细胞外囊泡中富含lncRNA编码多肽/小蛋白且有疾病特异性
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(small open reading frame,smORFs)可以编码多肽/小蛋白(smORF encoded polypeptides or microproteins),并在细胞Ca2+稳态、代谢和发育、应激信号传导和DNA修复等重要生物学过程中发挥不同的调节作用。有研究发现,与癌症相关的lncRNA及其编码的功能性多肽/小蛋白能够影响肿瘤的发生、侵袭和转移。然而,lncRNA编码多肽/小蛋白在癌症发生、发展中的作用机制仍未得到深入表征,尤其是其可能的作用机制和模式有待进一步探讨。 7月12日,中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队、中科院院士陈润生团队及北京三博脑科医院教授张宏伟团队在Journal of Extracellular Vesicles上,在线发表了题为Lnc......阅读全文
长链非编码RNA编码多肽的系统挖掘和鉴定研究新进展
6月13日,Molecular & Cellular Proteomics在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员杨福全团队和中科院院士陈润生团队,关于长链非编码RNA(lncRNA)编码多肽的系统挖掘和鉴定的研究论文Deeply Mining a Universe of Peptides En
细胞外囊泡中富含lncRNA编码多肽/小蛋白且有疾病特异性
lncRNAs是一类长度大于200个碱基且不编码蛋白的RNAs转录本。近年来,越来越多实验证据表明,许多lncRNAs转录本中的小开放阅读框(small open reading frame,smORFs)可以编码多肽/小蛋白(smORF encoded polypeptides or micr
杨福全:生命科学领域的行进者
在生命科学研究的征途中,为了理想,他们奔赴海外求取知识;学有所成后,他们义无反顾回到祖国,将个人的理想融入社会发展的潮流,致力于研究生命科学。科研先锋杨福全和创业精英周慧君就是这个群体中的代表。 留学路线图:不远万里求学路 对于在生命科学领域从事蛋白质组学和基因研究的年轻人而
-长读取测序揭秘转录本结构
短读取的 RNA-seq 虽然可以精确计数已表达的转录本,但无法提供这些转录本的结构信息。 现在,斯坦福大学研究人员在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上报告称,他们开发出了一种能保留转录本结构信息的新方法,他们通过环状 cDNA 模板和长读取测序,
本科生应当:以本为本,研究生才能:以研推新
荀振芳 “研究生为何提不出问题”之所以引起老师们的共鸣,不仅是因为这是老师们认可的“真”问题,而且也是各类高校普遍存在的共性问题。 笔者曾访谈了一所高校人文社会科学学院的10多位面临学位论文开题的硕士研究生,其中竟有85%以上学生的选题是导师为其拟定的,而博士研究生的情况则大为不同,大多数
转录组测序和全转录组测序的区别
全转录组广义上是指细胞在特定状态下所能转录出来的 所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA 。借助高通量测序技术,可以全面获取样本中转录产物信息,结合竞争性内源RNA ( ceRNA)机制, 进行联合分析,深入挖掘转录水平调控网络。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有
全转录组测序文章
研究背景 长链非编码RNA(Long noncoding RNA,lncRNA)普遍被认为是一类不能编码蛋白的长链RNA。由于其序列较长,所以可以有较大的潜力形成多种复杂构象,从而通过不同生物学途径发挥其作用。此外,由于其不具备蛋白编码能力,因此此类RNA也主要由其碱基序列形成的高级
如何在基因中选择合适的转录本?
一段基因的DNA序列,一般按从5’到3’的方向分别为:5’非编码区(图中黑色)、外显子(Exon,图中红色)与内含子(intron,图中浅蓝色)区、3’非编码区(图中黑色)等。而在从DNA转录到mRNA的过程中,其中的内含子会被剪切掉、而外显子区再次重新连接起来,最终形成的序列就是mRNA序列了。
人血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析
在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。在
“杨福家星”,命名!
7月17日是中国科学院院士、复旦大学前校长杨福家先生逝世两周年纪念日。当天上午,为深切缅怀杨福家的卓越贡献,传承他的科学精神、教育理念和高尚品德,“杨福家星”命名仪式暨《杨福家画传》发行仪式、“杨福家教育基金”启动仪式以及纪念杨福家先生逝世两周年学术报告会等多场活动在复旦大学举行。活动由复旦大学、中
北京生科院提出环形RNA全长转录本解析技术
4月12日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长
科研家提出环形RNA全长转录本解析技术
近日,中国科学院北京生命科学研究院赵方庆团队在《自然-实验手册》(Nature Protocols)上,发表了题为Full-length circular RNA profiling by nanopore sequencing with CIRI-long的研究论文,建立了环形RNA全长转录本解析
转录组测序与转录表达谱测序的异同
转录组测序可以得到特定条件下所有mRNA转录本的丰度信息,从而发现新的转录本和可变剪接体基因表达谱(gene expression profile):指通过构建处于某一特定状态下的细胞或组织的非偏性cDNA文库,大规模cDNA测序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群体组成,从而描绘该特
人转录组测序内参标准物质
通过转录组测序获得人的基因表达谱数据,能进一步挖掘疾病相关的生物标志物,为临床诊断提供依据。目前,由于转录组测序无法溯源,导致不同实验室及测序平台产出的数据可比性和测序结果的准确性面临挑战。 中国计量科学研究院推出的人转录组测序内参标准物质,包含了51个内参基因组成的两套基于比值的RNA内参混
唐本忠院士:发展先进功能性材料也是“硬道理”
“发光材料的研发十分重要。世界充满光,可以说人类最早的科学研究是从光开始的。高效发光材料不仅节省能源,还能应用于各个领域,可以说有无限的可能性。”近日,在北京理工大学和德国Wiley出版社联合举办的“专刊发布会暨AIE发展前沿学术研讨会”上,记者见到了“AIE材料之父”、香港科技大学教授、中科院
杨福家:科学与文史
如果我们观察一下世界一流顶尖大学,就会发现,其在科学上的贡献都与文化有关。世界上一流本科教育都把“做人”放在第一位。不管“做人”还是“修业”,都离不开文史与科学,离不开文史与科学的交融。而科学,特别是科学史与科学精神,同样充满着做人的道理。 “科学是一种文化” 在大
分子植物卓越中心揭示天然反义转录本调控机制
近期,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在Nature Communications上,发表题为Natural antisense transcripts of MIR398 genes suppress microR398 processing and a
生物活性物质的功能性评价的研究
以各种动、植物为原料提取的活性物质,一般为多种成分的混合物,在分离纯化的基础上,应采用现代科学方法和实验手段对其组分结构、功效及作用机制等进行深入研究。首先,应用以细胞工程、基因工 程、酶工程为主体的现代生物技术手段对各种天然生 物活性物质的理化性质、药用功效及其构效、量效关系进行系统研究,从分
干细胞技术实现全牙髓组织功能性再生
科技日报西安8月29日电 记者29日从空军军医大学口腔医院演示现场了解到,该院金岩教授率领的科研团队通过模拟牙发育原理,建立基于干细胞自组装的细胞聚合体技术,利用脱落乳牙干细胞成功实现了全牙髓组织的功能性再生,开展国际首个全长牙髓再生的临床研究并获得成功,其学术成果近日发表于《科学转化医学》上。
干细胞技术实现全牙髓组织功能性再生
科技日报西安8月29日电 记者29日从空军军医大学口腔医院演示现场了解到,该院金岩教授率领的科研团队通过模拟牙发育原理,建立基于干细胞自组装的细胞聚合体技术,利用脱落乳牙干细胞成功实现了全牙髓组织的功能性再生,开展国际首个全长牙髓再生的临床研究并获得成功,其学术成果近日发表于《科学转化医学》上。
干细胞技术实现全牙髓组织功能性再生
科技日报西安8月29日电 记者29日从空军军医大学口腔医院演示现场了解到,该院金岩教授率领的科研团队通过模拟牙发育原理,建立基于干细胞自组装的细胞聚合体技术,利用脱落乳牙干细胞成功实现了全牙髓组织的功能性再生,开展国际首个全长牙髓再生的临床研究并获得成功,其学术成果近日发表于《科学转化医学》上。
研究发现植物叶绿体基因组可以全部转录的新机制
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的重要细胞器,对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。中国科学院昆明植物研究所研究员高立志带领的研究团队,历时五年,通过对三种高等植物(水稻、玉米和拟南芥
全表达谱的定义
中文名称全表达谱英文名称global expression profile定 义反映待检样品中所有基因的表达情况的图谱。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
CCD全谱——全元素分析解决方案
传统光谱仪测量谱线-蓝色,M5000测量谱线-红色 万条谱线,全元素尽可展现 M5000可采集全谱信息,测量近万条谱线,分析范围全面,可用的分析灵敏线更多,能够测定金属分析行业需要分析的所有元素。 与通道式光谱仪相比,M5000免除了选择通道的烦恼,以更低的成本,获取对更多元素的分析检测能力。
神木医改:全民免费医疗全赖以民为本
自去年3月1日起,有40万人口的陕西省神木县在全县全面实施“免费医疗”。近日县委书记郭宝成在接受媒体采访时表示,即使是算“经济账”,政府也“赚了一大笔钱”。他说,花了1.5个亿,把老百姓看病的问题解决了,老百姓爆发出生产的热情与积极性,形成了巨大的社会合力,民生建设“也是一个高回报的投
构建“以生为本”的“三全育人”新格局
“9·5”泸定地震发生后,暑假返乡的西南大学研究生薛人铭,马上报名参加了抗震救灾青年突击队。青年突击队负责搬运救灾物资、分发应急物品、搭建临时帐篷,直到凌晨两三点钟才抽空打了个盹儿。早上五点多钟,薛人铭又赶到安置点的“青青儿童乐园”,为受灾孩子进行心理疏导。 新学期“开学第一课”,薛人铭参加抗
科学家成功解码鱼类胚胎中的新生转录本
上海海洋大学教授陈良标、胡鹏团队,在活体鱼类胚胎中实现了单细胞新生RNA测序技术的系统优化和应用,首次实现对“合子激活”阶段新转录基因的高灵敏度、高准确性检测,打开了研究生命起源奥秘的新窗口,也为水产育种的基因精准设计提供了重要工具。相关研究近日发表于《自然-通讯》。每个新生命的开始都经历过一次“主
北京大学PLOS生物信息学新成果
近日,北京大学分子医学研究所李川昀课题组与何爱彬研究员合作,在国际著名遗传学杂志《PLOS Genetics》发表一项重要研究成果,题为“Emergence, Retention and Selection: A Trilogy of Origination for Functional De
杨福家告别仪式举行
8月9日上午10时,中国共产党的优秀党员,著名核物理学家、教育家,中国科学院学部委员(院士),国际欧亚科学院院士,发展中国家科学院院士,中央文史研究馆资深馆员,第九届、第十届全国政协委员,第六届、第七届中国科学技术协会副主席,第五届上海市科学技术协会主席,复旦大学教授、博士生导师,复旦大学原校长杨福
杨福家:要做个诚信的人
在近日举办的“科学道德和学风建设”宣讲教育报告会上,中国科学院院士杨福家与学生们分享了几个亲身经历的关于“诚信”的故事,并反复告诫学生要诚信。 近日,为了加强上海地区研究生科学道德和学风建设,提高人才培养质量,上海市科协和上海市教委举办了主题为“科学道德和学风建设”的宣讲教育报