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青岛科技大学:RNA检测课题研究取得重大突破

日前,青岛科技大学化学与分子工程学院马翠萍课题组的研究成果,在线发表于化学领域国际顶级权威期刊《美国化学会志》上。该研究发现,几种脱氧核糖核酸(DNA)聚合酶具有内在的反转录酶活性,突破了DNA聚合酶只能以DNA为模板合成DNA的传统认知,对RNA的快速检测具有重要意义。 据了解,核糖核酸(RNA)是一类重要的检测靶标,在分子生物学、医学诊断和疾病治疗中受到广泛关注。一般检测RNA的方法都需要首先对被反转录酶进行反转录形成互补DNA(cDNA),然后在DNA聚合酶的作用下进行扩增检测。马翠萍课题组的研究发现,几种DNA聚合酶具有以RNA为模板反转录为cDNA的能力,并且这种cDNA能直接作为模板进行后续的扩增实验。此项研究,为实现RNA的单酶和一步法检测提供了酶学基础,可以大大缩短反应时间,降低实验费用,对核酸的即时检测,如血液核酸筛查、检验检疫(如艾滋病病毒、埃博拉病毒)等领域具有重要意义。 ......阅读全文

DNA and RNA EXTRACTIONS

A protocol / method / schedule /procedure for extraction / isolation of both DNA and RNA from the same material typically plant leaf / leaves(See also

RNA聚合酶的类别

通常可根据生物的类别,将RNA聚合酶分为原核生物RNA聚合酶、真核生物RNA聚合酶。原核生物和真核生物的RNA聚合酶有共同特点,但在结构、组成和性质等方面又不尽相同。(1)原核生物RNA聚合酶 研究得最清楚的是大肠杆菌RNA聚合酶。该酶是由五种亚基组成的六聚体(α2ββ'ωσ)分子量约500

RNA聚合酶的特点

RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点:①以DNA为模板;②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应;④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸;⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。

RNA聚合酶的催化特点

RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点:①以DNA为模板;②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应;④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸;⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。

RNA聚合酶的特点介绍

  RNA聚合酶催化RNA的合成,其与DNA聚合酶有许多相同的催化特点:  ①以DNA为模板;  ②催化核苷酸通过聚合反应合成核酸;  ③聚合反应是核苷酸形成3’,5’一磷酸二酯键的反应;  ④以3’→5’方向阅读模板,5’→3’方向合成核酸;  ⑤按照碱基配对原则忠实转录模板序列。

DNA提取方法--洗涤 DNA(或 RNA)

当裂解物通过硅胶膜进行离心分离,现在所提取的 DNA 或 RNA 应该与柱子结合,杂质、细胞蛋白和多糖应该已经通过了。 但是,膜仍然被残留的细胞蛋白质和盐弄脏。如果样品来自植物,仍然会有多糖,也许一些色素留在膜上,或者如果样品是血液,膜可能会被染成棕色或黄色。洗涤步骤用于去除这些杂质。通常有两次洗涤

DNA聚合酶的缺点

缺点无3'→5'阅读校正功能,在PCR扩增过程可引起错配,30次循环错配率约0.25%。措施:选择高保真Taq酶,如Pfu。原因:Pfu具有3'→5'外切酶活性。注意:Pfu扩增产物为平末端。

DNA聚合酶的特性

良好的热稳定性;70℃ 2h,残留90%活性;93℃ 2h,残留60%活性;94℃ 2h,残留40%活性。5'→3'聚合酶活性,对dATP有优先聚合活性;5'→3'外切酶活性;无3'→5'外切酶活性。

DNA聚合酶的用途

聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)。Taq酶扩增的PCR产物,3'末端总是带有1个非模板依赖型的突出碱基,而这个碱基几乎总是A,因为Taq酶对dATP具有优先聚合活性,故可用T载体克隆。

DNA聚合酶的定义

  真核细胞有5种DNA聚合酶,分别为DNA聚合酶α(定位于胞核,参与复制引发,不具有5'-3'外切酶活性及3'-5'外切酶活性,有5'-3'聚合酶活性),β(定位于核内,参与高保真度复制,不具有5'-3'外切酶活性,其中疑似存在5&#