SMRT测序:评估基因编辑效果的新利器

新兴的CRISPR技术在短短一年多的时间内,掀起了基因组编辑的热潮。然而,对这些基因改造手段的效率和结果,我们仍难以评估。目前的一些工具,如荧光报告基因、克隆分析,缺乏生成报告细胞系时所需的灵敏度。高通量测序方法虽能科服这一问题,但无奈读长太短,而供体DNA模板往往很长。 目前,还没有一种测序平台能同时评估非同源性末端接合(NHEJ)和同源介导修复(HDR)的发生频率,而这正是双链DNA断裂的两种主要修复机制。近日,单分子测序带来了一个好消息,研究人员证实,单分子实时(SMRT)测序技术能够同时测定任何位点的基因组编辑结果。这项研究成果发表在3月27日的Cell Reports上。 研究由来自斯坦福大学的Matthew Porteus领导。研究人员在文中指出,这种方法可应用于各种基因组编辑平台,包括TALEN、CRISPR/Cas9和锌指核酸酶(ZFN),以确定理想的改造结果出现时的条件和策略。 靶......阅读全文

北京基因组所揭示线粒体基因组氧化损伤修复分子机制

  线粒体是真核生物细胞主要的能量代谢场所,其中呼吸链氧化磷酸化过程伴随有高水平的氧自由基(ROS)的产生。线粒体基因组缺乏组蛋白结合保护,所以容易受到ROS攻击而发生损伤,其突变的累积已证实与多种人类疾病(如神经退行性病变、糖尿病、心血管疾病和癌症等)的发生密切相关。有关核基因组DNA损伤修复分子

定位全基因组范围DNA修复的新方法

  北卡罗来纳大学的研究人员近日开发出一种全基因组范围的测序分析,可定位DNA切除修复。这种被称为切除修复测序(XR-seq)的方法发表在新一期的《Genes & Development》杂志上。  这项研究的通讯作者是北卡罗来纳大学医学院生物化学及生物物理系的Aziz Sancar以及芝加哥大学人

拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制

  2021年6月16日,清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates

机器可预测基因组修复结果-实现精准无模板CRISPRCas9编辑

英国《自然》杂志8日在线发表了一项人工智能及生物技术研究:科学家报告了一种方法,可通过机器学习对致病基因变异实现精准且可预测的编辑。这项成果为研究遗传疾病,开发潜在疗法提供了新的可能性。  虽然CRISPR-Cas9彻底改变了用于研究的基因组编辑技术,但目前认为,保证这项技术的准确性尤其重要。  C

Nature揭示膀胱肿瘤基因组突变中DNA修复及损伤的关键角色

  在过去几十年里,全世界的科学家们都在对癌细胞的基因组进行全方位解析,试图揭开驱动肿瘤生长的基因密码;随着对成千上万个在肿瘤细胞DNA中积累的基因突变进行精确分析,研究人员如今发现的致癌基因的数量越来越多了;近日科学家们就将研究目光转移到了其它关键问题上,即什么样的生物学过程会引发DNA发生突变?

DNA修复技术诱导修复过程介绍

DNA严重损伤能引起一系列复杂的诱导效应,称为应急反应,包括修复效应、诱变效应、分裂抑制及溶原菌释放噬菌体等。细胞癌变也可能与应急反应有关。应急反应诱导切除和重组修复酶系,还诱导产生缺乏校对功能的DNA聚合酶,加快修复,避免死亡,但提高了变异率。单链DNA诱导重组蛋白A,可水解Lex A蛋白,使一系

DNA修复技术重组修复过程介绍

此过程也叫复制后修复。对于DNA双链断裂损伤,细胞必须利用双链断裂修复,即重组修复,通过与姐妹染色单体正常拷贝的同源重组来恢复正确的遗传信息。人重组修复中原损伤没有除去,但若干代后可逐渐稀释,消除其影响。所需要的酶包括与重组及修复合成有关的酶,如重组蛋白A、B、C及DNA聚合酶、连接酶等。

DNA修复的切除修复的相关介绍

  (一)细胞内有多种特异的核酸内切酶,可识别DNA的损伤部位,在其附近将DNA单链切开,再由外切酶将损伤链切除,由聚合酶以完整链为模板进行修复合成,最后有连接酶封口。  (二)碱基脱氨形成的尿嘧啶、黄嘌呤和次黄嘌呤可被专一的N-糖苷酶切除,然后用AP(apurinic/apyrimidinic,缺

关于DNA修复的光修复的介绍

  这是最早发现的DNA修复方式,是指细胞在酶的作用下,直接将损伤的DNA进行修复。 [1] 修复是由细菌中的DNA光解酶(photolyase)完成,此酶能特异性识别紫外线造成的核酸链上相邻嘧啶共价结合的二聚体,并与其结合,这步反应不需要光;结合后如受300-600nm波长的光照射,则此酶就被激活

SOS修复系统修复DNA损伤的介绍

  是SOS反应的一种功能。SOS反应是DNA受到损伤或脱氧核糖核酸的复制受阻时的一种诱导反应。在大肠杆菌中,这种反应由recA-lexA系统调控。正常情况下处于不活动状态。当有诱导信号如 DNA损伤或复制受阻形成暴露的单链时,recA蛋白的蛋白酶活力就会被激活,分解阻遏物lexA蛋白,使SOS反应

土壤修复技术之-玻璃化修复技术

  玻璃化技术源于20世纪五六十年代核废料的玻璃化处理技术,近年来该技术被推广到污染土壤的治理,1991年美国爱达荷州工程实验室把各种重金属废物及挥发性有机组分填埋于地下0.66m后,使用原位玻璃化技术,证明了该技术可行性。  该技术分原位和异位两种。  一、原位玻璃化技术  原理:通过向污染土壤插

电池修复仪的-操作说明和修复范围

  电池修复仪主要是针对铅酸蓄电池进行修复的,对于蓄电池的非物理性损坏比如蓄电池化学反应中造成的硫化、盐化、极板老化、软化、失水、热失控、极板活性物质脱落等现象具有较好的 修复效果,通过等离子共振,将硫化铅结晶体转化为自由移动的游离子参加化学反应,从而达到修复的目的。   操作说明   ①

DNA损伤修复的切除修复方法介绍

  又称切补修复。最初在大肠杆菌中发现,包括一系列复杂的酶促DNA修补复制过程,主要有以下几个阶段:核酸内切酶识别DNA损伤部位,并在5'端作一切口,再在外切酶的作用下从5'端到3'端方向切除损伤;然后在 DNA多聚酶的作用下以损伤处相对应的互补链为模板合成新的 DNA单链片

关于DNA损伤修复的重组修复方法介绍

  重组修复从 DNA分子的半保留复制开始,在嘧啶二聚体相对应的位置上因复制不能正常进行而出现空缺,在大肠杆菌中已经证实这一DNA损伤诱导产生了重组蛋白,在重组蛋白的作用下母链和子链发生重组,重组后原来母链中的缺口可以通过DNA多聚酶的作用,以对侧子链为模板合成单链DNA片断来填补,最后也同样地在连

“易修复”全国生态修复研究生奖学金计划发布

日前,第四届全国生态修复研究生论坛暨全国生态修复青年创新创业大赛与人才对接会在北京易修复众创园举行。尽管全国生态修复论坛今年已是第四次举办,但是在中国矿业大学(北京)土地复垦与生态重建研究所教授胡振琪看来,此次论坛的举办又有很多第一次除了新的举办地点和形式,这也是第一次增设创新创业比赛奖项,以及第一

锂电池硫化后的化学修复法修复介绍

  对已硫化电池,倒掉原电解液,加入纯水与硫酸钠、硫酸钾、酒石酸等物质混合液,采取正常充放电几次,然后倒出纯水加入稍高密度酸液调整电池内酸液至标准液浓度,容量恢复至80%以上可认为修复成功。  此法机理,加入的这些硫酸盐配位掺杂剂,可与很多金属离子,包括硫化盐形成配位化合物。形成的化合物在酸性介质中

《污染场地修复技术目录》引导修复产业健康发展

   上海世博会场地的修复主要利用污染土壤的固化/稳定化修复技术,这是第一次进行以工程为目的的场地污染调查,也是我国实施的最大规模的土壤修复工程。  由《调查公报》计算出的万亿市场,我认为是有很大偏差的。目前行业应该处于一个起步阶段,可以说很多基础的工作都没有准备好。真正从事这个行业的专家或者企业的

关于DNA损伤的修复方式暗修复的介绍

  是指照射过紫外线的细胞的DNA,不需要可见光的反应而修复,使细胞的增殖能力恢复的过程。  与此相对应的需要可见光的DNA的修复称为光修复。暗修复的机制有去除修复、重组修复和应急修复。去除修复是经过一系列酶的作用将由紫外线照射作用所生成的嘧啶二聚体从DNA上除去,产生的缝隙通过修补合成而得到填补,

一例牙修复体脱落修复诊疗分析

 应用牙周多种手术技术来恢复牙周组织的健康和软硬组织的形态,以重建功能和展现美观是近年来口腔医学关注的焦点。要达到这样的目标,需要在正确评价口腔状况特别是牙周状况的基础上,进行全面的设计并合理选择治疗方法,最大限度恢复功能和美观。本文完整展示了1例针对双侧后牙区病例的病情分析、多学科参与治疗设计及步

土壤修复技术介绍——电动力学修复技术

电动力学修复技术是处理污染土壤的一项新的化学技术方法,已进入现场修复应用阶段。电动力学修复是通过电化学和电动力学的复合作用(电渗、电迁移和电泳等)驱动污染物富集到电极区,进行集中处理或分离的过程。近年来,中国先后开展了铜、铬等重金属、菲和五氯酚等有机污染土壤的电动修复技术研究。与传统的清洗法、生物处

碱基修复的概念

中文名称碱基修复英文名称base repair定  义由于某些原因可导致核酸碱基错配或其他损伤,生物体内有多个系统可修复错配或损伤的碱基,如碱基切除修复。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

碱基修复的概念

中文名称碱基修复英文名称base repair定  义由于某些原因可导致核酸碱基错配或其他损伤,生物体内有多个系统可修复错配或损伤的碱基,如碱基切除修复。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

受损DNA修复“关键”

德雷塞尔大学和佐治亚理工学院的研究人员发现,Rad52蛋白质是DNA修复的关键所在。最新的研究发表结果发表于《分子细胞》杂志中,在报道中,研究人员解释了Rad52蛋白质同源重组的重要功能,这一发现有助于确定治疗癌症的新目标目标。放疗和化疗可引起DNA双链断裂,其中最大的损害就是DNA的损伤,同源重组

矿山生态修复措施

1、自然恢复。采矿损毁土地依靠生态系统自我调节能力能够逐步得到恢复,不需进行工程干预。采取封闭修复场地、拆除废弃设施等措施,消除影响自然恢复的生态胁迫因子。不允许在修复场地内翻土、取石、搬运、垦殖等人类活动,排除外界干扰,减少对场地的扰动。依赖场地和周边生态系统自我愈合能力,促进植被再生和生物种群恢

抗原修复方法

至今为止,抗原修复有许多种方法,在这些方法中,有的是根据抗体的要求来进行,有的是根据抗原的表达程度来进行,我们则对每种病例每项检测,都要求必须进行抗原修复,以达到抗原全面表达的*佳状态。 1.  真空负压抗原修复法: ① 切片脱蜡至水。 ②0.3%H2O2甲醇真空负压处理5分钟。 ③自来水洗,蒸馏水

矿山生态修复措施

1、自然恢复。采矿损毁土地依靠生态系统自我调节能力能够逐步得到恢复,不需进行工程干预。采取封闭修复场地、拆除废弃设施等措施,消除影响自然恢复的生态胁迫因子。不允许在修复场地内翻土、取石、搬运、垦殖等人类活动,排除外界干扰,减少对场地的扰动。依赖场地和周边生态系统自我愈合能力,促进植被再生和生物种群恢

如何修复pH电极?

  pH复合电极的“损坏”,其现象是敏感梯度降低、响应慢、读数重复性差,可能由以下三种因素引起,一般客户可以采用适当的方法予以修复:  (1)电极球泡和液接界受污染,可以用细的毛刷、棉花或牙签等,仔细去除污物。有些塑壳电极头部的保护罩可以旋下,清洗就方便了,如污染严重,可按第8条的方法用清洁剂清洗。

如何“修复”pH电极?

pH复合电极的“损坏”,其现象是敏感梯度降低、响应慢、读数重复性差,可能由以下三种因素引起,一般客户可以采用适当的方法予以修复。(1)       电极球泡和液接界受污染,可以用细的毛刷、棉花球或牙签等,仔细去除污物。有些塑壳pH电极头部的保护罩可以旋下,清洗就更方便了,如污染严重,可按第22条的方

什么是修复体?

假体植入又被称作修复体,是一种替代人体某个肢体、器官或组织的医疗器械。根据假体的用途,可分为体外修复体和植入性修复体。

齿轮修复的方法

齿轮磨损失效是生产实际和设备维护保养中经常遇到的问题。对失效齿轮如何恢复其原有性能,延长其使用寿命并减少投入,节约成本一直是人们所关注的问题。下面将目前常用的齿轮磨损失效修复方法总结如下:1、调整换位法   调整换位法是将已磨损的齿轮变换方位,利用齿轮未磨损或磨损较轻的另一齿面继续工作的方法。采用这