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使用AgilentFemtoPulse系统对用于生物样本库样品...(二)

基因组质量值 (GQN)GQN 用数值表示 gDNA 质量,代表了高于分子量阈值样品的比例。高度完整的 gDNA 的分子量会随包括物种在内的许多因素而变化。因此,在需要分析不同分子量的 gDNA 时,能设置 GQN 分子量阈值是一项巨大的优势。用户可以根据具体样品确定分子量阈值,以便客观判断哪些样品可用于下游操作。根据 gDNA 样品 A 和 B 的分子量分布, 将 GQN 分子量阈值设定为 10000 bp。GQN 在不同稀释比例组中保持一致,数值集中在 9.0 至 8.8 之间(图 2)。GQN 9.0 表示高于 10000 bp 阈值的样品占90%。也就是说,有 10% 的样品低于阈值水平。随着时间的推移,样品 GQN 的降低表明已经发生了降解。在图 3 中,将剪切 gDNA PacBio 样品的 GQN 分子量阈值设为 30000 bp,表明评价 gDNA 质量时 GQN 的灵活性。30000 bp ......阅读全文

使用Agilent Femto Pulse系统对用于生物样本库样品...(二)

基因组质量值 (GQN)GQN 用数值表示 gDNA 质量,代表了高于分子量阈值样品的比例。高度完整的 gDNA 的分子量会随包括物种在内的许多因素而变化。因此,在需要分析不同分子量的 gDNA 时,能设置 GQN 分子量阈值是一项巨大的优势。用户可以根据具体样品确定分子量阈值,以便客观判断

使用Agilent Femto Pulse系统对用于生物样本库样品...(一)

使用Agilent Femto Pulse系统对用于生物样本库样品的基因组DNA进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 摘要核酸样品的质量保证和质量控制对于生物样本库和进行基因组相关操作的实验室以及多种分子生物学应用必不可少。革命性的

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(二)

Femto Pulse 系统使用基因组 DNA 165 kb扩展法来分离大于 80 kb 的提取 gDNA(图 1)。使用 Agilent ProSize 数据分析软件上的 Smear Analysis 选项卡分析 gDNA 的分子量分布。弥散条带分子量分布包含整个弥散条带范围内的浓度分布。

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进...(一)

采用Agilent Femto Pulse系统对不同基因组DNA提取进行质量评估作者Chava Pocernich,Jolita Uthe,Steve Siembieda 安捷伦科技有限公司摘要Agilent Femto Pulse 系统采用革命性设计,是唯一一款能够自动进行高分子量 (HMW)

生物样本库的信息系统

  生物样本库(Biobank)资源管理信息系统是为了便利于有效的管理生物样本和相关信息所建立的具有搜集、保存、检索和分析功能的信息系统。其易用性、安全性、可靠性是其重要考核内容。为此:  生物样本库(Biobank)资源管理信息系统的功能包括但不限于:追踪捐赠者的问卷和知情同意,管理生物样本采集、

生物样本库类型

  生物样本库(Biobank)有多种类型,常见的组织、器官库(Tissue bank),如血液库、眼角膜库、骨髓库,到拥有正常细胞、遗传突变细胞、肿瘤细胞和杂交瘤细胞株(系)的细胞株(系)库,近年来出现了脐血干细胞库、胚胎干细胞库等各种干细胞库以及各种人种和疾病的基因组库(Genome bank)

生物样本库主要形式

  1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库(Biobank);  2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank),进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用;  3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Bioba

生物样本库主要形式

  1、医院或研究机构下单个研究人员或者单个科室因其研究需要将其搜集的生物样本单独保存而建立的生物样本库(Biobank);  2、医院或研究机构建立的生物样本库(Biobank),进行医院或研究机构内部搜集的生物样本资源统一保存和分配使用;  3、多个医院或研究机构联合组成的生物样本库(Bioba

生物样本库的定义

  生物样本库  根据经济合作与发展组织(OECD)的定义,”生物样本库(Biobank)是一种集中保存各种人类生物材料(Human biological material),用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统”。  类型  生物样本库(Biobank)有多种类型,常见的组织、器官库(T

生物样本库的现状

  早在1994年中国科学院就建立了中华民族永生细胞库,而后,山东省脐带血造血干细胞库、北京脐带血造血干细胞库、泰州(复旦)健康科学研究院、SBC芯超生物银行等专项生物标本资源库也相继建立,所以我国生物样本资源库与欧美相比,起步时间并不算晚。  2003年我国启动了国家自然科技资源共享平台建设项目,