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miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么?首先,miRNA没有蛋白产物,这使得研究复杂化。其次,miRNA的生物发生有多个步骤。最初的转录本为pri-miRNA,它在细胞核中加工形成前体pre-miRNA。这个茎环结构的RNA输出到细胞质,被Dicer酶进一步加工,最终形成了成熟的miRNA。成熟的miRNA没有poly(A)尾巴,因而检测起来要颇费一番心思。除了检测,miRNA的功能丧失(loss-of-function)研究也是难题。标准的RNAi技术行不通。成熟的miRNA与siRNA不相容,因为它们两者都能进入RISC复合物;pre-miRNA是茎环结......阅读全文

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

2018国自然研究热点一:环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

环状RNA研究深度剖析

  1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?   2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀

环状RNA研究深度剖析(一)

1.环状RNA为什么火?它到底是何方神圣?2013年两篇Nature[1][2]文章的出世,彻底颠覆了我们对RNA的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界!经过严格统计汇总后,2017年国家自然科学金获批的项目中环状RNA研究相关的项目总数高达176项,其中有两项杰出青年基金,一项优秀青年基金,两

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

环状RNA研究的方法及功能作用(二)

RNA是怎样变成环状的呢?a. 在可变剪切过程中,外显子迁移,剪切形成套索结构,拉近剪切位点,促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对,拉近剪切位点,使其相互攻击,促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能,敲降看看据文献报道,环状RNA可以被小干扰R

云序生物环状RNA研究文章汇总

  环状RNA“一站式”服务一直以来是云序生物的主打产品,严格的质控把关、严谨的实验设计、出色的生信分析以及贴心的售后服务造就了多项世界首篇环状RNA研究文章,受到了广大客户的一致好评。迄今为止,云序已经积累了超过10000例环状RNA测序的经验,样本覆盖20多个物种以及50多种疾病,客户发表文章达

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

河科大附医:通过比较SHEE和SHEEC细胞系构建ceRNA网络图

  长链非编码RNA(lncRNA)在调节各种生物过程中发挥着关键和复杂的作用,包括染色质修饰,转录和转录后加工。更有趣的是,一些lncRNAs可以作为吸引miRNA的“海绵”,在转录后调控中抑制其与miRNA靶基因的相互作用。这意味着它们可以被认为是竞争内源性RNA(ceRNA)。  在这项研究中

外泌体研究深度剖析

  一申请国自然没保障,外泌体来助攻   2018年国自然申请马上就要展开,科研界一年一度的压轴大戏又要上演。中了国自然,新的一年安安心心搞科研,舒舒服服过大年;没有中,那可能意味着接下来又是紧衣缩食的一年。在这里云序小编先衷心的祝福各位老师2018新年快乐,开春申请的基金都能中,所有的实验都成功

2018国自然研究热点三:外泌体研究深度剖析

  一申请国自然没保障,外泌体来助攻   2018年国自然申请马上就要展开,科研界一年一度的压轴大戏又要上演。中了国自然,新的一年安安心心搞科研,舒舒服服过大年;没有中,那可能意味着接下来又是紧衣缩食的一年。在这里云序小编先衷心的祝福各位老师2018新年快乐,开春申请的基金都能中,所有的实验都成功

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

环状RNA结合功能蛋白!找对方向20分文章水到渠成

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

RIP测序解析RNA结合蛋白SORBS2在卵巢癌细胞转移中作用机制

  环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转

环状RNA结合功能蛋白

环状RNA作为研究持续火热的明星分子,不同于对其丰富的表达谱研究,环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制,部分circRNA可竞争性结合miRNA,解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达。其实,环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白,分别在转录前

环状RNA研究文章汇总(二)

4.世界首篇人胶质瘤环状RNA研究(影响因子:3.0)胶质瘤作为最常见的颅内恶性肿瘤占颅脑肿瘤的40%~50%,电磁辐射等其他环境致癌因素会导致胶质瘤的发生,尽管手术切除、术后放疗、药物化疗等方法可以作为主流的胶质瘤治疗手段,但是多形性胶质母细胞瘤(GBM)的强侵袭、增殖能力仍给病人的治疗造成很大的

影响因子高达7.8分的直肠癌转移肝癌环状RNA文章思路解析

  云序客户发表首篇直肠癌转移肝癌环状RNA文章,影响因子高达7.8分!​   文章导读:   在非编码RNA的大家族中,环状RNA是近年来继microRNA和lncRNA之后又一个明星成员。因其3’-5’端成环,所以在生物体中具有稳定性高,不易被降解的特性。大部分环状RNA通过直接或间接调控m

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

糖尿病血小板来源miRNA参与海绵机制介导动脉损伤修复

  血管平滑肌细胞(VSMC)在健康状态下处于去分化表型,在其受损时,循环系统中的血小板快速激活,通过凝血反应为受伤部位止血,同时对创伤部位释放PDGF、血栓烷等生物活性介质,使VSMC切换为高分化表型,同时细胞处于促增殖状态。血管内膜增生型糖尿病就是由于VSMC分化和去分化状态切换机制失调引起的。

Nat Com重磅成果丨miR-27a在结核病中机制研究新发现

  结核病(TB,Tuberculosis)是结核杆菌(Mtb,Mycobacterium tuberculosis)感染导致的疾病。根据感染部位不同分为肺结核、淋巴结核、骨骼结核等,这是一种发病率较高、传染性较强的疾病。据世界卫生组织统计,2016年全球范围内有1040万新病例并且有170万死亡。

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  结核病(TB,Tuberculosis)是结核杆菌(Mtb,Mycobacterium tuberculosis)感染导致的疾病。根据感染部位不同分为肺结核、淋巴结核、骨骼结核等,这是一种发病率较高、传染性较强的疾病。据世界卫生组织统计,2016年全球范围内有1040万新病例并且有170万死亡。

云序生物客户发表的首篇吉西他滨耐药胰腺导管癌环状RNA

  本篇文章主要研究的药物是吉西他滨,其主要应用于晚期胰腺癌病人的治疗,可是若病人对此类药物产生了耐药反应,那势必会影响患者的生活质量,甚至生命。目前,对于吉西他滨对胰腺癌耐药机制研究尚不明朗。作者首先构建了对吉西他滨耐药细胞系,并通过全转录组测序比较了耐药与正常细胞系之间环状RNA的表达谱。通过生

Cell》重磅!全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制!

  2月7日,加拿大多伦多大学的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授团队对144例前列腺癌样本进行全转录组测序,结合后续的功能机制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的调控机制!该研究成果以题为“Widespread and Functional RNA Ci

癌症干细胞之父Cell子刊揭示干细胞主控因子

  来自加拿大和意大利的干细胞研究人员发现了人类造血干细胞的一个新“主控基因”,证实操纵其水平有可能为扩增这些细胞满足临床应用提供一条新途径。研究成果在线发表在11月8日的《细胞干细胞》(Cell Stem Cell)杂志上,为调控人类干细胞开辟了一个新范例。   来自加拿大多伦多大学健康网络

CellStemCell十大热点文章(11月)

  《Cell Stem Cell》杂志是2007年Cell出版社新增两名新成员之一(另外一个杂志是Cell Host & Microbe),这一杂志内容涵盖了从最基本的细胞和发育机制到医疗软件临床应用等整个干细胞生物学研究内容。这一杂志特别关注胚胎干细胞、组织特异性和癌症干细胞的最新成

Cell Stem Cell十大热点文章(12月)

  《Cell Stem Cell》杂志是2007年Cell出版社新增两名新成员之一(另外一个杂志是Cell Host & Microbe),这一杂志内容涵盖了从最基本的细胞和发育机制到医疗软件临床应用等整个干细胞生物学研究内容。这一杂志特别关注胚胎干细胞、组织特异性和癌症干细胞的最新成

从表达谱至海绵机制完美进阶 环状RNA测序加机制研究!

  禽白血病病毒J亚群(ALV-J)属于逆转录病毒属,慢病毒亚科的家族成员,可引起禽类多种肿瘤性疾病,如骨髓细胞瘤、肉瘤、血管瘤、肾肿瘤和成红细胞增多症,以及禽类骨髓白血病,导致受感染鸡的高死亡很率。该分散的ALV-J菌株分布广泛,既能水平传播又能垂直传播,往往造成禽类养殖领域的巨大经济损失。目前我

揭示Y染色体上LncRNA TTTY15促进前列腺癌细胞的增殖和迁移

  前列腺癌(Prostate cancer,PCa)作为男性发病率第二的癌症,严重影响了患者生殖健康和生活质量。由于前列腺癌受多种基因调控,且目前缺乏相关机制方面的深入研究,治疗效果往往不甚理想。随着高通量技术的发展,使研究PCa相关分子标志物基因和作用机制成为可能。目前,已有报道指出许多明星Ln