瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)研究人员多年来致力于改进纳米孔技术,该技术可让DNA分子通过膜上的小孔以测量离子电流,研究人员则可以通过分析核苷酸在电流通过时的扰动情况,来确定DNA的核苷酸序列。该研究19日发表在《自然·纳米技术》上。

  分子的快速运动使得对其实现高精度分析具有挑战性。EPFL团队成员称,将纳米孔的灵敏度与扫描离子电导显微镜(SICM)的精度相结合,他们就能锁定特定的分子的位置并控制它们移动的速度。这种精巧的控制填补了该领域的一个巨大空白。

  团队使用先进的扫描离子电导光谱(SICS)实现了这种控制。SICM利用流经探针尖端的离子电流的变化,可生成高分辨率3D图像数据。而其创新技术减缓了分子通过的速度,允许对同一分子甚至分子上的不同位置进行数千次连续读数。

  研究人员用汽车类比这种方法举例说明:“想象一下,当你站在窗前看着汽车来回行驶。如果汽车减速并反复驶过,读取他们的牌照会容易得多。我们现在可决定是要每次测量1000种不同的分子,还是测量同一分子1000次,这代表了该领域真正的范式转变。”

  这一成果不但可显著改善诊断和测序领域,还可应用于DNA以外的分子,推进蛋白质组学研究。例如肽的蛋白质构建块,由于肽“牌照”由20个“字符”(氨基酸)组成,而不是DNA的4个核苷酸,因此寻找肽测序解决方案一直是一项重大挑战,但这种新控制方法会为肽测序开辟一条更容易的道路。

相关文章

掌握DNA分子的“车流速度”单分子操作实现近乎完美控制

瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)研究人员多年来致力于改进纳米孔技术,该技术可让DNA分子通过膜上的小孔以测量离子电流,研究人员则可以通过分析核苷酸在电流通过时的扰动情况,来确定DNA的核苷酸序列。该研......

掌握DNA分子的“车流速度”单分子操作实现近乎完美控制

瑞士洛桑联邦理工学院(EPFL)研究人员多年来致力于改进纳米孔技术,该技术可让DNA分子通过膜上的小孔以测量离子电流,研究人员则可以通过分析核苷酸在电流通过时的扰动情况,来确定DNA的核苷酸序列。该研......

新策略制备出新型多孔纳米笼型氧反应器

安徽理工大学材料科学与工程学院教授张雷团队制备出了一类新型的多孔纳米笼型反应器,并证明这种材料可以用于可充电锌空气电池的空气阴极。相关研究成果近日发表于《化学工程杂志》。锌空气电池具有高理论能量密度、......

国产纳米孔测序仪市场化加速,这家企业做对了什么?

“目前,已有超过100个机构使用齐碳QNome测序平台。” 在6月28日举行的新品发布会上,齐碳科技联合创始人谢丹博士回顾了公司商业化探索的第一项成绩单。QNome-3841是齐碳科技研发的......

一种全新的高精度纳米孔蛋白测序法

长期以来,直接读取蛋白质的一级结构存在许多困难。科学家通常会根据基因序列和氨基酸密码子表来“破译”蛋白质的氨基酸序列。由于转录后修饰和翻译后修饰等生命活动的存在,氨基酸序列破译结果并非完全正确,甚至与......

新型纳米孔势阱实现水相中天然低分子量RNA结构动态检测

RNA三级结构的存在是行使丰富生理功能的基础[1]。tRNA、RNA适配体、核酶和核糖体等都是高度结构化的RNA机器。许多重要的代谢过程,包括蛋白质合成和RNA剪接,都是由具有复杂三级结构的RNA分子......

武大联合团队开发纳米孔靶向测序快速“捕获”新冠病毒

武汉大学联合团队创新性开发了纳米孔靶向测序检测方法(NTS),能大幅提升病毒阳性检出率,并能实现当天同时检测新冠和其他10大类、40种常见呼吸道病毒并监测病毒突变。3月7日,该团队在预印版平台medR......

三分钟了解4代基因测序技术

基因检测技术是近年来伴随“精准医疗”概念的提出而迅速发展起来的一门科学技术,它可以从基因组机制上阐释遗传学、发育生物学、进化生物学等学科的经典概念,在全基因组水平延伸了染色体高级构象、细胞异质性、功能......

纳米孔“ARMA”分析工作流——实时检测抗生素抗性基因

据世界卫生组织报道:“抗微生物药物耐药性(AMR)是一种全球性的公共卫生危机,将会严重危害现代医学的发展”。纳米孔读长已作为一项独立工具或作为混合测序方法的一部分,成功应用于抗微生物药物耐药性分析,以......

纳米孔测序技术用于快速的病毒病原体的鉴定及进化研究

2014-2016年,西非暴发埃博拉疫情流行期间,进行了大量ELISA和基于RT-PCR的检测,这些方法的检测虽然简易、便携、快速,但由于病原体不断进化,这些方法很快变得过时,并且还缺乏能在症状出现前......