发布时间:2020-05-15 15:30 原文链接: 注重实践经验!Urimarker2020线上会前培训率先登场

  分析测试百科网讯 2020年5月15日-17日,第二届尿液生物标志物网络研讨会(Urimarker 2020)线上直播召开。Urimarker 2020由北京师范大学与分析测试百科网联合主办,基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、中国医学科学院基础医学研究所协办,北京师范大学生命科学学院承办。

  会议邀请对临床生物标志物研究有兴趣的临床医师、检验科医生、科研院所和高校研究人员,蛋白质组/代谢组 /microRNA 等组学分析领域的专家,生物样本库专家,临床大数据专家,科学出版领域和风险投资领域的专家,共同讨论尿液生物标志物研究的进展和临床应用前景,促进各个领域专家的合作,建立一个平等、自由、高效的学术交流与合作的平台,展示各领域的研究成果、研究能力和合作意愿,探索新的契机,推进尿液生物标志物研究各领域深入发展和成果的临床转化

  15日率先召开Urimarker 2020会前技术培训,针对尿液相关研究和应用中所涉及到的问题,相关团队介绍了其研究经验,包括样品尿液收集、贮存、质谱分析、数据分析等。

  青岛市市立医院秦伟伟带来题为《尿液样品收集和贮存》的精彩报告。

  报告首先介绍了利用膜(硝酸纤维素膜/尼龙膜)吸附尿液中生物成分(蛋白质/RNA),干燥后存储在真空袋中。该方法实现了尿液的室温保存,解决了尿液样本贮存和运输的问题。

  对于从婴幼儿采集尿液困难的问题,报告介绍了一种利用纸尿片收集尿蛋白的方法。用绒毛尿作为吸收体收集尿液,将尿蛋白洗脱并吸附在膜上,将蛋白结合膜干燥后存放在真空袋中,可室温保存。

  为实现在居家环境中对尿液的收集和保存,报告介绍了一种滤器联合注射器的家用套装:包含一个可换膜滤器和一个注射器等。注射器提供压力,使尿液依次通过滤器中的隔离膜和吸附膜,将蛋白结合膜干燥并保存在真空袋中,可室温保存7-10天。

  报告还介绍了一种干燥法的保存泪液的方式:Schirmers试纸条收集泪液,干燥后储存在真空袋中,可室温保存2周。

  中国医学科学院基础医学研究所汤晓悦带来题为《尿液样本制备》的报告。

  完整的尿液蛋白质组学分析流程包括样本的收集与保存,尿液样本的前处理,液质分析和数据处理几个环节。

  报告共介绍了7种尿液样本的前处理方法: In-solution、FASP、96 FASP/q96 FASP、Mstern Blotting、Strap、iST、C4 tip。分别对每种方法的工作流程,处理时间,通量,方法优缺点及相应的应用分析进行了介绍。最后报告对In-solution、S-trap、iST和Mstern Blotting4种方法进行了比较分析。

  中国医学科学院基础医学研究所郭正光带来题为《质谱采集方法和优化》的报告。

  质谱仪是高通量蛋白质组分析的有力工具。报告介绍了蛋白质组学各种定量分析策略。首先介绍了发现蛋白质组学的定量技术,如TMT/iTRAQ技术、Label-free,DIA等。

  标记定量技术的优点有方法简单、易操作;蛋白通量高,覆盖度高;MS2定量,准确性好;样本混合上样,平行性好;实验室内、实验室间重现性好。缺点有每次分析个数有限;标记试剂成本高;信号压缩等。

  Label-free技术的优点包括无需标记,操作简单,成本低;通量高;无样本数限制。然而Label-free技术需要保证很好的色谱重现性。

  最新的数据非依赖采集DIA技术,该技术结合DDA和SRM技术的优点,不丢失任何信息,数据可回溯。接下来报告介绍了靶向蛋白质组学的定量技术,包括PRM和MRM技术的原理和主要的技术策略。

  报告还简介了各种定量蛋白质组学的方法在尿液蛋白质组学研究中的应用案例。

  上海易算生物科技有限公司沈诚频带来题为《基于iomicsCloud的在线分析流程》的精彩报告。

  Omics Cloud平台整合了组学数据分析中所有常用的统计分析工具以及高级功能分析工具,如.主成分分析(PCA) 、 偏最小二乘法判别分析(PLS-DA) 、 基于正交信号校正的偏最小二乘判别分析(OPLS-DA) 、 层聚类分析(HCA) 、 MFUZZ分析、 假设检验、 P值校正、 STRING蛋白互作网路图绘制、 GO和KEGG富集分析等,真正做到蛋白组和代谢组的 ”一站式” 数据分析。

  Omics Cloud的所有工具中都预设了推荐的统计/功能分析参数,用户可以使用默认的参数进行分析,快速查看数据质量等信息,也可逐一调节参数,进行自定义分析.而用户对参数所作的一切调整都会在右边的分析结果呈现界面实时展现,在某些分析中您甚至可以一边拖动参数条,一边查看图表的变化,找出最满意的参数。

  中国医学科学院基础医学研究所杨啸林带来题为《FAIR准则与生物医学数据建设标准》的精彩报告。

  报告介绍了数据库构建的FAIR准则、生物医学数据标准和生物医学本体应用。FAIR准则为可发现、可访问、可重用、可互操作这四项。生物医学数据标准涉及格式标准、最小信息标准、术语标准等。

  报告还介绍了生物医学本体及其应用,如:OBO Foundry及其本体资源、基因本体GO、GO注释、GO富集分析、人类表型本体、疾病与表型的本体及FAIRsharing、Ontoportal Alliance等相关数据平台。

Urimarker 2020直播预告

Urimarker 2020会议5月16日9时精彩继续,直播观看链接:https://live.polyv.cn/splash/1263786,填写预登记的手机号即可观看

预登记扫一下二维码


Urimarker 2020会议日程

相关文章

超加工食品吃了多少?看血尿记录

根据5月20日发表于《公共科学图书馆-医学》的一项研究,尿液和血液可以揭示一个人饮食中有多少来自超加工食品。这为追踪超加工食品的摄入量提供了一种客观方法,并且有助于调查其与糖尿病、癌症等疾病的关联。超......

新研究利用人类尿液生产氮肥

西班牙近期发布的一项研究显示,人类尿液可回收用于生产氮肥,不仅能促进都市农业发展,还能减少二氧化碳排放,节约用水,带来显著的环境效益。西班牙巴塞罗那自治大学研究团队近期在《资源、保护与循环利用》杂志上......

高友鹤:美国管制新规下,尿液蛋白质组学面临挑战

前段时间,美国商务部工业与安全局(BIS)发布出口管制规定,对《出口管理条例》(EAR)进行修订。新的出口管制规定,未经许可,任何公司和个人禁止向中国及其他国家出口高参数流式细胞仪和特定质谱设备。相关......

NatureCommunications:尿液蛋白质组学研究新突破——标准操作流程(SOP)与全流程质控(QC)体系助力多平台尿液蛋白质组学研究

2025年1月26日,北京航空航天大学医学科学与工程学院刘超团队和中国医学科学院基础医学研究所孙伟团队联合北京理工大学、北京师范大学、中国科学院动物研究所、北京儿童医院、北京协和医院、国家蛋白质科学中......

助力疾病早筛早诊百名学者联名倡议启动“中国尿计划”

近日,由北京师范大学生命科学学院教授高友鹤、中国医学科学院基础医学研究所研究员孙伟、中国医学科学院北京协和医院助理研究员吴建强起草,110多位学者联名在《中国科学·生命科学》发表《中国尿计划倡议书》。......

FDA批准因美纳癌症生物标志物检测试剂盒及其两项伴随诊断适应症

·TruSightOncologyComprehensive是美国食品药品监督管理局批准的首款可上市的全景变异分析体外诊断试剂盒,具备泛癌种伴随诊断功能· 500多种基因生物标志物检测为患者......

我国科学家发现阿尔茨海默病早期诊断的新生物标志物

·“该发现不仅突破了传统阿尔茨海默病诊断标志物的局限性,还显著提高了诊断的准确度。此外,这些新发现的生物标志物不仅限于脑脊液研究,还可能在血液检测中展现出同样的诊断潜力。”复旦大学附属华山医院神经内科......

地中海饮食有助女性降低死亡风险

美国布莱根妇女医院对25000多名初始健康的美国女性进行了长达25年的跟踪调查,发现地中海饮食摄入较多的人,全因死亡率降低23%。相关研究论文发表于最新一期《美国医学会杂志》。一项研究发现,地中海饮食......

《JAMA·精神病学》:尿液中的8oxoGuo升高,精神病患者的死亡风险或翻倍!

有证据表明,NA-OXS在衰老相关疾病,比如2型糖尿病、痴呆症、心血管疾病和癌症发病机制中起作用。在此基础上,哥本哈根精神病学中心的研究人员假设,精神疾病患者中普遍发生的NA-OXS负荷增加是这些疾病......

JAHA:房颤消融后复发与心脏重构生物标志物的关系

心房颤动是最常见的心律失常,影响到大约37%的成年人。房颤射频消融是一种常用的治疗方法,对于阵发性房颤失败或不能耐受抗心律失常药物的患者具有I级适应症。尽管射频消融技术取得了重大进展,但房颤复发也较为......