我国学者攻破高质量角苔参考基因组
苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来，人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和真菌广泛共生的特异现象而备受关注。 在中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室的布局与支持下，陈之端研究组于2008年启动了角苔基因组测序计划，多年来通过研究团队间密切合作，创新研究方法攻坚克难，终于在角苔基因组的解析上获得了突破。研究人员利用三代测序的Nanopore数据和二代测序的Illumina数据，通过一系列精细设计的去污染流程，得到了119 Mb (contig N50 796.64 kb，scaffold N50 1.09 Mb)的芽胞角苔(Anthoceros angustus) 基因组组装结果，获得了第一个......阅读全文
小小角苔－会“借”基因——首个高质量角苔参考基因组发布
中国科学院植物研究所研究员陈之端团队通过一系列精细设计的去污染流程，得到了119 Mb的芽胞角苔基因组组装结果，获得了第一个高质量的角苔参考基因组，填补了苔藓类植物相关研究的空白。相关成果2月10日作为封面文章在线发表于国际学术期刊《自然—植物》（Nature Plants）上。图片来源于网络
我国学者攻破高质量角苔参考基因组
苔藓类包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，代表了植物演化过程中从水生到陆生的过渡类群。长久以来关于早期陆地植物的起源与植物登陆一直存在诸多争论和未解之谜。近年来，人们利用组学数据将早期陆地植物的系统位置争论聚焦到了角苔类上。角苔类以其难解的系统位置、衍生与原始兼具的形态特征、与细菌和
抗根肿病芜菁高质量参考基因组发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/4/478019.shtm 芸苔属植株在长期对抗根肿病菌的过程中CR基因的进化模型 课题组供图 近日，华中农业大学教授张椿雨、教授杨庆勇团队与沈阳农业大学教授朴钟云团队合作，发布了抗根肿病的欧
高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析完成
9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支撑。
首个野生大豆高质量参考基因组被解析
近日，香港中文大学林汉明教授团队及华大基因等多家国内外机构合作完成了全球首个野生大豆高质量参考基因组解析，该成果为挖掘野生大豆遗传资源和改良、优化栽培大豆品种提供了重要工具。相关研究成果近日在线发表于《自然-通讯》。图片来源于网络 基因组信息是当前作物改良计划的重要基础。过往大豆基因组研究主要
破译对虾基因组－获国际首个高质量对虾基因组参考图谱
由中国科学院海洋研究所相建海和李富花研究组主导的研究团队，与国内外多家单位共同合作，历时十年成功破译凡纳滨对虾基因组，获得国际首个高质量对虾基因组参考图谱，研究成果于1月21日在《自然-通讯》（Nature communications）在线发表，为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重
我国牵头完成高质量豌豆参考基因组和泛基因组解析
9月22日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外多家合作单位，成功绘制了中国豌豆基因组高质量精细物理图谱，构建了栽培和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、群体遗传结构，为揭示豌豆起源驯化，以及基因挖掘、种质创新、育种改良提供了宝贵资源及数据支
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
水生所发布高质量AB品系斑马鱼参考基因组
斑马鱼是生命科学、健康科学和环境科学等研究领域的重要模式生物之一。常见的两种实验室斑马鱼品系分别是Tubingen品系和AB品系。其中，AB品系斑马鱼被国内外很多实验室作为研究对象。然而，却缺乏一个高质量的AB品系斑马鱼参考基因组。 由于不同品系斑马鱼来源不同，各品系之间存在着大量基因序列上的
Frontiers－in－Genetics首个非性逆转黄鳝高质量基因组参考图谱
中国水产科学研究院长江水产研究所水产养殖与遗传育种研究室科研人员在国际期刊《遗传学前沿》（Frontiers in Genetics）发表题为《Chromosome-Scale, Haplotype-Resolved Genome Assembly of Non-Sex-Reversal Fem
具有独特浓郁风味的中国水蜜桃高质量参考基因组发布
近日，北京市农林科学院在《自然·通讯》上发表了研究论文，公布了具有独特浓郁风味的中国水蜜桃高质量参考基因组，阐释了以水蜜桃为代表的优质资源对于全球桃现代育成品种遗传贡献；揭示了桃风味改良过程中，东、西方对甜度趋同选择和酸度分化选择的模式，解析了重要基因在果实有机酸和可溶性糖积累中的功能。该研究提
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通
我国科学家发布海带高质量染色体水平参考基因组
近日，中国科学院海洋研究所海藻种质库团队在大型海藻基因组学研究方面取得重要突破，成功构建了海带的高质量染色体水平参考基因组。该成果发表在国际期刊《科学数据》。这是该团队在海洋经济藻类基因组研究领域取得的又一重要成果，为海带的遗传改良和基因组学研究提供了关键资源。海带孤雌生殖孢子体基因组组装 海洋
科学家首次发布银鲳高质量染色体水平参考基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日，中国科学院海洋研究所在银鲳基因组学研究方面取得新进展，首次发布了我国重要名贵经济鱼类——银鲳的高质量染色体水平参考基因组，相关研究成果在《自然》子刊《科学数据》在线发表。银鲳隶属
香港中文大学等解析全球首个野生大豆高质量参考基因组
香港中文大学林汉明团队和华大基因等多家机构合作，完成全球首个野生大豆高质量参考基因组解析。该成果为挖掘野生大豆遗传资源和改良、优化栽培大豆品种提供了重要依据。相关成果近日在线发表于《自然—通讯》。 “大豆的基因组含有大量重复区，组装时困难重重。我们整合了几种最新测序方法产生大量数据，才最终把问
研究发布首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
昆明动物所首个高质量染色体水平的哀牢髭蟾参考基因组
哀牢髭蟾（Vibrissaphora ailaonica）[Amphibiaweb（2019），Frost（2019）和中国两栖类（2019）将其归为Leptobrachium ailaonicum的同物异名] 俗称“胡子蛙”、“深山角怪”，属两栖纲、无尾目、角蟾科，是中国特有种。该物种具有多个
科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。
橡胶树（Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. ）是大戟科（Euphorbiaceae）植物。在植物界大约2,500种产胶植物中（如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh
高质量枸杞基因组被公开
2021年6月3日，Nature旗下期刊Communications Biology发表了宁夏农林科学院曹有龙研究员团队与福建农林大学刘仲健教授团队等合作完成的“Wolfberry genomes and the evolution of Lycium (Solanaceae)” 的重要成果。该
西藏大学等在线发布了第一个藏族人群高质量参考基因组
10月23日，《国家科学评论》杂志在线发布了第一个藏族人群高质量参考基因组。该成果是中国科学院昆明动物研究所宿兵课题组、西藏大学欧珠罗布与崔超英课题组、中国科学院上海营养与健康研究所徐书华课题组、青海省高原医学科学研究院吴天一课题组等，经过两年多联合攻关完成的藏族人群高原适应研究的又一阶段性成果
首个葡萄完整参考基因组发布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503617.shtm近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所作物组学大数据与应用创新团队联合国外科研团队，绘制了首个葡萄完整参考基因组图谱。研究成果以封面文章发表在《园艺研究》（Horticulture
首个葡萄完整参考基因组发布
记者从中国农科院获悉， 该院的深圳农业基因组研究所作物组学大数据与应用创新团队联合国外科研团队，于近日绘制了首个葡萄完整参考基因组图谱。 该研究成果作为封面文章发表在《园艺研究（Horticulture Research）》上，以致敬沃森和克里克提出DNA双螺旋结构模型七十周年。 据介绍，该
濒危植物报春苣苔交配系统转变基因组效应获揭示
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/10/488438.shtm 近日，中国科学院华南植物园植物科学研究中心研究员康明团队以苦苣苔科报春苣苔（Primulina tabacum）为对象，研究揭示了濒危植物报春苣苔交配系统由异交向自交转变的基因
谷子高质量图基因组“面纱”揭开
谷子即小米，起源于中国，作为粮食作物深受老百姓喜爱。近日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用团队，通过对谷子种质资源的基因组分析，组装了首个谷子高质量图基因组，系统阐明了谷子起源及驯化改良的过程，并创制了谷子图基因组精准高效育种方法，为培育谷子突破性品种提供了理论基础和
高质量向日葵基因组“来了”
英国《自然》杂志5月21日发表论文称，法国卡斯塔内托洛桑国家农业研究院科研人员测序获得了高质量的向日葵参考基因组，这在此前是非常难以完成的。这一资源将为未来的研究提供帮助，有助于人们在考虑到农业限制因素和人类营养需求的前提下，利用遗传多样性改善向日葵的抗逆性和产油量。 向日葵是一种全球性的油料
高质量沙漠蝗虫基因组测序完成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/6/481733.shtm 近日，美国农业部农业研究院（ARS）的一项研究公布了第一个高质量沙漠蝗虫基因组。这项研究是ARS的Ag100Pest计划的一部分。该计划旨在破译对农业和环境产生影响的100种害虫
高质量的巴戟天基因组图谱发布
中药材巴戟天来源于茜草科植物巴戟天（Morinda officinalis How）的干燥根，是我国著名的“四大南药”和“十大广药”之一，具有1700余年药用历史，并收载于历版《中华人民共和国药典》。巴戟天在广东省的栽培面积最大，产量占全国总产量的90%以上，肇庆市高要、德庆等地为历史道
科学家发表苔藓多样性、系统发育和适应性综述
近日，中国科学院植物研究所科研人员与合作者在《实验植物学杂志》上发表了基于基因组和转录组数据针对苔藓植物的多样性、系统发育和适应性研究的综述，该综述对目前已经发布的14个苔藓植物的基因组和151个苔藓植物的转录组进行了总结和梳理。 苔藓植物包括苔、藓和角苔三大分支，是现存最早的陆生植物，为
芸苔的概述
芸薹（拉丁学名：Brassica campestrisL.），十字花科芸苔属植物。它为二年生草本，高30~90厘米，叶柄宽，长2~6厘米，基部抱茎。其总状花序在花期成伞房状，以后伸长；花鲜黄色，直径7~10毫米；萼片长圆形，长3~5毫米，直立开展，顶端圆形，边缘透明，稍有毛。它产于陕西、江苏、安
芸苔的简介
芸薹（拉丁学名：Brassica campestrisL.），十字花科芸苔属植物。它为二年生草本，高30~90厘米，叶柄宽，长2~6厘米，基部抱茎。其总状花序在花期成伞房状，以后伸长；花鲜黄色，直径7~10毫米；萼片长圆形，长3~5毫米，直立开展，顶端圆形，边缘透明，稍有毛。它产于陕西、江苏、安