1.对于多级质谱仪来讲,二者都可实现多级,可做真正的MS/MS。
2.构造上讲:三级四极杆质谱原理上很简单,它把三个四极杆在空间上串联起来。但由于离子从第一个四极杆传输向下一个四极杆时会有损失,所以最多只能做MS/MS。离子阱质谱的设计获得了质谱界唯一的Nobel奖,因为它改变了传统的观念,在同一个阱中调节RF电压,来实现时间上的串联。由于没有离子空间传输的损失,所以它可以实现MS/MS、MS3、…MS10。在结构解析、确认中,它的优越性显而易见。
3.离子阱质谱和三级四极杆质谱主要的区别是:三级四极杆质谱的动态线形范围更宽,约10的5次方;离子阱质谱的动态线形动态范围为约10的4次方。
4.在做定量、做低检测限时,以前,许多人用三级四极杆质谱,目前,很多人将方法移植到离子阱质谱(比如美国FDA做氯霉素,比利时、香港、新加坡、瑞士等兽药残留监测组织,所用质谱都是Finnigan的LCQ系列产品)上,对许多化合物都可以获得<1ppb的检测限和很好的定量结果。
5. 在功能上,有时仅用MS2无法确证某些化合物,必须使用MS3、MS4、…,所以,离子阱的功能更多,应用范围更广。
6. 由于构造上的原因,离子阱相对三级四极杆质谱,仪器调谐、使用和维护都更加容易,这也是目前大多数用户选择离子阱质谱的原因之一。
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