发布时间:2007-08-05 18:27 原文链接: 新药筛选基本方法

一、 随机筛选

是最经典的药物筛选方式,在历史上曾发挥过重要作用,特别在50~60年代较为变通。它用一个或多种生物试验手段评筛化合物或自然资源。现在应用的许多有效治疗药物都是通过随机筛选得到的。随机筛选典型代表,如利用细菌培养法从自然资源中筛选抗菌素,利用瘤株细胞培养法从多种来源的化学物质中筛选抗癌药物;70年代后利用受体(竞争)结合法随机筛选神经-精神性药物等。

随机筛选发现新药的机率较低,据统计,筛选800个化合物可发现一个有活性化合物,一个投放市场的药物,常需筛选上万个化合物,例如美国国家肿瘤研究所(NCI)每年筛选一万个化合物,连续9年,只有一个成为上市药物。尤其早期(50~60年代)随机筛选常用整体动物试验方法,不但速度慢、所获信息少、耗资巨大,且不能有效地利用化合物资源。因此,随机筛选遭到冷落,新药研制部门,特别是药物产业部门很少依靠随机筛选做为发现新药的主要手段。

随着筛选技术方法的进步和自动化技术在药物筛选中的应用,特别是90年代以来,组合化学在新药发展研究中确立了重要的地位,随机筛选又逐渐兴起,甚至出现了专门从事随机筛选的公司,例如有的公司(PanLabs)用全细胞、纯化酶、受体或离子通道建立了45种筛方法,从微生物发酵液和其他自然产物中筛选导向化合物。又如英国的Xenova选用30个与疾病有关的靶标,建立筛选方法,从自然资源中筛选免疫、中枢神经系统、癌和心血管系统疾病的治疗药物,每年可完成100万次以上的筛选实验。

二、 经验式重复筛选

是使用最为广泛的传统的筛选方法,其基本程序如下图所示。

这种筛选主要特点是合成筛选紧密配合,经重复性(trial and error)试验过程,根据构效关系(SAR),不断对化合物进行结构修饰(structural modification),找到选择性导向或候选化合物。它属于定向合成与筛选,成败的关键在于确定适当的筛选目标和范围,选好靶标(target)和筛选指标。60年代以来,特别是70年代以后,这种筛选在新药发现研究中占主导地位。80年代以来这种筛选方式更强调靶标的选择,提出了基于机制的筛选(mechanism-based screening),即根据疾病性病的分子机制,选择关键靶标,建立相应筛选方法,进行靶向筛选(targeted screening)。

417个药物靶标的系统分布

系统式疾病                    所占比例(%)

外周及中枢神经系统       33

内分泌                              13

炎症反应                         12

血液及造血                         9

癌瘤                                     9

心肾系统                            4

胃肠系统                            4

免疫调节                             4

维生素缺乏                        3

泌尿系统                             2

据统计,除去抗感染、抗病毒和抗寄生虫类药物以外,制药工业用来做为药物靶向筛选的靶标已有条有417种,包括受体、酶、离子通道等,涉及10个系统的功能或知患(。在人类基因组计划完成后这种靶标可增至3000-4000个。据统计,人类疾病有30000种,但药物能控制和改善的只有100-150种。未得到控制和改善的疾病大多数与基因有关,每一种疾病大约涉及5-10个基因。因此,靶向筛选是新药筛选的一个有发展潜力的重要方向和领域。

三、 药物合理设计与筛选

也称基于结构的药物设计与筛选(structure-based drug design and screening)或称理性发现(rational discovery).

这种筛选的策略是将基于机制的筛选与药物合理设计融合为一体,为了进行药物合理设计,必须获得靶标大分子的结构,特别是三维结构的信息。因此,该种筛选策略的第一步是靶标的分子结构分析。在实施中也可取已知三维结构的靶标,直接进行药物合理设计,做为工作的起始点。如果大分子一级结构已知,三维结构尚水阐明者,可根据同源蛋白模建等方法预测其三维结构。大分子一级结构不清,只有配体结构信息的,根据其配体推导药效基因(bparmacophore)模型,或提出假想受体,间接设计化合物。

合理性药物发现需要理论计算-药物设计-化学合成-生物筛选密切配合,缺一不可,其关键在于药物设计。成功的药物合理设计可大量减少化学合成和生物筛选的工作量,提高新药发现的机率,降低奖金投入;不成功的药物合理设计,则无异于经验式重复筛选。目前这种筛选在学术技术领域里受重视,在经验和理论上也取得一定进展,但在应用领域里,取得成功的例子不多。因此,有人称理性药物发现的时代尚未到来。药物合理设计仍属于辅助手段。

(来自红军长征论坛)

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