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Nature:继DNA之后,科学家再构建蛋白质“遗传图谱”

近日,《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。 这项研究描述了人类血浆“蛋白质组”(proteome)的遗传基础,确定了近1500个蛋白质的近2000种遗传关联。此前,由于技术限制,研究人员只能同时测量少量血液蛋白质。 而现在,研究人员使用一种由SomaLogic公司开发的新技术 “SOMAscan”来测量3300个人血液中的3600种蛋白质。随后,通过分析这些个体的DNA,寻找基因组中与蛋白质水平相关的区域,进而对蛋白遗传的了解比之前增加了四倍。图片来源于网络 蛋白“遗传图谱”的用途 这种基因图谱的用途之一是识别引起疾病的特定生物途径,论文中举例指出了导致克罗恩病和湿疹的特定途径。 “由于过去十年的基因组学革命,我们一直善于发现基因组与疾病之间的统计联系,但却困扰于如何识别致病......阅读全文

蛋白质组学牛人Nature发表重要成果

  第一次结合两种新兴的大规模实验技术:多通道质谱分析法和具有高水平自然遗传多样性的小鼠种群,哈佛医学院(HMS)和Jackson实验室(JAX)的研究人员解决了生物学和医学中一个悬而未决的问题:遗传变异是如何影响蛋白质水平的?  蛋白质是构成所有细胞和生物结构与功能“零件表”的氨基酸链。因此,了解

真核生物基因组-4

(2) 苯丙酮尿症 苯丙酮尿症(PKU)的病因是患者肝细胞缺乏苯丙氨酸羟化酶,使体内的苯丙氨酸不能正常代谢为酪氨酸,导致血清中苯丙酮酸浓度升高。现已知苯丙氨酸羟化酶基因定位于12q24.1,此基因全长约90kb,含13个外显子,在中国人中已发现10余种点突变,这是造成酶活性缺乏的原因。 2.

Nature:科学家再构建蛋白质 “遗传图谱”

  6月6日,《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。   DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2   这项研究描述了人类血浆“蛋白质组

Nature:科学家再构建蛋白质 “遗传图谱”

  6月6日,《自然》杂志发表了一项由剑桥大学和默沙东的科学家领导完成的重要成果:他们成功创建出人类蛋白质的第一个详细遗传图谱。这一突破性研究有望增进我们对各种疾病的了解,并有助于新药的开发。   DOI: 10.1038/s41586-018-0175-2   这项研究描述了人类血浆“蛋

中外科学家Nature子刊绘制蜘蛛基因组图谱

  来自奥胡斯大学和华大基因研究中心的研究人员,在成功完成对蜘蛛基因组的测序后得出了惊人的结论:令人毛骨悚然的八条腿蜘蛛在某些方面与人类相似。  而这并非只是一个可怕的研究发现。这一测序对于未来我们更深入地了解蜘蛛的某些特性具有重要的意义。这一重要的研究成果发表在5月6日的《自然通讯》(Nature

蛋白质组学在植物科学研究中的应用

1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen

微卫星DNA分子标记及其应用

  微卫星(Microsatellite,MS)又称短串联重复(Short Tandem Repeats,STR)或简单序列重复(Simple Sequnce Repeat,SSR),是指基因组中以少数几个核苷酸(多数为2-4个)为单位多次串联重复组成的长达几十个核苷酸的序列。其中最常见的是双核苷酸

RAPD技术应用中的一些问题及对策

摘要:综述了RAPD技术的一些理论性问题,包括RAPD与其它分子标记技术相比的优点,影响结果重复性的因素,显性标记产生的原因,条带取舍的标准等。提出在实验中解决这些问题的一些方法:严格控制反应条件,采用单倍体和单剂量标记,系统学研究中要结合其它方法进行分析,定位基因时要选用合适的群体等。 

微卫星DNA分子标记及其应用(二)

3. 微卫星分子标记技术的应用 微卫星DNA 作为遗传标记具有很大的优越性。近年来随着研究的不断深入,对微卫星标记的研究不仅具有重要的理论意义, 而且还具有较好的应用前景。3.1 微卫星多态性分析在自然界中,生物个体表现出来的各种遗传变异,在本质上就是DNA 的差异,因此通过研究DNA的变异来分

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

Cell、Nature共绘遗传互作图谱

  在遗传学中,总体并不总是组成部分的总和。有时,两个基因共同作用所产生的一种表型,会不同于预期的简单地将两个基因的效应相加。近期来自加州大学旧金山分校的 Jonathan Weissman和Nevan Krogan研究小组在独立研究中首次系统地探索了酵母中的遗传互作。相关论文分别发表在《细

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

Cell:最大规模的蛋白质互作组网络图谱

  人类大约有2万个蛋白质编码基因,尽管自十年前首次完成人类基因组测序以来取得了一些显著的进展,对于这些蛋白质如何在细胞内发挥功能,科学家们仍然只详细了解了其中的一小部分。  作为人类基因组计划的延伸,蛋白质组学领域正在致力揭示蛋白质是如何执行由生成它们的基因所编码的过程的。一些先进的工具已帮助鉴别

人类血浆蛋白质组遗传图谱公开 有助鉴定新的治疗靶点

  英国《自然》杂志6月6日发表了一项遗传学最新成果:剑桥大学研究团队量化了人体血浆中的3000多种蛋白质,成功绘制出人类血浆蛋白质组遗传图谱,其中89%前所未知。该研究发现的遗传变异与个体蛋白水平之间的联系,或意味着可以借此鉴定出新的治疗靶点,并将现有药物用于治疗新的疾病。  血浆蛋白是指血浆中的

MALDI-TOF-MS 在病原微生物鉴定中的研究进展

       基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术是近年来发展起来的一种软电离新

空间蛋白质组学:一种强大的细胞生物学发现工具

真核细胞高度区室化,生物过程被分隔在不同的区室进行。蛋白质功能与亚细胞定位密切相关,不同的区室提供不同的化学环境(例如pH和氧化还原条件)、不同的潜在作用配体或底物。因此,对蛋白质亚细胞定位的严格控制是细胞生理学的重要调控内容。大多数细胞生物学过程涉及蛋白质亚细胞定位的变化,例如转录因子在细胞核-胞

11月王牌聚焦:各种重大图谱成果扑面而来

  时近年末,各种重大成果好似扎堆一样接踵而来,人类蛋白质互作组图谱、人类基因组重组图谱、ENCODE重大成果接连公布,让人眼花缭乱,科学界“过年”的氛围扑面而来。  首先是科学家们公布了迄今为止最大规模的人类基因组编码蛋白直接互作图谱,并预测出了与癌症相关的几十个新基因。这一新“人类互作组(int

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

Nature:大型蛋白互作图谱 阐明疾病机理

  近日,刊登于国际著名杂志Nature上的一项研究论文中,来自德克萨斯大学等处的研究人员通过对大量不同有机体的细胞进行筛查,包括从变形虫到蠕虫到小鼠再到人类机体等,揭示了不同有机体的蛋白质如何进行组装来构建细胞和机体组织。  研究者在文章中揭示了成千上万种新型的蛋白质相互作用方式,其中大约有四分之

章冰博士:首次阐析人类癌症“蛋白组-基因组学”特征

  由范德堡大学领导的一个研究小组鉴别出了驱动大肠癌的一些遗传突变的蛋白质“标签”。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的重要研究,第一次综合阐析了人类癌症的“蛋白组-基因组学”(proteogenomic)特征,这将推动结直肠(大肠癌)癌诊断和治疗取得新的进展。在美国,结直肠癌是仅次于肺癌的第

当质谱技术应用于医学检验……

  质谱技术 (mass spectrometry) 是分离和检测带电粒子质荷比的分析技术。随着离子源及质量分析器技术的变革、质谱仪器设计的快速改进等,质谱技术已成为化学分析领域和生命科学领域非常有效的分析工具,尤其在医学检验中的应用越来越为广泛和深入。  由于质谱技术的高特异性、高灵敏度、单次分析

当质谱技术应用于医学检验

  质谱技术 (mass spectrometry) 是分离和检测带电粒子质荷比的分析技术。随着离子源及质量分析器技术的变革、质谱仪器设计的快速改进等,质谱技术已成为化学分析领域和生命科学领域非常有效的分析工具,尤其在医学检验中的应用越来越为广泛和深入。  由于质谱技术的高特异性、高灵敏度、单次分析

当质谱技术应用于医学检验……

  质谱技术 (mass spectrometry) 是分离和检测带电粒子质荷比的分析技术。随着离子源及质量分析器技术的变革、质谱仪器设计的快速改进等,质谱技术已成为化学分析领域和生命科学领域非常有效的分析工具,尤其在医学检验中的应用越来越为广泛和深入。  由于质谱技术的高特异性、高灵敏度、单次分析

专家点评Cell肺腺癌的帽子戏法 多组学整合精准医学来临

  肺癌是我国也是世界上发病率和死亡率最高的恶性肿瘤【1】,五年存活率不足20%【2】。肺腺癌(Lung Adenocarcinoma, LUAD)是非小细胞肺癌中最普遍存在的分型,大约占所有恶性肺肿瘤的一半【3】。LUAD最普遍的风险因素是吸烟,其他的风险还包括暴露在致癌物以及户外空气污染等等【4

杨焕明:像争夺国土一样争夺基因资源

北京基因组研究所所长杨焕明:像争夺国土一样争夺基因资源 我国科学家10月在深圳宣布,世界上第一个黄种人全基因组标准图绘制完成。承担该项目的华大基因研究中心称,这是我国在承担国际人类基因组计划1%任务、国际人类单体基因10%任务后,用新一代测序技术独立完成的100%黄种人基因组图谱。 从

微生物核酸我都行!新冠疫情拉动采购MALDI-TOF中标汇总

  分析测试百科网讯 近日来,新冠疫情在全球蔓延的速度以及事态的变化令每个人动容。截止到2020年4月3日12时,我国共累计报告新冠肺炎确诊病例82804例,累计死亡病例3331例;而全球新冠肺炎确诊病例累计已超100万例,多个国家确诊病例已超中国:美国成为确诊病例最多的国家累计确诊病例超24万例;

【两会科技热点】蛋白质组学驱动精准医学热潮

胃癌在全球肿瘤死亡原因中排名第三,其中我国的患病人数就占到一半。在很多人的印象中,胃癌就是一种病,但细分的话,它包括弥漫型胃癌等很多种,这些不同类型的胃癌甚至还可以进一步细分。那么,弥漫型胃癌究竟分几种?患者手术后化疗是否有效?预后如何呢?

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该学科的迅速发展

赛尔迪(SELDI)蛋白指纹技术的临床应用与前景

  蛋白质组学(Proteomics)是近年来生物学领域中发展起来的一门新兴学科,它是研究蛋白质的起源、特征、表达功能以及它与生命发生、发展关系等的一门学科。在医学领域中,通过对蛋白质组学的研究,对了解人类生命的起源、疾病的发生发展规律、疾病的诊断与治疗以及疾病的预防有着重要的意义。随着该