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人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

文章导读 m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Acid Research (IF=11.147)杂志上发表了一篇文章Dynamic landscape and evolution of m6A methylation in human, 通过对9种人类组织的m6A测序,分析了m6A甲基化位点在不同组织中的分布特点、潜在调控机制和进化。 发表期刊:Nucleic Acids Research 影响因子:11.147 发表时间: 2020.5.14 实验方法: m6A-seq, RNA-seq 文章链接:Dynamic landscape and ......阅读全文

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(一)

文章导读m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucleic Aci

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(二)

5.进化角度分析人类m6A修饰位点作者通过比较人鼠之间保守m6A位点比例和保守对照A比例,来评估CDS区域m6A位点面临的自然选择压力,发现发生于第 一个密码子处的m6A的周围序列保守程度低,可能由于此处的m6A会带来不利的影响比如影响tRNA结合,而发生于第三个密码子处的m6A则受到进化选

揭示了m6A RNA修饰的新的进化意义

  无义介导的RNA降解(Nonsense-mediated decay, NMD)是真核生物一种重要的mRNA质量控制方式,细胞通过检验终止密码子与最后一个剪接接头的距离是否超过55nt来判断该终止密码子是否为提前终止密码子(Premature Termination Codon, PTC)从而决

Nature Aging:揭示调控灵长类器官衰老的表观转录组机制

m6A是目前已知的真核细胞mRNA上最常见的一类化学修饰,其建立、读取和擦除分别受到相应甲基化酶(writer)、结合蛋白(reader)以及去甲基化酶(eraser)的动态可逆调控。研究表明,m6A能够通过调节mRNA的剪接、出核、稳定性以及翻译等生命周期活动,参与调控机体的诸多生理或病理进程,包

持续进化中的现代人类

  很多人认为进化需要几千年甚至上百万,但生物学家知道,进化也可能会发生的很快。现在,由于基因组操作技术的革命,研究人员可以追踪种群水平的遗传变化,这些遗传变化可能最终会表现出进化的特征。在刚过去的基因组生物学大会上,新的研究指出,人类的基因组在近几百年来发生了很大变化。这种基因组层面的变化,最终导

Nature:人类早期胚胎发育过程中的染色体结构动态变化

   染色体三维结构是重要的表观遗传因素,与基因的表达调控密切相关。研究染色体三维结构在人类精子及早期胚胎中的动态变化和调控分子对于深入理解人类胚胎发育有重要的理论和临床意义。  人类个体发育从精卵结合形成受精卵开始,经历早期胚胎发育过程,由一个细胞逐渐分裂分化形成一个含有上百种细胞类型、多种器官的

RNA甲基化促进草莓成熟

  果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素

首次揭示人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化

  《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组研究所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果。  该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化,并发现CTCF蛋白对于早期胚胎发育中拓扑相关结构域(TAD结构)有着重要的调控功能,为进一步揭示人类胚胎发育机