拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制

2021年6月16日,清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates with ssDNA binding proteins WHY1/3 and recombinase RecA1 tofulfill the DNA damage repair in Arabidopsis chloroplasts)”的研究论文,揭示了RNA:DNA hybrids结构协助拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制。 正确修复受损DNA对基因组完整性和个体发育至关重要。作为半自主细胞器,质体必须通过一系列机制来维持自身基因组完整。孙前文实验室之前发现通过维持三股基因组结构R-loop的水平可以保持质体免......阅读全文

拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制

  2021年6月16日,清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates

从拟南芥菜中分离叶绿体实验

实验材料叶组织试剂、试剂盒研磨悬浮缓冲液仪器、耗材烧杯Polytron 匀浆器实验步骤1. 组织匀浆(1) 收集 10 g 叶组织,放进一 400 ml 的烧杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨悬浮缓冲液。在 4℃ 的房间中,用 Polytron 匀浆器进行 6~7 个 3 秒钟脉冲匀浆叶组

从拟南芥菜中分离叶绿体实验

实验材料 叶组织试剂、试剂盒 研磨悬浮缓冲液仪器、耗材 烧杯Polytron 匀浆器实验步骤 1. 组织匀浆(1) 收集 10 g 叶组织,放进一 400 ml 的烧杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨悬浮缓冲液。在 4℃ 的房间中,用 Polytron 匀浆器进行 6~7 个 3 秒钟脉冲

从拟南芥菜中分离叶绿体实验

            实验材料 叶组织 试剂、试剂盒 研磨悬浮缓冲液 仪器、耗材

从拟南芥菜中分离叶绿体实验

实验材料叶组织                                                          试剂、试剂盒研磨悬浮缓冲液                                                          仪器、耗材烧杯      

拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验

试剂、试剂盒HEPES-KOH                                                                  山梨醇                                                                  

拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验

试剂、试剂盒 HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材 浓缩离心设备实验步骤 建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长,并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好,并连同其他一些设备,如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却

拟南芥叶绿体蛋白质组学分析实验

试剂、试剂盒HEPES-KOH山梨醇抗坏血酸维生素 C半胱氨酸PF-Percoll仪器、耗材浓缩离心设备实验步骤建议在短日照条件下培养材料以诱导营养生长,并在照光的早期收取材料以提高获得完整叶绿体的产率。所以试剂应在收集材料之前准备好,并连同其他一些设备,如离心机转头及离心管等在冰箱或冰上冷却至 0

DNA断裂修复增加基因突变风险

  据美国物理学家组织网近日报道,美国印第安纳大学与普渡大学印第安纳波利斯联合分校(IUPUI)和瑞典优密欧大学(Umea University)最近的一项联合研究显示,有一种细胞用于修复自身DNA断裂的方法(称为断裂诱导复制),比正常合成DNA产生的基因变异要高出2800倍。  

戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制

microRNA(miRNA)是一类长约21个核苷酸的内源小RNA,它们从其前体(primary miRNA, pri-miRNA)在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生,与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因

戚益军组揭示叶绿体逆行信号拟南芥microRNA生成重要机制

  microRNA(miRNA)是一类长约21个核苷酸的内源小RNA,它们从其前体(primary miRNA, pri-miRNA)在细胞核内被 Dicer-like 1 (DCL1) 加工产生,与效应蛋白 Argonaute1 结合后通过切割靶标 mRNA 或抑制翻译等方式调节基因表达。叶绿体

关于同源重组的双股断裂修复模型介绍

  双股断裂修复模型( double-strand break repaii。mnodel)也将同源重组分为四个阶段。  1、同源序列配对。  2、形成3’端突出结构,即配对同源序列之一的DNA双链水解,并由5’外切核酸酶水解,形成3'端突出结构(即3’黏端)(①~②)  3、形成Holli

德研究发现与DNA双链断裂修复相关基因

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生物学》杂志上。

染色体断裂,如果修复不当会导致细胞死亡

  染色体断裂是对细胞最有害的DNA损伤。如果不进行修复,它们会阻止染色体的复制和分离,停止生长周期并导致细胞死亡。这些断裂经常出现在肿瘤细胞中,并在遗传物质的复制过程中自然发生。为了修复遗传物质中的这种损害,细胞将信息从未受损的子本拷贝转移到断裂的副本,这被称为姊妹染色单体之间的重组。图片来源于网

与DNA双链断裂修复相关新基因被发现

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生

天差地别!CRISPR导致的DNA断裂后修复与理论差距巨大

  尽管世人对CRISPR-Cas9基因编辑抱有很高期望,科学家们仍对其人体临床应用持怀疑态度。为什么呢?  “基因编辑非常强大,但是到目前为止还有许多问题和错误需要探索。它们的工作方式就像一个黑匣子,有许多猜想和假设,”加州大学伯克利分校分子生物学教授Jacob Corn说。“现在,我们终于有能力

精确编辑基因!利用机器预测细胞修复CRISPR诱发的DNA断裂

  当双螺旋DNA因损伤(比如X射线暴露)发生断裂时,细胞中的分子机器会开展基因“自动校正(auto-correction)”,从而将基因组重新连接在一起,但是这种修复通常是不完美的。细胞中的天然DNA修复过程能够以一种看似随机且不可预测的方式在断裂位点处添加或移除DNA片段。利用CRISPR-Ca

拟南芥转化

实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培

叶绿体亚分级实验——叶绿体亚分级

实验材料叶绿体试剂、试剂盒裂解缓冲液仪器、耗材微量离心管小型离心机实验步骤1. 将含 1 mg 叶绿素的叶绿体悬液吸至一微量离心管中。2. 在小型离心机中 14000 r/min 离心 30 秒钟,弃去上清。3. 加 1 ml 裂解缓冲液,振荡,冰浴 5 分钟。裂解缓冲液:10 mmol/L HEP

拟南芥的培养

实验概要本实验方法就拟南芥的培养技术进行了简单介绍。主要试剂1. PNS营养液:每升含2.5m1 1M磷酸缓冲液(pH5.5)5ml 1M KN03,2m1 1M MgSO4.7H20,2m1 1M Ca(N03)a.4H20,2.5m1 20mM  Fe.EDTA,1 ml MS微量兀素。2. 人

拟南芥的转化

实验概要本实验采用花浸泡法利用农杆菌介导将目的基因转入拟南芥。主要试剂YEB液体培养基,LB培养基,0.1 M CaCl2,0.05 M MgSO4,花浸泡缓冲液(0.5XMS,5%蔗糖,0. 03%Silwet L-77 ),Rif,Kan主要设备摇床,离心机,培养钵,温室,托盘,塑料薄膜实验材料

Nature发文:揭秘PARP酶修复癌细胞断裂DNA双链的分子机制

  近日,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自圣犹大儿童医院等机构的科学家们通过研究揭示了PARP酶对双链DNA进行断裂修复的结构,相关研究结果表明,PARP2能填补这一缺口并将两条断裂的DNA端连接在一起。此外,本文研究也深入阐明了PARP激活和催化循环背后的分子机制,这对于后期科学

Revo带线锚钉修复急性跟腱断裂术后并发感染病例报告

病例报道患者,男,27岁,2个月前因打篮球摔伤致“左跟腱急性闭合性断裂(距止点约4cm)”,无糖尿病、免疫力低下、糖皮质激素应用病史,在外院行切开Revo带线锚钉内固定跟腱修复术,术后1周切口红肿、脓液流出,经反复换药2个月仍未好转。入本院后常规检查,并行切口分泌物细菌培养、药物敏感试验,结合B超、

从豌豆组织分离叶绿体实验_叶绿体分离

实验材料叶子组织试剂、试剂盒PBF-Percoll 溶液山梨醇BSAHEPES-KOHEDTA仪器、耗材聚碳酸酯离心管实验步骤1. 制备 Percoll 梯度(1) 两个 50 ml 的聚碳酸酯离心管中分别加入 25 ml 50% 的 PBF-Percoll 溶液。50% PBF-Percoll0.

穿晶断裂与沿晶断裂说明什么

锰锌铁氧体的断裂貌似是沿晶断裂,根据我的短口SEM照片来看,有一些气孔,且这些气孔集中于晶界处。一般脆性较大的话应该是沿晶断裂吧。看到文献指出通过添加一些添加剂的方法增厚锰锌铁氧体的晶界以达到提高电阻率的效果,至于这个增厚程度如何是否能够明显强化结合力没看到过类似的文献报道。

如何区分穿晶断裂和沿晶断裂

  沿晶断裂:裂纹沿晶界扩展,可以清楚地看到一个个晶粒,晶粒面比较光滑;  穿晶断裂:也可以看清晶界,但是晶粒面相比沿晶断裂不是那么的光滑,也分为韧性和脆性穿晶断裂;

科学家揭示叶绿体蛋白质量控制新机制

近日,中国科学院植物研究所研究员林荣呈等揭示了叶绿体蛋白质量控制的新机制,发现CDC48复合体可以通过泛素化蛋白酶体途径介导叶绿体内RbcL和AtpB蛋白的降解。相关研究成果发表于《细胞通讯》。 叶绿体是绿色植物和真核藻类特有的细胞器,是光合作用以及许多其他重要生物学过程发生的重要场所。叶

叶绿体DNA分离

设备:Hitachi CS-150GXL或CS-120GXL微量超速离心机,S100AT6 转头,5PA 密封管(如果用4PC管,可接比例减少各层液量)溶液配制:A液:0.35Msorbitol(山梨醇),50mM Tris—Hcl (PH8.0) 25mM EDTA—Na2B液:5%(w/w)So

叶绿体是什么

叶绿体是质体的一种, 是高等植物和一些藻类所特有的能量转换器。叶绿体是含有绿色色素(主要为叶绿素 a 、b)的质体,为绿色植物进行光合作用的场所,存在于高等植物叶肉、幼茎的一些细胞内,藻类细胞中也含有。叶绿体的形状、数目和大小随不同植物和不同细胞而异。

什么是叶绿体

叶绿体叶绿体(chloroplast)植物绿色细胞中存在的有色质体。其内含有叶绿素及类胡萝卜素,是进行光合作用的场所。在高等植物中一般呈椭圆形,长轴4~10微米,短轴2~4微米。它被双层膜(称为外被)包围着,内部为层膜系统和基质(或称间质)所组成。在电镜下观察,每一层膜是由双层膜组成扁平的囊,中间是