蛋白质作为功能的直接行使者，已经被科研工作这广泛应用于不同领域中，目前蛋白组学有很多优秀的科研成果，在各个领域及期刊上发表，其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢？了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里，我们以“Proteomics”为关键词，共搜索到155,429篇文章，随机选取了2017-2021年共60,474篇文章中的10,000篇，针对蛋白组学进行整体分析（第1,2,4节）；同时，以“Proteomics”及各领域关键词联合搜索，对不同研究领域进行分析（第3节）。最终获取蛋白组领域的系统信息，希望对蛋白组学文章投稿有所助益。（本文分析基于从总体中随机抽取的一定数量文章，因此内容仅供参考）
1. 文章概述
首先对搜索到的文章进行时间维度的统计，从近10年来看，蛋白组学文章发文数量呈逐渐增加的趋势，整体上研究仍然火热。
图1 近10年蛋白组学文章发表数
接着以2017-2021近5年数据为基础，随机提取其中的10000篇文章，对蛋白组学发文期刊进行统计。发表文章数量大于50篇的期刊共23个，总计3695篇文章，平均IF=5.43，中位IF=4.379。发表最多的期刊是JPR (Journal of Proteome research)，MMB（Methods in Molecular Biology），JP (Journal of Proteomics)，Proteomics，MCP (Molecular & Cellular Proteomics)等，排名前几的期刊基本都是蛋白领域主流杂志，但相对而言影响因子大都不是很高。
图2 发表50篇以上蛋白组学文章的期刊
2. 文章发表期刊IF区间分布
在提取的10000篇文章中，对发文数目大于等于20篇的期刊IF区间进行统计，可以看到，整体上影响因子主要还是集中在0-5分，占57.97%，其次为5-10分，占比34.46%，10分以上多为一些综合期刊。
图3 文章发表期刊IF区间
3. 部分研究领域蛋白组学文章发表情况
以“cancer”为癌症关键词，对2017-2021年发表的蛋白组学文章进行查询，共查询到14903篇文章，不同年份发表情况整体上稳定增加。
图4 2017-2021癌症相关蛋白组学文章发表数
对发文量前20的期刊进行统计，排名靠前的仍以蛋白组学主流期刊以及组学综合期刊为主，平均影响因子IF=7.632，中位IF=6.281。
图5 2017-2021癌症相关蛋白组学文章发表数前20期刊
以“Diabetes”为糖尿病关键词，对2017-2021年发表的蛋白组学文章进行查询，共查询到2211篇文章，不同年份发表情况整体上逐年增加，2020年有较大增长。
图6 2017-2021糖尿病相关蛋白组学文章发表数
对发文量前20的期刊进行统计，以蛋白组学主流期刊，综合期刊，以及糖尿病领域期刊为主，平均影响因子IF=7.349，中位IF=5.501。
图7 2017-2021糖尿病相关蛋白组学文章发表数前20期刊
以“cardiovascular diseases”为心血管疾病关键词，对2017-2021年发表的蛋白组学文章进行查询，共查询到2565篇文章，2017-2021年间发文数量相差不大，基本在400篇以上。
图8 2017-2021心血管疾病相关蛋白组学文章发表数
对发文量前20的期刊进行统计，期刊以蛋白组学主流期刊，心血管主流期刊，综合期刊为主，同时含Circulation research，JACC等心血管领域顶级期刊，平均影响因子IF=9.213，中位IF=5.406。
图9 2017-2021心血管疾病相关蛋白组学文章发表数前20期刊
以“plant”为植物关键词，对2017-2021年发表的文章进行查询，共查询到6454篇文章，不同年份发表情况整体上也逐年增加。
图10 2017-2021植物相关蛋白组学文章发表数
对发文量前20的期刊进行统计，以蛋白质组学主流期刊，植物领域期刊为主，平均影响因子IF=5.416，中位IF=4.845。
图11 2017-2021植物相关蛋白组学文章发表数前20期刊
4. 不同IF区间期刊
2017-2021年近5年提取的10000篇文章中，发表蛋白组文章数大于等于20篇的期刊IF区间统计详细列表可以参照下表，参照杂志影响因子及发文数目，可以对投稿提供很好的参考价值。
5. 投稿建议及评述
目前蛋白质组学领域主流的杂志 MCP (Molecular & Cellular Proteomics)，JPR (Journal of Proteome research)，JP (Journal of Proteomics)，Proteomics等对于大规模蛋白质组学数据的严谨性都有非常高的要求，并且都要求在正文或者补充数据中写明实验设计以及数据分析的细节。而新颖的选题，严谨的实验设计以及更全面的分子机制和功能验证等都是蛋白组学研究发文的关键因素，下面对一些具体的期刊分三档进行一个简单介绍。
1）第一档期刊（影响因子10分以上）
组学期刊：Molecular Systems Biology，Nature Genetics等。
综合性期刊：cell，Nature，Science，Nature Communications，PNAS，Molecular Cell，Cell Research等。
组学思路：在这类高水平期刊中，组学驱动的研究主要包括：
1.大队列研究，筛选临床生物标志物。
2. 组学+目的基因后续深入、完整的功能机制研究。
3.大样本多组学或多样本类型多组学，大数据分析。
2）第二档期刊（影响因子5~10分）
组学期刊：Genomics Proteomics and Bioinformatics (GPB)，Molecular & Cellular Proteomics（MCP）等
综合期刊：Cell Reports，Frontiers in Microbiology，mSystems，Scientific Data等。
组学思路：这类文章除了单纯的组学数据分析外，比第三类期刊内容更丰富。通常要求大数据集，或数据分析完整性以及进一步功能验证及机制研究。
3）第三档期刊（影响因子5分以下）
组学期刊：BMC Genomics，Proteomics，Journal of Proteomics，Journal of Proteome Research等。
综合期刊：PLoS One等。
组学思路：这类文章一般是最常见也是最简单的组学研究思路。
1. 蛋白质组学方向：组学+差异蛋白WB或PRM验证。
2.蛋白质翻译后修饰组学方向：则以修饰组学数据分析为主。