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随着人类和许多其他物种基因组测序工作的完成，生物学家开始将研究重点转移到调控基因如何开启和关闭功能基因的表达上，该类研究的进行需要依靠新技术和新工具的发明应用。近期在《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上发表的相关文章表明，美国佛罗里达州立大学国家高磁实验室研究人员与加拿大阿尔伯塔大学、加州大学圣地亚哥分校的研究者们分别通过创造出两个荧光蛋白和提高蛋白稳定性的方法使研究人员能够更简便地观测细胞的生命活动。 美国国家高磁实验室的生物学家迈克尔·戴维森和克里斯滕·黑兹尔伍德与阿尔伯塔大学的研究者共同创造出了两个新的荧光蛋白生物传感器，通过该类分子信号人们可以清楚分辨细胞中是否存在生命活动。生物传感器可以被同时用于检测一个细胞中的两个独立的动态活动，这对于理解不同的蛋白和酶是如何共同工作并完成日常功能、帮助细胞生长和分化起着关键作用。这一生物传感器的应用，能够帮助研究人员对肿瘤与发育生物学领域的课题进行深入研究。 ......阅读全文
DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学 的研究热点和难点。转化为数学问题，分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构，结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题，所采用的方法包括通过可视
基因组测序项目为人们提供了丰富的信息，让人们可以解析基因表达的调控序列，研究不同基因序列对疾病的影响。不过除了基因组序列之外，还存在着一个关键元素，即基因组的空间构象。空间构象一直被视为基因表达的重要调控因素，在基因组中调控元件往往并不再目标基因附近，近年来科学家们开始借助新兴技术研究远距离染色
每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时，Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司，研究者们把自己使用的分子工具存放在这里，以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出，一篇大热的论文一发表，几分钟内他们就
每当有新的CIRSPR-Cas9相关文章发表时，Addgene公司的工作人员就会迫不及待地研读。Addgene是家非盈利公司，研究者们把自己使用的分子工具存放在这里，以供其他科学家们尽快使用这一技术。Addgene公司执行董事Joanne Kamens 指出，一篇大热的论文一发表，几分钟内他们就
在百度上输入“肝癌”二字，除了一些百科性质的内容，常常还能看到“肝癌晚期能活多久”，“家人得了肝癌怎么办”，或者是“肝癌真的没得救了吗”之类的检索项。作为最常见的恶性肿瘤，原发性肝癌也许对于其它国家来说只是恶性肿瘤排行榜的一个名字，但是对于占据了全球一半新发肝癌病例的中国来说，这种疾病好似触手
图片来源：基因型—组织表达项目 15项研究讲述了科学家10年的努力。 这个名为基因型—组织表达（GTEx）的项目，致力于解释大规模遗传研究中发现的DNA变异如何影响性状和疾病。研究人员用长达10年的时间，将人类2万个编码蛋白质的基因的活性水平与数百万条调控DNA序列的变异联系起来。 瑞士日内瓦
一项最新研究发现，爪蟾胚胎在发育早期并不能完全控制基因的开启和关闭，但它们的母亲可以通过卵细胞内一些特殊蛋白控制胚胎内基因表达。来自荷兰奈梅亨大学的生物学家在国际学术期刊Nature Communication上发表了这一结果。 爪蟾胚胎不仅从母亲那里得到一半的遗传信息，还得到了如何"使用"D
通过研究胚胎干细胞调节DNA包装的机制发现了一个心脏形成的新调控因子。科学家们说发现这种发现遗传调控因子的方法或许有能力提供关于身体内所有组织如肝、脑、血液等等形成的深入了解。 干细胞有潜力成为所有的细胞类型。一旦做出选择，这种细胞和其他的干细胞坚持一样的命运划分形成器官组织。 一个
通过研究胚胎干细胞调节DNA包装的机制发现了一个心脏形成的新调控因子。科学家们说发现这种发现遗传调控因子的方法或许有能力提供关于身体内所有组织如肝、脑、血液等等形成的深入了解。 干细胞有潜力成为所有的细胞类型。一旦做出选择，这种细胞和其他的干细胞坚持一样的命运划分形成器官组织。 一个
λ噬菌体是最常见的一种感染大肠杆菌的温和噬菌体，称为生物界的氢原子，它典型的调控机制使其成为生物学家研究基因调控及细胞分化最优异的模型。互相抑制的转录因子CI和Cro的相互作用决定了细胞的命运（即细胞最终处于裂解发育还是溶源发育）。尽管在过去几十年，λ噬菌体调控系统有所报道，但其调控机制仍然没有
胚胎干细胞具有变成任何身体细胞类型的潜能，其命运是由基因，结合DNA的蛋白质和修饰这些基因与蛋白质的分子之间复杂的相互作用所决定。 在发表于9月13日《细胞》(Cell)杂志上的一篇新研究论文中，来自麻省理工学院和加州大学旧金山分校的生物学家们概述了这些相互作用是如何指导干细胞发育形成成熟
近年来，合成生物学发展迅速，研究人员给微生物设计的功能也越来越复杂，但在细胞行为的可预测性、安全性和高效性方面仍有很多难以解决的问题。据每日科学网站5月30日（北京时间）报道，美国能源部劳伦斯伯克利国家实验室生物学家创造出一种能放大RNA（核糖核酸）转录信号的变体，可大大简化控制细胞行为的生物线
如果我们可以编程活细胞，让其做我们想要它们在体内完成的工作将会怎样？拥有这样的控制权是合成生物学的一个主要目标（Nature methods：合成生物学 ），其将帮助开发出一些细胞疗法，在某一天有可能替代传统药物来治疗诸如癌症等疾病。为了达到这个长远的目标，科学家们必须首先学会编程细胞所做的许多
20年前，当人类基因组草图完成测序后，不少科学家曾自信地认为，人类将很快搞清基因组中蕴藏的秘密，找到不同疾病背后的根源。然而很快，他们意识到自己错了。人不仅是基因的产物，更是基因调节的产物。如果将人类的基因组比作是一本说明书，其中只有1%-2%介绍了生命元件——蛋白质要怎么制造。剩下的98%-9
我国科学家在合成生物学与光遗传学前沿领域获得重要突破，发明了一种简单实用的光调控基因表达系统，将可以广泛应用于基础研究领域，并可能用于光动力治疗。国际权威学术期刊《自然—方法学》2月12日在线发表了华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室、药学院杨弋课题组独立完成的这项研究成果。 据悉，这
长久以来，科学家受到一个问题的困扰：在进化过程中，控制胚胎发育的基因调控程序是一次性“创生”多次利用，还是在不同物种中各自形成了不同的新程序？据《每日科学》4月17日报道，最近，澳大利亚和美国的一个联合小组通过对一种关键转录因子结合位点的研究发现，调控生物中胚层发育的基因程序一直是
研究人员研制出一种分子开关，能够可逆控制哺乳动物基因的开启和关闭，控制基因的表达水平，将对生物学过程和疾病相关基因的研究的精确度提高到一个更高的水平。详细内容刊登于上周《Cell》。 作者对这项研究“允诺了很多，”明尼苏达大学Perry Hackett（未参与研究）说，“他们兑现了允诺。” 研究
随环境改变“脾气”的小蜜蜂 几年前，美国伊利诺斯大学阿巴纳香槟分校昆虫学系的吉恩·E·鲁滨逊教授，请墨西哥南部的伙伴帮他捕获了1000只新生的小蜜蜂——500只性情温和的意大利蜜蜂和500只生性凶猛的非洲蜜蜂。这两个蜜蜂亚种在基因上相似得几乎难以分辨，但后者却在领地防御上厉害很多。 鲁滨逊
日复一日、年复一年，我们的基因不断地和我们所生活的环境、邻居、家人，以及我们自己的心态“对话”。这些社会性互动的结果会进入我们细胞的控制室，改变基因的强弱表达，从而影响我们的习性、行为、生理、心理与健康。美国知名科学作家戴维·多布斯日前撰写了《基因的社会生活——改变你的分子组成》一文，介绍了科学
RNAi技术RNA干扰(RNA interference， RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术，它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA， siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象，其本质是siRNA与对应
纽约大学医学院的研究团队进行了一个浩大的工程，对引发克罗恩病、多发性硬化症和关节炎等炎症疾病的T细胞进行了研究，揭示了这种细胞的分化过程及其影响临床症状的机制。 “我们发现了数百个与T细胞功能和发育有关的新基因，”文章共同作者，纽约大学基因组和系统生物学中心的副教授Richard Bo
十年前，基因的表达看上去是那么的简单：基因被开启或被关闭，不能同时开启又关闭。之后时间到了2006年，一个重磅级的发现指出，在小鼠胚胎干细胞中的发育调控基因可以即激活基因，又抑制基因，这样的基因被称为“二价标记基因(bivalently marked genes)”，在发育和分化过程中可以有
研究团队通过单分子测序揭示了鹦鹉基因组的特殊区域，并采用第二代测序技术对单分子测序数据进行了修正。文章发表在7月1日Nature Biotechnology杂志网站上。 如今单分子测序技术炙手可热，这一新技术能生成超长的测序读段，“能更容易拼装基因组的复杂部分，”文章的共同作者Duke
来自慕尼黑大学(LMU)的研究人员在一项针对夜行动物视网膜细胞的研究中，取得了关于基因组DNA组装的一些基础认识，揭示了核膜影响细胞核结构和基因调控的机制。这一研究结果发表在1月31日的《细胞》(Cell)杂志上。 构成遗传物质的双链DNA分子缠绕着蛋白质复合物形成致密的“染色质”。
在青蛙开始发育的时候，青蛙胚胎并不能完全控制它们将要打开或关闭哪些基因——而是它们的母亲，通过卵细胞中特定的蛋白质做到了这一点。12月18日，荷兰内梅亨大学的分子发育生物学家在《Nature Communications》公布了这些研究结果。 青蛙胚胎不仅能接收来自母亲的基因信息，而且还接收关
在青蛙开始发育的时候，青蛙胚胎并不能完全控制它们将要打开或关闭哪些基因——而是它们的母亲，通过卵细胞中特定的蛋白质做到了这一点。12月18日，荷兰内梅亨大学的分子发育生物学家在《Nature Communications》公布了这些研究结果。 青蛙胚胎不仅能接收来自母亲的基因信息，而且还接收关
在青蛙开始发育的时候，青蛙胚胎并不能完全控制它们将要打开或关闭哪些基因——而是它们的母亲，通过卵细胞中特定的蛋白质做到了这一点。12月18日，荷兰内梅亨大学的分子发育生物学家在《Nature Communications》公布了这些研究结果。延伸阅读：中美学者：解密胚胎发育的软件。 青蛙胚胎不
来自杜克大学生物学系，基因组科学与政策研究院（Institute for Genome Sciences and Policy）的研究人员发现人类和黑猩猩之间的差异并不如我们之前认为的那么大——其中99%都是相同的，而且令科学家们惊讶的是，人之所以成为人，并不是由于基因差异，而是由于这些基因如何被利
基因可能是细胞核中的主角，但如果没有强有力的配角阵容，它们也将永远无法发光。随着DNA调控剂（增强子）的延展，将帮助基因在正确的时间和位置启动。尽管研究人员像狗仔队追踪好莱坞明星一样详细调查了基因，增强子依然身处幕后，其工作原理仍然成谜。不过，近日举行的遗传学会议可能将改变现状：研究人员描述了
人体的基因表达是一个复杂的过程，那么多的基因不可能都总是持续表达。指挥基因表达的功臣之中就包括几种RNA分子。MicroRNA（miRNA）是一类真核生物内源性的小分子单链RNA，它是一种古老的、生死攸关的基因调节因素，30-60%的哺乳动物蛋白质编码基因都受miRNA的调控（主要是基因沉默调控