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《Nature Methods》是专门用来对生命科学研究领域具有显著性意义的新方法和研究技术改进的经典杂志。单细胞转录组测序是2019年不折不扣的热点领域，截至2019年9月，Nature Methods总共发表了10篇关于单细胞转录组测序相关的研究报道。本期，小编和大家一起分享这些重要的研究成果。 1.用于评估单细胞RNA-seq数据批次效应的工具 来自德国计算生物学研究所的研究人员发表了“A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction”的研究报道。该研究开发了一个强大、灵敏度高的基于k-nearest-neighbor批次效应评价工具（kBET； https://github.com/theislab/kBET ）。研究人员使用kBET来评估常用的批次回归和标准化方法，并量化其在保留生物变异性的同时去除批次效应的程度。这对未来......阅读全文
一、前言 David Swinbanks 我们很高兴地看到，近年来在《Nature》杂志上发表论文的中国研究人员的数量一直在增加。1999年，《Nature》杂志发表了11篇来自中国的论文，其领域包括神经生物学、化学和古生物学等。这一数字几乎是我们1997年发表的来自中国的论文数量的
CRISPR作为基因编辑领域的明星技术俨然已经成了众多突破研究的“得力助手”。从技术改良、疾病治疗到作物改良，越来越多的科学研究离不开这项才进入科研领域短短几年的技术。张锋、胚胎编辑、George Church等热词让CRISPR在2015年“屡次刷屏”。 笔者从去年开始关注CRISPR技术，
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基
大家好~我是张博，吉凯新产品团队的搬砖新人！作为新产品的技术支持，除了说学逗唱，最重要的就是紧跟时代潮流，学习各种新知识！上至世界和平，下到小道八卦，都要了解~ 奇葩年年有，今年特别多。比如最近炙手可热的美帝网红特朗普，完美的诠释了：不想当总统的地产商不是好段子手……对于他的奇谈怪论大家已
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究，但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
单细胞测序日趋火爆的原因很大程度上得益于单细胞分离技术的不断完善。这一讲，我们将跟大家一起回顾传统的单细胞分离技术，并重点介绍单细胞分离技术的新宠微孔芯片技术及微流控技术。图1为目前常见单细胞分离设备。图1：目前常见单细胞分离设备传统单细胞分离技术相信许多实验人员，都见过下面我们要介绍的传统的单细胞
作者：杨连君，司晓辉，王文亮，王文勇，赵一岭，方正清［摘 要］ 目的：探讨简便易行的在光镜下通过形态学观察检测细胞凋亡的方法，并对其进行比较。方法：首先用6%的乙醇作用6 h诱导人肝细胞癌细胞系HCC9204细胞凋亡，然后进行未固定细胞的台盼蓝染色、吖啶橙/溴化乙啶(AO/EB)双染色，
对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究，更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起，使得在保留样本空间位置信息的同时，检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews G
对生命过程的理解不光限于对组成个体的单个细胞的研究，更需要对细胞和细胞之间怎么样的互作协调来完成一个整体的生物学功能的研究。空间组学技术的兴起，使得在保留样本空间位置信息的同时，检测细胞中的基因表达等分子信息来勾勒出空间中的细胞表达特征。在2019年《Nature Reviews Genetic
[新智元导读]AI能够映射大脑神经元。人类大脑包含大约860亿个神经元，并且一个立方毫米的神经元可以产生超过1000TB的数据。由于其庞大的规模，绘制神经系统内部结构的过程是计算密集和繁琐的。为了加速这一过程，谷歌和德国马克斯普朗克神经生物学研究所的研究人员开发了一种基于深度学习的系统，可以自动
Nature Medicine在本周一上线了两篇CRISPR的相关文章 ，这两篇文章中的研究均发现CRISPR-Cas9系统能够诱导细胞内p53介导的DNA损伤反应，影响CRISPR的基因组编辑。 文章上线之后CRISPR相关公司的股价大跌，CRISPR Therapeutics一度下跌接近1
在2013年，来自麻省总医院的研究人员发现使用CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶的一个重要局限：会在预期靶点以外的位点上生成多余的DNA突变。此后陆续有研究直接说明了CRISPR/Cas9存在严重的脱靶性，即该技术可以发生非特异性切割，引起基因组非靶向位点的突变，这样会造成研究结果的不确定
胰腺中的胰岛包含有分泌胰岛素的β细胞和分泌胰高血糖素的α细胞， 胰岛素和胰高血糖素是两种特殊的激素，其能协同作用来调节机体血糖水平， β细胞的破坏和功能异常会导致糖尿病发生，目前并没有疗法能够阻断糖尿病进展及其严重的血管并发症。胰岛移植通常能够让机体血糖水平正常数年时间，且能阻断糖尿病次级并发生
Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者：Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来，质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度，使研究者们在疾病生物标志物的发现和验
2018年12月，《Science》杂志称，如果没有基于scRNA-seq的可视化技术，一个细胞一个细胞地跟踪胚胎发育就不可能实现，因此这是今年最大的突破这一。2019年，研究人员写道，毫无疑问，FIt-SNE将加速发育生物学、神经科学以及癌症研究等领域的进一步工作。 就像从针孔相机到偏光片一
间充质干细胞具有低免疫原性及向缺血或损伤组织归巢的特征,输入宿主体内后，可归巢于特定部位，在微环境影响下定向分化为内胚层、中胚层以及外胚层3个胚层来源组织的细胞，如骨、软骨、肌腱、脂肪、肝、肾、皮肤、肌肉、神经甚至胰腺等10余种成熟细胞，因而成为再生医学中器官修复的理想种子细胞。 最初是在骨髓
随着人类基因组计划（human genome project ）在2003年顺利完成，基因组测序技术取得了长足的进步，这直接导致了每兆基因组成本的大幅下降以及检测的基因组数量越来越多。人们对基因组的复杂性深感震惊，这也引导着测序技术的进一步发展。最近的一些突破性技术使得测序技术在更短的时间内可以
以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大
以10x Genomics为代表的单细胞组学检测技术的发展，为我们从细胞层面去理解生命体的发育过程，疾病发生和发展过程提供了重要的手段。以单细胞转录组(scRNA-Seq)为例，我们可以发现，单细胞组学数据具有横向细胞数量巨大，纵向数据分布稀疏的特点。因此，针对单细胞数据，从分析的角度提出了巨大
图为2005年光遗传学第一次出现开始至今相关的论文数量(来自Nature Neuroscience，2015，DOI: 18:1213-1225)可见关于光遗传的论文近年成为各大主流杂志的新宠，其中不乏CNS这种级别的，例如这篇新鲜热乎的Nature Method：Yu, X., et al., 2
单细胞测序被评为2013年年度技术 2014 年首刊，《Nature Methods》杂志将2013年度技术(Method of the Year 2013)授予了单细胞测序(single-cell sequencing)。同时，杂志还介绍了2014年值得关注的技术，包括
多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过，近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们，每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制，即使是同类型细胞，基因表达也会出现差异。 那么，细胞之间的哪些差异有生物学意义，哪些差异来自于技术偏好呢？要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢？这
分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球，并已在成像领域占据领导地位；自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后，在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展，并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列，已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大
应用WGS正在成为NGS中最广泛的应用。通过该技术并且结合生物学应用，研究人员可以获得基因组信息中最值得注意的信息73。举例来说，2012年，Ellis等报道了基因与乳腺癌患者芳香酶抑制剂（aromatase inhibitor）治疗法之间的关联。他们指出突变，后果与诊断之间的关联，同样还有
写在前面的话：对于研究糖基化蛋白质组学的学者们来讲，很多人喜欢用sweet这个词来形容自己的研究课题。我个人也很喜欢这个单词，这是一个让人感到幸福而温暖的词语，会让你对你的课题充满了爱意。但回头想想，当初懵懵懂懂读到研究生，误打误撞进入蛋白质组学圈，好像也就是随大流的主动抑或是被动选择了博士阶
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
前言：近年来，CRISPR基因编辑技术正在席卷整个生物医学研究领域，上一期我们已先从CRISPR系统开发及机制研究方面梳理了2018年相关大事件。伴随着基础技术不断优化，CRISPR技术的应用也更加广泛，如动物造模、药物筛选、单碱基编辑技术、细胞谱系示踪、基础疾病研究、疾病诊断、体内编辑和遗传病
【导语】在2011年10-11月期间，在一级科学刊物Nature和Nature Methods上有14篇科研论文使用赛默飞世尔LTQ-Orbitrap或TSQ质谱仪产生数据，聚焦的主题包括：目标物发现与定量研究，Top-down蛋白质组研究绘制蛋白质异构体，同位素标签方法的精度，提高糖蛋白质组
截止2020月7月27日，中国学者在Cell，Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果，其中新冠肺炎领域占了近一半（共43篇）。iNature系统总结了这些研究成果： 按杂志来划分：Cell 发表了30篇，Nature 发表了45篇，
Science：中国科学技术大学在量子力学再取新突破 实现对量子系统的调控是人类认识并利用微观世界规律的必然诉求，也是诸多前沿科学领域的核心要素。自旋作为一种重要的量子调控研究体系，在世界各国的量子计划中均被列为重点研究对象。开展单自旋量子调控研究有助于人们在更深层次上认识量子物理的基础科学问题，