miRNA海绵—长效抑制miRNA
miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么?首先,miRNA没有蛋白产物,这使得研究复杂化。其次,miRNA的生物发生有多个步骤。最初的转录本为pri-miRNA,它在细胞核中加工形成前体pre-miRNA。这个茎环结构的RNA输出到细胞质,被Dicer酶进一步加工,最终形成了成熟的miRNA。成熟的miRNA没有poly(A)尾巴,因而检测起来要颇费一番心思。除了检测,miRNA的功能丧失(loss-of-function)研究也是难题。标准的RNAi技术行不通。成熟的miRNA与siRNA不相容,因为它们两者都能进入RISC复合物;pre-miRNA是茎环结......阅读全文
小分子RNA(miRNA)简介
一、什么是小分子RNA( MicroRNA)? MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本(primary transcrip
研究发现HYL1蛋白调控miRNA介导的翻译抑制过程
中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所研究员何玉科研究组在The Plant Cell上,发表了题为Cytoplasmic HYL1 modulates miRNA-mediated translational repression的研究论文。该研究组发现,HYL1蛋白除了介导m
miRNA研究综合解决方案
一、miRNA研究的基本问题和研究方法 二、miRNA研究的综合解决方案 1. miRNA微阵列芯片服务 目前上海伯豪可以提供Agilent和Affymetrix miRNA芯片。 Agilent miRNA 芯片(21.0) Affymetrix miRN
RNA干扰相关知识MicroRNA(miRNA)
MicroRNA(miRNA):是含有茎环结构的miRNA前体,经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子(~21-23个核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白质复合物)在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能,miRNA被认为在调控发
MicroRNA(miRNA)的结构和用途
MicroRNA(miRNA):是含有茎环结构的miRNA前体,经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子(~21-23个核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白质复合物)在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能,miRNA被认为在调控发
疾病检测新指标miRNA(二)
杨医师等人在另一个研究中,分析小鼠在遭受革兰氏阳性菌感染后,血液中miRNA表达谱的变化(Hsieh CH et al., 2013)。枯草杆菌(Bacillus_subtilis)、粪链球菌(Streptococcus faecalis)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus au
MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理
一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成,不同于siRNA(双链)但是和siRNA密切相关。据推测,这些非编码小分子RNA(miRNAs)参与调控基
Cell:miRNA,调控子的调控
MicroRNAs是多细胞生物体遗传程序的重要调控者。由于它们具有强大的作用,其自身的生成也受到严密地控制。来自德国马克思•普朗克发育生物学研究所的科学家们在新研究中获得了关键的研究发现。他们在拟南芥(阿拉伯芥,thale cress)中发现了一个调节micro RNAs生成的新元件,通过去
GEN:miRNA检测行业热度不减
MicroRNAs (miRNAs)是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA,具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体(RISC),识别并与靶向mRNA互补配对,从而降解或者阻止mRNA翻译。 miRNAs负责调控多种生理过程,包括细胞周期
疾病检测新指标miRNA(一)
microRNA(miRNA)是真核生物中广泛存在的一种由 non-coding 区域转录的小片段 RNA,长度仅有 19~25 个核苷酸。根据 miRBase 数据库,在所有物种发现的 miRNAs,至今已超过 2 万个。miRNA 透过与标的 mRNA 的特异性结合,经由 post-tr
miRNA和siRNA简介及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室
环状RNA研究的方法及功能作用(二)
RNA是怎样变成环状的呢?a. 在可变剪切过程中,外显子迁移,剪切形成套索结构,拉近剪切位点,促进序列成环b. 依赖邻近的反向互补序列配对,拉近剪切位点,使其相互攻击,促进序列成环c. 单个内含子直接成环d. RNA结合蛋白、反式作用因子参与成环研究功能,敲降看看据文献报道,环状RNA可以被小干扰R
植物内源激素油菜素内酯负调控miRNA靶基因的翻译抑制
植物体内非常重要的小分子非编码RNA——miRNA在翻译水平介导的靶标基因抑制是一种非常保守的基因沉默机制。在模式植物拟南芥中,miRNA被装载到其效应分子ARGONAUTE1(AGO1)蛋白上,以碱基互补配对的方式与其靶标mRNA结合,最终诱导细胞质中靶基因mRNA的切割,或者在内质网中抑制靶
马丽《自然》文章发现miRNA的原罪
来自麻省9月26日的消息,麻省理工Whitehead生物医学研究所(Whitehead Institute for Biomedical Research),纪念斯隆-凯特琳癌症中心(Memorial Sloan - Kettering Cancer Center)的研究人员发现microRNA能引
《cell》:miRNA是逆境的捍卫者?
现有许多数据说明microRNAs (miRNAs) 除了在发育方面的重要作用以外,在许多逆境应答(stress responses)中也扮演了重要角色。让人惊讶的是miRNAs这一通常抑制靶基因转录表达的小分子,也许在逆境中成为了表达的激活因子,其中的机制也许就是通过逆境中,miRNA/Argon
首个miRNA药物进入临床试验
生物通编译:丹麦制药公司Santaris Pharma近日宣布SPC3649(LNA-antimiRTM-122)开始进入人体第一阶段的临床试验,这是世界上首个在人体中试验的microRNA药物。这项研究由哥本哈根Phase One Trials A/S组织管理,最多包含48名健康男性志愿者。公司同
高通量快速验证miRNA靶基因
尽管现在人们可以越来越准确地预测microRNA的沉默效果,但还是需要高通量而且准确的直接验证技术来验证microRNA的沉默效果。microRNA 这个在生物科学史上具有重要意义的小分子,在2008年又一次成为了世人瞩目的焦点。microRNA通过与目标mRNA的3’UTR区域结合来阻止其翻译
癌症miRNA研究获新进展
来自美芝加哥大学医学院,麻省总医院,Dana-Farber癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute),浙江大学附属第一医院等处的研究人员通过一项大规模的全基因组microRNA表达谱分析,识别出了能分辩AML和ALL(两种急性白血病)的miRNAs,为这种恶性肿瘤疾病的诊
miRNA,siRNA,shRNA有什么区别
siRNA是小干扰rna;shRNA是小发卡rna,一段rna单链,形成茎环结构部分双链的小rna siRNA可以是天然产生也可以是人工导入的,shRNA一般都是指人工的 shRNA多是用dna载体构建,在宿主内自行转录成shRNA,再加工成像siRNA一样的小RNA,目的为了模仿。
康乐院士PLOS发表miRNA重要成果
近期,来自山西大学、中科院动物研究所和中科院北京生命科学研究院的研究人员,在国际著名遗传学期刊《PLOS Genetics》在线刊登了题为“miR-71 and miR-263 Jointly Regulate Target Genes Chitin synthase and Chitinase
Nature-Medicine:掌控细胞生死的miRNA
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的研究人员在β细胞中对microRNA开展研究时,发现了一种对压力下细胞死亡起关键作用的microRNA。研究结果发布在5月18日的《自然医学》(Nature Medicine)杂志上。 糖尿病是现代社会的重要祸患之一,糖尿病病例每年都在上升。全球已有超过3.8
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾(Plutella xylostella)是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫,据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
Science:miRNA控制蛋白表达的噪音
众所周知,一些microRNA能使特定基因的表达下调,然而,对于这些小的非编码RNA的更广泛用途,人们还不是太清楚。一项新的研究表明,miRNA可作为基因组噪音的阻尼器,控制蛋白表达的变化。这项成果发表于4月3日的《Science》杂志上。 miRNA的普遍和保守,再加上它们微弱抑制绝大多数目
引发牛奶过敏的关键miRNA分子
根据最近发表在《Allergy》杂志上的一篇文章,miR-193a-5p是一个调节白介素-4(interleukin-4 ,IL-4)的关键转录后调控分子,这一调控机制进一步影响了儿童产生牛奶过敏的症状。 该研究的作者是来自意大利Naples Federico 第二大学的Valeria D
Cell新文章:miRNA,癌症的推手
就在25年前,人们还只是将非编码RNAs视作是整个基因组景观中的“背景噪音”。而现在越来越多的证据已经表明,它们广泛地参与了生命现象的各个环节,如生长、分化、发育、免疫,甚至在肿瘤的形成中也具有重要的调控作用。两项最新的研究发现揭示了,其中一种微小的非编码分子——miR-22在两种类型的癌症中发
Cell揭示miRNA调控新机制
来自波士顿大学儿童医院及哈佛医学院的研究人员发现,微处理器上游的一个生物合成步骤控制了miR-17∼92表达。这一重要的研究发现发布在8月6日的《细胞》(Cell)杂志上。 MicroRNAs (miRNAs)是一个调控RNA大家族,其主要通过与靶mRNA 3′端非翻译区(3′ UTR)互补配
做miRNA的PCR的方法介绍
加尾法和茎环法加尾法,是指把miRNA再人工加一个polyA的尾巴,这样它的结构就变长,有点象是典型的mRNA结构。很多公司提供有现成的miRNA加尾法逆转录试剂盒。按常规方法提取总RNA,用于逆转录。做完逆转录后,可参考的方法去做PCR。注意,这时的PCR需要的上下游引物,一般是上游引物就直接用m
miRNA调控乳脂合成新机制
乳汁是年幼哺乳动物包括人类的主要营养来源。乳汁的营养价值主要来自脂肪和蛋白质组分。相比于牛奶,山羊奶含有更多的总脂肪,包括更高丰度的有益不饱和脂肪酸。MicroRNAs(miRNAs)是一类含有约22个核苷酸的小RNA,参与各种代谢过程。然而,目前有关miRNA在调控山羊奶成分中的作用知之甚少。西北
Nature-Medicine:掌控细胞生死的miRNA
瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH)的研究人员在β细胞中对microRNA开展研究时,发现了一种对压力下细胞死亡起关键作用的microRNA。研究结果发布在5月18日的《自然医学》(Nature Medicine)杂志上。 糖尿病是现代社会的重要祸患之一,糖尿病病例每年都在上升。全球已有超过3.8
检测血液中miRNA的简便技术
癌变肿瘤会脱落一些微小的指示遗传分子,称为microRNAs。最近,密歇根大学的研究人员开发出一种有效的方法,能在血液中检测到它们。相关研究结果发表在六月二十二日的《Nature Biotechnology》。 研究人员称,他们这种方法可通过一种廉价的血液测试,同时对多种类型的癌症进行筛选——