lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(small open reading frame,smORFs)可以编码多肽/小蛋白(smORF encoded polypeptides or microproteins),并在细胞Ca2+稳态、代谢和发育、应激信号传导和DNA修复等重要生物学过程中发挥不同的调节作用。有研究发现,与癌症相关的lncRNA及其编码的功能性多肽/小蛋白能够影响肿瘤的发生、侵袭和转移。然而,lncRNA编码多肽/小蛋白在癌症发生、发展中的作用机制仍未得到深入表征,尤其是其可能的作用机制和模式有待进一步探讨。
7月12日,中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队、中科院院士陈润生团队及北京三博脑科医院教授张宏伟团队在Journal of Extracellular Vesicles上,在线发表了题为LncRNA-encoded microproteins: A new form of cargo in cell culture-derived and circulating extracellular vesicles的研究论文,首次报道了lncRNA编码多肽/小蛋白是一种新的细胞外囊泡内容物。进一步的实验数据显示,血浆EVs中富含lncRNA编码多肽/小蛋白,其组成的差异可用于区分脑胶质瘤患和健康对照。
研究人员利用基于生物质谱的高灵敏、高通量lncRNA编码多肽/小蛋白的发现与鉴定技术平台,分别从脑胶质瘤细胞系及其衍生的EVs中发现了84和29种lncRNA编码多肽/小蛋白,并借助核糖体分离技术和RT-PCR技术,质粒构建及体外表达、免疫印迹和免疫荧光以及免疫共沉淀等多种实验手段,进一步验证了鉴定结果的可靠性,证实lncRNA编码多肽/小蛋白是一种新的细胞外囊泡内容物。基于此,研究人员从全血浆、去除EVs的血浆以及血浆来源的EVs中分别鉴定出3、11和48种lncRNA编码多肽/小蛋白,表明循环的lncRNA编码多肽/小蛋白主要富集在血浆EVs中。进一步结合临床样本发现,血浆EVs lncRNA编码多肽/小蛋白的组成差异可用于区分脑胶质瘤患者和健康对照,具有潜在的临床应用价值。
研究工作得到国家重点研发计划和国家自然科学基金重大研究计划"基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制"培育项目等的资助。
基于质谱技术的lncRNA编码多肽/小蛋白鉴定工作流程
2月27日,国家重点研发计划“基础科研条件与重大科学仪器设备研发”重点专项——“高分子量生物质谱分析仪”项目启动会暨项目实施方案论证会在宁波华仪宁创智能科技有限公司(以下简称“华仪宁创”)顺利召开。启......
2024年6月28日在首届CBA-China年会上,永道致远重磅发布了新一代生物质谱平台:BioSummit™CVA。该产品结合了永道致远特有的CR3520cIEF-MS分析体系,凭借其卓越的分离技术......
11月17日至18日,第二十五届高交会系列论坛之深圳市2023“生物质谱+自由电子激光”产业峰会在福田会展中心开幕。本次峰会由南方科技大学、宝安区人民政府主办,南方科技大学技术转移中心、南方工业技术研......
RNA是细胞传递基因信息的重要“信使”,一旦细胞发生癌变,便很有可能产生异于常态的RNA,即“肿瘤特异性转录本”。复旦大学附属肿瘤医院方面8日透露,该院邵志敏教授、江一舟教授团队携手黄胜林教授团队,发......
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(smallopenreadingframe,smORFs)......
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(smallopenreadingframe,smORFs)......
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(smallopenreadingframe,smORFs)......
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(smallopenreadingframe,smORFs)......
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(smallopenreadingframe,smORFs)......
第一届美国华人质谱学术研讨会将于2021年8月9日-13日举行。研讨会将举行两次大会报告和14次专题讨论。每天的研讨会将集中于两个主题:蛋白质组学和生物质谱学、代谢脂质组学和药物质谱学,共有84名来自......