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NGS文库制备的方法比较

近年来,新一代测序(NGS)技术的应用日益广泛。随着测序技术的不断改进,制备核酸和构建NGS文库的方法也在改进。对于各种文库制备方法,我们该如何选择?近日,美国斯克里普斯研究所的研究人员在《Biotechniques》上发表文章,比较了各种文库制备策略。 总的来说,在NGS分析之前,制备RNA或DNA的主要步骤包括:片段化和/或筛分指定长度的目标序列;将目标片段转化成双链DNA;在片段末端连上寡核苷酸接头;以及定量最终的文库。 DNA片段的大小是NGS文库构建的主要因素。DNA片段化主要是通过物理方法(如超声破碎)或酶学方法(即非特异的核酸内切酶处理)来实现的。作者将这两种方法进行了比较,发现它们都很有效。不过,与物理方法相比,酶学方法(Fragmentase)产生更多人为的插入缺失。作者还提到了Illumina的Nextera技术,认为它能够减少样品处理并节约时间。 作者提到,在制备DNA样品的文库时,应......阅读全文

科学狂人:文库制备对宏基因组测序影响很大

  我们体内生活着不计其数的微生物,它们组成的生态系统就是微生物组。近年来人们发现这些微生物对人体健康有着重要的影响,微生物组研究因此受到了极大的重视,甚至被称为是人体的“第二基因组”。  微生物组参与了许多重要的机体功能,比如消化食物、合成营养物质和抵御疾病。许多人类疾病都与微生物组失衡有关。科学

安捷伦:用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案

简化的RNA和DNA测序解决方案,用于精简临床NGS  2020年9月1日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计,为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法,从而确保客户能够简化并整合其工作流程,而无

液体处理专家如何自动化、标准化捕获测序文库制备

目标区域捕获测序技术,是根据已知特定基因组区域序列设计寡核苷酸探针,通过杂交将目标区域捕获富集进行二代测序。其针对目标区域深度测序,增加了检查灵敏度和准确性。既满足研究需求,又降低测序成本,在科研、临床中均备受关注。液体处理专家贝克曼库尔特推出Biomek 自动化捕获测序方案,帮助您实现自动化、标准

基因文库制备仪简介

  基因文库制备仪是一种用于基础医学领域的分析仪器,于2015年11月1日启用。  技术指标  通量为10M,100M和1G测序芯片可以任意选择;标准测序时间为2~3小时;使用无标记的核苷酸及酶进行测序。  主要功能  新一代测序技术,基因组DNA序列测定(微生物基因组测序、线粒体测序、靶向测序)、

NGS文库制备的方法比较

  近年来,新一代测序(NGS)技术的应用日益广泛。随着测序技术的不断改进,制备核酸和构建NGS文库的方法也在改进。对于各种文库制备方法,我们该如何选择?近日,美国斯克里普斯研究所的研究人员在《Biotechniques》上发表文章,比较了各种文库制备策略。   总的来说,在NGS分析之前,制备R

Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备的质量控制

  摘要   本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完

cDNA文库组标准流程四:载体制备

1.pBlueScriptII的提取1.取1ul商品的pBlueScriptII,转化入大肠杆菌宿主菌中,取5ul转化产物均匀涂布在含AMP的LB平板上,37℃培养过夜。2.第二天取一只无菌的50ml离心管,加入10ml AMP抗性的LB液体培养基,挑单克隆于离心管中,37℃,250rpm,培养过夜

文库甘油储存料中噬菌体抗体的制备

实验概要本实验从文库甘油储存料中制备了噬菌体抗体。主要试剂1. 2×TY/amp/glu培养基2. TYE/amp/glu平板3. 含有25ug/ml卡那霉素和2%葡萄糖的TYE平板(TYE/kan/glu)4. 含100ug/ml氨苄青霉素和25ug/ml卡那霉素的2×TY培养基(2×TY/amp

Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备的质量控制

  本应用简报按照 Agilent SureSelectQXT WGS 文库制备方案,介绍了 Agilent 4200 TapeStation 系统在工作流程中的样品质量控制 (QC) 性能。基因组 DNA ScreenTape 分析法是对基因组 DNA 起始材料进行系列定量分析并提供完整性信息的可

文库甘油储存料中噬菌体抗体的制备

实验概要本实验从文库甘油储存料中制备了噬菌体抗体。主要试剂1. 2×TY/amp/glu培养基2. TYE/amp/glu平板3. 含有25ug/ml卡那霉素和2%葡萄糖的TYE平板(TYE/kan/glu)4. 含100ug/ml氨苄青霉素和25ug/ml卡那霉素的2×TY培养基(2×TY/amp