTOF HT 系统的 dia-PASEF 采集模式可以在宽动态范围内对蛋白质进行定量分析，即使是在心脏组织等非常困难的样本中，也不会损失分析通量和灵敏度。”

　　PrognomiQ 公司蛋白质组学部门副总裁 Bruce Wilcox 博士在胰腺癌研究中使用 Seer Proteograph 和 timsTOF Pro 2，在深度、无偏血浆蛋白质组学中对生物标志物进行探索研究。Wilcox 博士表示：“我们收集了 193 个胰腺癌患者和健康人群的样本，并采用 5 种 Seer 纳米颗粒处理样本，在这些样本中共检测到 3822 种蛋白质。通过使用多个 timsTOF 系统，约 2933 种蛋白质在至少 25% 的患者样本中被鉴定到。”

　　在本届 ASMS 上布鲁克还宣布，与 Scienion 达到协议，其具有极高灵敏度的 timsTOF SCP 系统与 CellenONE F1.4 单细胞 pico-分配器和新的 ProteoChip™ 进行共同销售，实现了由单一供应商提供的无偏、非标记单细胞蛋白质组学 (SCP) 解决方案。

　　Scienion GmbH 首席执行官兼创始人 Holger Eickhoff 博士评论说：“我们很高兴与布鲁克一起提供完整的 SCP 解决方案。借助扩大合作关系，并通过结合我们 SCP 团队的专业知识来加速单细胞蛋白质组学解决方案的研究与开发，从而更好地满足单细胞蛋白质组学界的需求。”

　　PaSER™ 拥有 LFQ 和智能采集模式

　　在此次 ASMS 上，布鲁克展示了 PaSER 实时数据流和反馈循环用于智能采集的过程。PaSER 由布鲁克与斯克里普斯的 Jonh Yates 实验室合作开发，用户可以完全依赖 PaSER 的实时决策进行采集参数的动态调节功能，对 PTM 选择性采集、保留时间对齐以及母离子动态纳入和排除。这为那些不容易检测到的候选离子的鉴定和深入分析创造了一个更智能的工具。

　　荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心转化代谢实验室负责人 Alain van Gool 教授说：“在遗传代谢疾病的个性化诊断中，我们使用质谱法来发现人体内转化的生物标记物。我们专注于蛋白质标记物的基因表达和糖基化过程，并以此实现疾病诊断。我们使用两台 timsTOF 设备开发了创新性的的工作流程，PaSER 所带来的实时处理，（糖）肽鉴定和仪器参数即时调整功能证明了 timsTOF 速度快并且结果可靠。我们很高兴转化组学中心与布鲁克展开合作，为临床糖蛋白组学研究开发基于智能反馈的采集模式。”

　　PaSER 2023版可用于 dda-PASEF 实时非标记定量分析 (LFQ)，“Run and Done” 的模式保证了大队列样本一旦采集完成，就可立即获得定量结果，PaSER 2023版还整合了 TIMS DIA-NN 1.1 用于 dia-PASEF 数据分析。

　　高通量和高置信度探索 4D-代谢组学的转变

　　高灵敏 timsTOF Pro 2 系统帮助人们探索小分子生物标记物，并以前所未有的规模彻底改变了代谢组学。新工作流程利用了 timsTOF 平台，在 4D-代谢组学中表现出出色的速度、稳定性和可信度。帮助人们探索生物标记物，以加速药物发现和新型天然产物研究。

　　Sapient Bioanalytics LLC 通过使用群体数据来识别超高通量的敏感生物标记物，揭示疾病机制、进程和患者应答相关的途径，从而加速药物研发。

照片摄于 Sapient Bioanalytics LLC

　　Sapient 创始人兼首席执行官、医学博士/博士 Mo Jain 解释说：“Sapient 特有的快速 LC-MS 系统可以测量数千种分子，其中也包括血液等样本中的未表征化合物。我们的下一代 timsTOF Pro 2 系统可以在 43 秒内测量每个生物样本中超过 11,000 个小分子生物标记物。该系统以其无与伦比的能力，每天可以测量超过 10,000 个生物样本。”

　　Enveda Biosciences 首席执行官兼创始人 Viswa Colluru 博士表示，timsTOF Pro 2 系统正在以惊人的速度，不断发现自然界中的新化合物。他说：“布鲁克 timsTOF 提供的捕集离子迁移碰撞截面 (CCS) 数据为自然界中的许多异构体提供了前所未有的 4D 分辨率，使我们能够在复杂的混合物中找到新的治疗化合物。timsTOF Pro 2 将跨时代的无损离子迁移率技术与快速高分辨率 TOF 检测相结合，帮助我们能在更大自由度范围内地描绘自然界、更好的在药物研发上实现工业化应用。布鲁克对创新方面和客户承诺，使他成为一个值得信赖的合作伙伴。我们很高兴能继续与布鲁克一起，重新定义代谢组学的界限。”

　　OligoQuest™ 增强型 RNA 和寡核苷酸表征软件

　　布鲁克的 OligoQuest 软件提供强大的 RNA 和寡核苷酸表征能力，其中包括反义研究、RNA 治疗、CRISPR 引导 RNA 序列的确认以及其他基因编辑技术。布鲁克 maXis II 和 timsTOF 平台带来了同位素高保真度和质量准确度。借由这两个平台，OligoQuest 可通过完整质量和 MS2 分析实现样品特征确认。（客户正在使用 OligoQuest 确认异构寡核苷酸中修饰的 RNA 序列和碱基交换。） OligoQuest 不但可以用算法填补了 RNA 和寡核苷酸数据分析的空白，还允许客户使用他们个性化的寡核苷酸“字母表”，进行标准化或定制化的修改。

布鲁克 OligoQuest 软件

　　德国库尔姆巴赫 Axolabs GmbH 运营董事总经理 Ingo Röhl 博士说：“OligoQuest 软件可以实现异构寡核苷酸分析，进而识别碱基交换。第一个版本的软件已经渗透在我们的日常工作流程中的方方面面。”

　　布鲁克·道尔顿生物制药总监 Michael Greig 博士补充说：“Axolabs 是自 2000 年以来首批专注于 RNAi 疗法的公司之一。我们要以更有意义的方式解决关键问题，并满足这一类重要客户的生物制剂需求，因此在 beta 测试阶段获得 OligoQuest 的验证非常重要。”