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我国学者攻破高质量角苔参考基因组

苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支,是现存最早的陆生植物,代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来,人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和真菌广泛共生的特异现象而备受关注。 在中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室的布局与支持下,陈之端研究组于2008年启动了角苔基因组测序计划,多年来通过研究团队间密切合作,创新研究方法攻坚克难,终于在角苔基因组的解析上获得了突破。研究人员利用三代测序的Nanopore数据和二代测序的Illumina数据,通过一系列精细设计的去污染流程,得到了119 Mb (contig N50 796.64 kb,scaffold N50 1.09 Mb)的芽胞角苔(Anthoceros angustus) 基因组组装结果,获得了第一个......阅读全文

小小角苔 会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布

  中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程,得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果,获得了第一个高质量的角苔参考基因组,填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》(Nature Plants)上。图片来源于网络