发布时间:2017-11-23 16:35 原文链接: 蛋白质核酸相互作用研究方法介绍

  蛋白质和核酸是组成生命的主要生物大分子,研究蛋白质-核酸相互作用、蛋白质-蛋白质相互作用是后基因组时代重要的研究领域之一。专注蛋白相关研究, 金开瑞可提供凝胶电泳迁移率EMSA、染色质免疫沉淀ChIP、RNA Pull Down / DNA Pull Down、荧光素酶报告基因、酵母单杂交等多种蛋白质-核酸相互作用研究服务,帮助您理清转录调控过程,预测互作蛋白,加速研究进程。1) 凝胶电泳迁移率EMSA        凝胶迁移或电泳迁移率检测(Electrophoretic Mobility Shift Assay,EMSA)是一种检测蛋白质和DNA序列相互结合的技术,可用于定性和定量分析;目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互作用,是转录因子研究的经典方法。  金开瑞提供EMSA检测技术服务,帮助您检测DNA结合蛋白、RNA结合蛋白、特定的蛋白质,并可进行未知蛋白的鉴定。2)染色质免疫沉淀ChIP        染色质免疫沉淀技术(Chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)是将样品中同抗体靶蛋白相互作用的DNA随免疫复合物沉淀,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,利用该技术不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用,还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰以及转录因子与基因表达的关系。3)RNA Pull Down / DNA Pull Down        蛋白质与RNA的相互作用是许多细胞功能的核心,如蛋白质合成、mRNA组装、病毒复制、细胞发育调控等。RNA Pull Down使用体外转录法标记生物素RNA探针,然后与胞浆蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。        金开瑞现提供RNA pull down/ DNA Pull Down检测技术服务, 使用特异性二抗进行检测,能有效避免抗体重链对结果的信号干扰。并且金开瑞配套有世界上最先进的质谱仪,能显著提升检测效果。4)荧光素酶报告基因        双报告基因用于实验系统中作相关的或成比例的检测,通常一个报告基因作为内对照,使另一个报告基因的检测均一化。理想的双报告基因方法应该使用户能够以萤火虫荧光素酶所具有的速度,灵敏和线性范围对同一样品中的两个报告基因同时测定。  金开瑞应用Promega 公司的双荧光素酶报告基因检测(DLR)系统,提供DLR检测服务。5)酵母单杂交        酵母单杂交技术最由酵母双杂交技术发展而来的,通过对报告基因的表型检测,分析DNA与蛋白之间的相互作用,以研究真核细胞内的基因表达调控。由于酵母单杂交方法检测特定转录因子与顺式作用元件专一性相互作用的敏感性和可靠性,现已被广泛用于克隆细胞中含量微弱的、用生化手段难以纯化的特定转录因子。          RNA Pull Down 在博客最早就进行了系统地介绍,也在上一篇lncRNA-ZFAS1扩增促进肝癌转移中应用到,实属现阶段研究蛋白质-核酸相互作用的常用手段。另外上一篇提到的RIP技术,虽然是利用抗原抗体特异性沉淀RNA-蛋白复合物,但最终目的是为了研究细胞内RNA 与蛋白结合情况,了解转录后调控网络动态过程,助力发现miRNA 的调控靶点。
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