PNAS:“破译”DNA的更好方法

越来越多的研究表明,转录因子与DNA结合位点的突变与疾病有关。然而现有的测序技术并不能解析这些位点信息。现在,哥伦比亚大学的科学家们开发出一种计算工具,能够解析基因组中最难翻译的部分。有了这个工具,科学家们可以更深入地了解DNA指导生长发育、衰老、疾病等所有的生命过程。利用NRLB,逐渐消除低亲和结合位点(从左往右),从而逐渐降低基因表达(白色)。(图片来源:Mann Lab/Columbia's Zuckerman Institute) “即便是简单的生物,依然有大量基因信息因为技术的局限而未能被破译。” 哥伦比亚大学Mortimer B. Zuckerman心理大脑行为研究所的首席研究员Richard Mann表示,“让我们开心的是,新算法能够扫描数百万行的遗传密码,甚至于能够识别出最微弱的信号,从而更完整地绘制DNA编码的蓝图。” Hox基因 DNA中隐藏着太多的秘密,其中一个谜团涉及一个特别普遍的基因,......阅读全文

PNAS:科学家找到更好“破译”DNA秘密的方法

  十分之一的人类基因会表达一种特殊的蛋白——转录因子(TFs),通过与基因组结合读取相应区域DNA 信息。这一结合是调控基因表达与否的关键。4月初,《PNAS》期刊最新发表一篇文章,揭示了一种新的计算工具,可以完美量化基因组中这一“蛋白-DNA”的结合。   利用NRLB,逐渐消除低亲和结合位点

PNAS:“破译”DNA的更好方法

  越来越多的研究表明,转录因子与DNA结合位点的突变与疾病有关。然而现有的测序技术并不能解析这些位点信息。现在,哥伦比亚大学的科学家们开发出一种计算工具,能够解析基因组中最难翻译的部分。有了这个工具,科学家们可以更深入地了解DNA指导生长发育、衰老、疾病等所有的生命过程。利用NRLB,逐渐消除低亲

各物种的Hox基因

果蝇果蝇(这里指黑腹果蝇)的Hox基因皆位在其3号染色体右臂上,可分为两个群集。一群称作双胸复合群(Bithorax complex,BX-C),此群集中的Ubx基因若突变,会使第3胸节(T3)变成第2胸节(T2),而且由于正常状态下的翅膀是长在T2之上,因此这样的突变同时会使果蝇长出两对翅膀,并使

Hox基因的定义和作用机制

Hox基因(英语:Hox genes)全名同源基因(英语:homeotic genes)或同源异型基因。是生物体中一类专门调控生物形体的基因,一旦这些基因发生突变,就会使身体的一部分变形。其作用机制,主要是调控其他有关于细胞分裂、纺锤体方向,以及硬毛、附肢等部位发育的基因。Hox基因属于同源异型盒(

Cell-Rep:科学家发现Hox如何控制摄食行为

  在生物黑腹果蝇实验模式中,海德堡大学生物学家对果蝇如何编码和控制摄食行为有了新的见解。博士教授领导的研究小组关于生物有机体研究中心(COS)研究Hox基因家族特殊的发展基因的功能。这个基因对维持果蝇头部运动单位至关重要,包括肌肉和刺激果蝇进食的神经元。如果Hox基因的功能有损坏或有缺陷,没有或只

调节基因的作用

控制另一些远离基因的产物合成速率的基因。能控制阻碍物的合成,后者能抑制操纵基因的作用,从而停止它所控制的操纵子中的结构基因的转录。这种基因,主要的功能是产生一类抑制物,以制约其他基因的活动。也就是,一段有效的DNA片段,它可转录翻译而产生调节蛋白,该蛋白质与操纵基因相互作用,而对操纵子的活动进行控制

关于调节基因的基本作用介绍

  控制另一些远离基因的产物合成速率的基因。能控制阻碍物的合成,后者能抑制操纵基因的作用,从而停止它所控制的操纵子中的结构基因的转录。这种基因,主要的功能是产生一类抑制物,以制约其他基因的活动。也就是,一段有效的DNA片段,它可转录翻译而产生调节蛋白,该蛋白质与操纵基因相互作用,而对操纵子的活动进行

Cancer-Dis:白血病治疗新方法让癌基因变“乏力”

  2016年10月15日/生物谷BIOON/--一些基因的重新激活会导致造血干细胞发生异常自我更新从而发生白血病,这些与自我更新有关的基因发生异常激活可能由DNA包装过程中的一些结构性修饰引起。最近一项研究发现有两种染色质调节因子能够介导这些表观遗传修饰的变化,并且白血病细胞非常依赖这两种因子。 

合肥研究院城市HOx自由基观测与模拟研究取得进展

  近期,中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所研究员谢品华课题组在大城市OH和HO2自由基观测与模拟研究方面取得新进展,相关研究成果发表在Science of the Total Environment上。  自由基是大气二次污染生成的核心驱动力,基于目前大气复合污染的现状,我国开始重

中国医学科学院最新文章解析HOX基因表达模式

  “核心刊物”迎来了新期刊:科学通报,中国科学C辑:生命科学,这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的,我国学术期刊中的知名品牌,被国内外各主要检索系统收录,如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等;美国的SCI、CA、EI,英

Nature发表衰老研究成果:胚胎基因再激活导致肌肉衰老

  生物通报道:发育基因和途径严格调控着胚胎的发育。这个过程是由所谓的Hox基因强烈驱动的。现在,来自德国Leibniz老化研究所(FLI)的研究人员发现,这些基因当中的一个——Hoxa9,在老年时期被重新激活。这限制了肌肉干细胞的功能,因此,限制了骨骼肌的再生能力。具有讽刺意味的是,这些研究结果表

解读BhCTLA4/hOX40双免疫检查点人源化小鼠

导读随着肿瘤免疫疗法应用如火如荼地展开,不同抗体药物之间的联合用药开始被大家关注。而抗体药物联用的药效究竟如何?探究的过程中难免要用到双免疫检查点的人源化小鼠。今天就为大家介绍一种双免疫检查点人源化小鼠——B-hCTLA4/hOX40小鼠。基因背景细胞毒T淋巴细胞相关抗原4(CTLA4, cytot

人源化小鼠BhOX40L-mice对免疫治疗新进程的影响

  Hello,艾瑞巴得看官们,又到了收获知识的时刻啦,小编想想就很激动,真是迫不及待的想要分享今天的主题,话不多说,放大招——那就是我们的明星人源化小鼠“B-hOX40L mice”,一起来简单了解下吧~   基本信息   基因功能简介   OX40L(又称CD134L

人源化小鼠BhOX40L-mice对免疫治疗新进程的影响

基本信息 基因功能简介OX40L(又称CD134L或CD252)是肿瘤坏死因子受体超家族成员4(OX40)(又称CD134或TNFRSF4)的配体,含183个氨基酸(胞外139个氨基酸,跨膜21个氨基酸,胞内23个氨基酸),属TNF家族成员,为Ⅱ型跨膜糖蛋白,在许多抗原呈递细胞如DC2s、巨噬细胞、

我国学者揭示海洋软体动物发育演化机制假说

  近日,美国科学院院刊PNAS在线刊发海洋所刘保忠研究组题为“Dorsoventral decoupling of Hox gene expression underpins the diversification of molluscs”的研究论文。该研究基于Hox基因在软体动物早期发育中的表达

人源化小鼠OX40评估抗体体内药效的有力工具

  hello,大家好呀,炎炎夏日,没有小编的产品推广,想必你们一定不适应。近年来免疫检查点药物成为癌症治疗中一类重要新药,今天就为各位宝宝们介绍一种免疫检查点人源化小鼠,同时作为小编内心的消暑神器——hOX40小鼠。当当当,那我们就赶紧进入正题吧~   OX40基因功能简介   OX40,又名

人源化小鼠OX40——评估抗体体内药效的有力工具

OX40基因功能简介OX40,又名Tnfrsf4(Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4),主要在表达于激活的CD4+和CD8+T细胞表面,和OX40配体结合可以刺激CD8+T细胞的活化。通过OX40/OX40L信号的共激活效应,T细

英国研究人员研制出治癌新药HXR9

针对与癌症有关的基因表达,英国专家研制出一种治癌新药,并且发现了有望用于前列腺癌检测的一种新方法。 据英国科学促进会主办的“阿尔法伽利略”科学网站报道,英国萨里大学的研究人员研制的这种新药名为HXR9,它可以抑制一种叫做HOX的基因的活动。 研究人员说,HOX基因对确定早期胚胎中细胞和组织的特性至关

PLoS-Genet:新研究为揭示遗传性疾病的发病机制提供希望

  近日,来自麦基尔大学等处的研究人员通过研究,揭示了染色质结构对于控制基因活性,尤其是胚胎的正常发育的重要性,相关研究刊登于国际著名遗传学杂志PLoS Genetics上,这项研究对于揭示遗传性疾病的诊断及发病机制有着重要的意义。   机体中的每一个细胞都包含有完整的一套DNA遗传信息,研究

免疫激活剂靶点界之星——OX40靶点

基因背景OX40,又名Tnfrsf4(Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4),主要在表达于激活的CD4+和CD8+ T细胞表面,和OX40配体结合可以刺激CD8+ T细胞的活化。通过OX40/OX40L信号的共激活效应,T细胞的功能

PNAS:科学家阐明维持细胞平衡状态的遗传互作机制

  近日,一项刊登于国际杂志PNAS上的研究报告中,来自美国密苏里州托瓦斯医学研究所(Stowers Institute for Medical Research)的研究人员通过研究发现,与调节性基因“互相交流”进行竞争或能帮助维持细胞状态的平衡;相关研究或为研究人员提供Nanog基因和Hox基因之

科学家发现一种“神奇”蛋白:可控制基因-应对多重病症

  为了维持肌体内所有类型细胞的正常发育及功能,身体需要谨慎控制一些基因的开启或关闭。近日,墨尔本科学家首次展示了一种叫做SMCHD1的蛋白,它在基因调控过程中发挥着重要作用,在必要时将需要抑制的基因聚集到特定区域,并在该区域有效禁用它们的功能,从而有助于监控身体健康。   这项发现于8月20日以

科学家发现一种“神奇”蛋白:可控制基因-应对多重病症

  为了维持肌体内所有类型细胞的正常发育及功能,身体需要谨慎控制一些基因的开启或关闭。近日,墨尔本科学家首次展示了一种叫做SMCHD1的蛋白,它在基因调控过程中发挥着重要作用,在必要时将需要抑制的基因聚集到特定区域,并在该区域有效禁用它们的功能,从而有助于监控身体健康。   这项发现于8月20日以

科学家发现一种“神奇”蛋白:可控制基因-应对多重病症

  为了维持肌体内所有类型细胞的正常发育及功能,身体需要谨慎控制一些基因的开启或关闭。近日,墨尔本科学家首次展示了一种叫做SMCHD1的蛋白,它在基因调控过程中发挥着重要作用,在必要时将需要抑制的基因聚集到特定区域,并在该区域有效禁用它们的功能,从而有助于监控身体健康。   这项发现于8月20日以

百奥赛图带您解读BhCTLA4/hOX40双免疫检查点人源化小鼠

  导读    随着肿瘤免疫疗法应用如火如荼地展开,不同抗体药物之间的联合用药开始被大家关注。而抗体药物联用的药效究竟如何?探究的过程中难免要用到双免疫检查点的人源化小鼠。今天就为大家介绍一种双免疫检查点人源化小鼠——B-hCTLA4/hOX40小鼠。   基因背景    细胞毒T淋巴

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定2

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法(双脱氧链终止法)和Maxam(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都同样生成相互独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组核苷酸都有共同的起点,却随机终止于一种(或多种)特定的残基,形成一系列以某一特定核苷酸

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定1

㈣ DNA聚合酶 如前所述,选用合适的DNA聚合酶进行测序反应也是保证测序质量的重要因素之一。常用于双脱氧末端终止法测序的有几种不同的酶: 1.大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow片段) 此酶是最早用于建立Sanger测序的酶。但通常会有两个问题:①Klenow片段的持续合成能力较

DNA重组(DNA-recombination)技术:DNA序列测定3

2.利用末端转移酶和α-32P-ddNTP标记DNA的3ˊ-末端 在二价阳离子存在下,末端转移酶催化dNTP加入DNA分子的3ˊ-羟基末端,如果作为底物的核苷酸经过修饰(如ddNTP),则可以在DNA的3ˊ-OH上仅加入一个核苷酸。对于双链DNA片段,亦存在DNA的两侧均被标记问题,可通过上述同

DNA重组技术(DNA-Recombination)

一、DNA 的酶切与连接(1)酶切反应:同质粒DNA 的鉴定,只不过是质粒DNA 换为载体DNA 。若大量酶切,则成比例增加。(2)加2倍体积的预冷无水乙醇和1/10体积的3mol/l NaAc混匀,-20℃2h以上。(3)15000rpm离心15min,弃上清。(4)加入75%乙醇洗涤2次,离心弃