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PeerJ:中美合作在三代基因测序软件领域再次取得重要突破

近日,国际期刊《PeerJ》在线发表了中国科学院昆明动物研究所马占山研究员与美国马里兰大学叶承曦博士在基因测序领域的合作再次取得重要突破。研究团队近日正式发布了一款代号为 Sparc 的软件(软件试用下载网址: https://sourceforge.net/projects/sparc-consensus/ ,研究针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%-40%的现实,该团队研发出了一套“线性复杂度”(复杂性最低)的算法,Sparc软件即基于该新算法完成。综合测试显示:采用测序深度仅为30x的三代基因测序数据,Sparc取得组装共识(Consensus) 时错误率低于0.5%;同时与目前最优秀的同类软件相比,Sparc可节省计算时间和内存达80%。这一重要突破为推进基因测序技术迈向三代技术的产业升级提供了又一关键软件技术。 Sparc是马占山研究员2011年回国后该团队在基因测序领域所研发公布的第三款重要软件。2011-......阅读全文

基因测序市场发展现状分析 下一个万亿市场在哪里?

  一项新技术或产品的问世,给人们带来欣喜的同时,也必然会引起担忧,基因测序技术便是其中之一。基因测序技术被看作自疫苗问世以来疾病预防最重要的科技突破,它不仅可以大大降低遗传相关的疾病发生率,减少出生缺陷,还可以实现对疾病预测、预防、预警以及个体化诊疗;但目前,国内的基因测序市场却并不让人满意,甚至

基因测序市场深度剖析

   Technologies(现为Thermo Fisher收购)公司全国临床与科研事业部销售总监、ThermoFisher公司全国临床市场战略总监柴映爽写了一系列文章,对基因测序领域进行了深入剖析。让我们看看这个领域深入工作的人士,怎么看待2015年基因测序市场大热这一现实的。   ▌第一篇:基

用基因测序“治未病”

  在中国两部委(食品药品监督管理局、国家卫生计生委)用一纸禁令将基因测序打入“冷宫”仅两个月,世界最大的基因测序仪器制造商Illumina的掌门人Jay Flatley先生就急冲冲跑来中国,并高调表示:“我十分看好中国基因测序市场。”  可能有人会怀疑Jay Flatley这一逆风言论,但没有人会

专访Illumina公司CEO:中国基因检测服务市场机会巨大

  “我是专程到中国来的,而且这次是带了整个的管理团队到中国来。我们的目的是为了更好地了解并且同我们本地的合作伙伴们进行沟通。”2017年3月22日在阴雨绵绵的上海,Illumina公司CEO Francis deSouza上任后首次到访中国,“如今,中国和美国应该是全球最大的两个基因市场,对于Il

产业风云再起——基因测序

   基因测序领域再迎重大突破  近期有关基因测序领域的利好消息接连不断,相应基因测序板块的个股也有异动,如马应龙就于6月28日强势涨停。新华社消息,美国国家卫生研究院日前批准了首个利用被誉为“基因剪刀”的CRISPR基因编辑技术来治疗癌症的人体临床试验,让这种目前备受关注的生物医学技术在

破译基因测序行业的投资密码

随着基因测序技术的发展和成熟,测序成本快速降低,以及国内对该领域审批政策的放开,市场预计基因测序会有越来越多的临床应用,相关产业进入高速增长期  5月13日,A股基因测序概念集体大涨,千山药机涨停,达安基因涨逾7%,其它概念股也均有不同程度涨幅。  消息面上,5月12日,全球最大的基因测序

基因测序路在何方——专访Life Technologies销售总监柴映爽

  近年来,基因测序技术飞速发展,使得几十个甚至上百个基因的测序能够在几天之内完成,测序的成本也下降到普通百姓可以承受的范围,这使得基因测序的临床应用成为可能。在临床研究方面,外显子组甚至全基因组的基因测序大大加速了疾病分子标志物的寻找,使得多种疾病病因的诊断与分型与以往相比更加精确,在用药时也能更

我国精准医疗如何让基因测序“言听计从”

  基因测序技术是临床分子诊断中的重要手段,其起源早于PCR技术。1968年华裔科学家吴瑞(Ray Wu)博士独创地提出了引物延伸的测序策略,在这一策略基础上基因测序方法得到发展,Sanger和Gilbert因开发不同的测序方法于1980年获得诺贝尔奖。目前的基因测序技术可以分为三类:毛细管电泳测序

华大基因背后的技术武器

  斥巨资采购128台基因测序仪,一举成为全球最大的基因测序中心,全额收购美国纳斯达克上市公司Complete Genomics(下称CG),改变中国生物科技企业被跨国企业单向并购的格局。华大基因向来不按套路出牌。看似有些疯狂的举动,实际是华大基因建立技术优势的精心布局。华大基因的服务规模和测序团队

基因检测行业研究报告:推广策略影响基因公司未来发展

基因检测行业研究报告:推广策略影响基因公司未来发展   中国基因产业发展迅速,几乎进入了世界顶尖水平的阵营。尤其在近三年,基因测序从科研走向临床,产业链逐步完整,不仅壮大了公司实力,更为普通消费者带来多种选择。华大基因旗下的华大科技和华大医学也将登陆资本市场。  进入2014年,随

基因测序仪打开国产化大门

  基因测序   在新的产业格局下,进一步推动基因测序技术产业的协作,已成为业内共识。多位专家表示,我国基因测序产业需要政策、资本、技术等各方面的共同努力,加强基础研发与应用领域的密切沟通,联合推动方能促进产业快速发展。  日前在“中科紫鑫BIGIS二代测序系统推介会”上,全场所有人都将目光锁定在我

中美合作Sparc新软件弥补三代基因测序“硬伤”

   中国科学院昆明动物研究所“计算生物与医学生态学科组”研究员马占山与美国马里兰大学博士叶承曦在基因测序领域的合作取得新的突破。针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的现实,该团队研发出了一套“线性复杂度”的算法,这套算法复杂性最低,基于该新算法完成了Sparc软件的开发。  Sparc

如何使基因测序更好地服务于我国精准医疗

   基因测序和精准医疗是近年来讨论很热的两个概念。这两个词之所以能联系到一起,主要还是因为越来越多与疾病有关的基因得到确认,而更加个性化诊疗的需求,正在对传统的医学模式提出挑战,同时技术进步导致基因测序成本大幅降低,使得人们看到了它应用于临床诊疗的前景。在美国NIH (国家卫生研究院)2015年颁

对话Illumina:基因测序是一把双刃剑?

Illumina公司从事着比谷歌和微软更“神秘”的行业:制造基因测序仪。记者就"基因测序,会不会是一把双刃剑?"等一连串基因测序的话题,提问这家全球“最聪明”的创新企业  人类基因组测序的成本真的已经降到了约1000美元了吗?完成一次测序只需要一天时间?这些听起来很神奇的事情,究竟是如何发生的?基因

三代基因测序技术以及基因检测技术的发展综述

基因是指携带有遗传信息的DNA序列,是控制性状的基本遗传单位,一段具有功能性的DNA序列。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表现。人类约有两万至两万五千个基因。广义上的基因检测指通过血液、组织或细胞分泌物,对染色体、DNA分子进行检测的一系列技术。目前在医疗领

精准医疗时代已至 基因测序数据分析成为关键

  随着医学技术提升、就医环境改善,困扰人们的复杂疾病是否能够得到更加有效的治疗?相关统计显示,针对城市居民死亡率较高的癌症(恶性肿瘤)、心脏病、冠心病等复杂疾病,传统医疗方案的治疗效果并不佳。据WINSymposium公布的数据显示,传统医疗在肿瘤治疗上用药无效率高达75%。人们仍然谈“癌”色变。

突然“叫停”和“解冻”离解决市场次序问题还有多远

  2014年9月24~26日,由中国工程院医药卫生学部主办,中华医学会检验分会、中国医院协会临床检验管理专业委员会、中国医师管理协会检验医师分会、全国生物芯片标准化技术委员会、中国高科技产业化研究会协办, 第二军医大学、生物芯片北京国家工程研究中心、 中国医药生物技术协会生物芯片分会、清华大学承办

国家食药总局加强管理基因测序临床应用

该技术因安吉丽娜·朱莉、乔布斯使用过而被大众熟知。   日前,国家食品药品监督管理总局、国家卫生和计划生育委员会联合发出通知,要求在相关的准入标准、管理规范出台以前,任何医疗机构不得开展基因测序临床应用,已经开展的,要立即停止。通知下发后仍继续开展的,属地卫

基因测序遭遇拷问 业绩兑现还尚早

  如果说大盘蓝筹的上扬得益于政策的引导,那么潜伏在中小板及创业板的医药公司则凭借一波波概念为股价造势。在大盘站上3600高点之前,医药上市公司已悄然发动了一场以“基因测序”为龙头的反击战。正如博时医药保健基金经理苏永超所言:“2014年医药行业指数全年累积涨幅排名在所有行业中表现不佳,整体行业指数

基因测序遭遇拷问 业绩兑现还尚早

  如果说大盘蓝筹的上扬得益于政策的引导,那么潜伏在中小板及创业板的医药公司则凭借一波波概念为股价造势。在大盘站上3600高点之前,医药上市公司已悄然发动了一场以“基因测序”为龙头的反击战。正如博时医药保健基金经理苏永超所言:“2014年医药行业指数全年累积涨幅排名在所有行业中表现不佳,整体行业指数

基因测序法律规定

在网上搜索“基因测序”,能看到多家医疗机构、体检中心,甚至公司提供的体检套餐,内容覆盖肿瘤、高血压、糖尿病等基因检测,价格从数百元到数万元不等。只需一滴血或一点唾液,就能预测罹患多种疾病,如癌症或白血病,国家食品药品监督管理总局、中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会联合发出通知,要求在相关准入标准

华大基因接受14亿元融资生物界暴利时代开启

  一个子公司估值高达33亿元,这就是生物界的暴利。   原本一直“视资本为无物”的华大基因,却突然一反常态地接受了近14亿元融资计划。2012年12月初,华大基因接受了来自光大控股领投、红杉资本等创业投资机构提供的总额为13.98亿元融资。具体的融资额度分配为光大控股投资4 亿元,

基因测序:亟待加入中国元素

近几年,随着基因概念股在股市上的热浪,国际癌症基因组计划完成的消息,启动又停止、停止又启动的高通量测序的唐氏筛查工作等等。每天不断更新的消息使得基因测序这个产业和概念成为了一个非常热门的话题。 在“创新中国智库专题讲座”上,中国科学院北京基因所技术研发中心常务副主任任鲁风作了《基因测序技术

基因建库突破性进展,助力我国精准医疗大有可为

  随着十三五规划和国家健康2030纲要的陆续出台,我国政府也在不断加大对精准医疗的支持力度。P4 China国际精准医疗大会在十三五规划国家精准医疗计划开启元年隆重举办,旨在汇聚政、产、学、研、资各方力量,并将政策、监管、资本、技术、应用、商业整合在一个平台,进一步探讨从系统生物学研究、精准诊断的

PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长

基因测序市场广阔 全球龙头Illumina业绩增长迅猛

  美国基因测序龙头企业Illumina(ILMN)股价在过去10年里大幅上涨16倍,特别是在近四年里上涨了六倍,目前市值已达到270亿美元。Illumina长牛表现的背后,是市场对基因测序应用前景以及该公司产品线的高度看好。在Illumina的研发推动下,人类基因测序成本显著下降,为该技术的商业化

美国龙头企业寻求扩张 基因测序市场广阔

  美国基因测序龙头企业Illumina(ILMN)股价在过去10年里大幅上涨16倍,特别是在近四年里上涨了六倍,目前市值已达到270亿美元。Illumina长牛表现的背后,是市场对基因测序应用前景以及该公司产品线的高度看好。在Illumina的研发推动下,人类基因测序成本显著下降,为该技术的商业化

关于三代基因测序,你所需要知道的都在这儿!

  一、导读:  在大部分投资者对“二代测序”(NGS)还没有搞清技术细节的情况下,“三代测序”(3GS)又火了。  6月17日,医药板块中基因测序相关标的在“三代测序技术获得重大突破”的新闻影响上出现明显涨幅,我们也接到较多投资者对相关新闻的背景及观点的询问。为此,我们结合各方面资料归纳总结了三代

PacBio单分子测序最新科研动态

DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长速度

第三代测序技术:PacBio单分子测序最新科研动态

  DNA基因测序技术从上世纪70年代起,历经三代技术后,目前已发展成为一项相对成熟的生物产业。测序技术的应用也扩展到了生物、医学、制药、健康、农林、园艺、花卉、环保、法医等许多领域,并成为一项与我们衣食住行密切相关的高技术产业。据最新统计,2012年全球基因测序市场的产值已超过百亿,按最近几年增长