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同济大学刘琦教授在Nature旗下刊物发表了研究论文

2015年3月,同济大学生命科学与技术学院刘琦教授在Nature旗下刊物,临床药理学国际著名期刊《Clinical Pharmacology & Therapeutics》在线发表了题为:“Mining drug-disease relationships complements to medical genetics-based drug repositioning: when a recommendation system meets GWAS”的研究论文。该论文工作首次提出了一种基于互联网推荐系统的药物重定位的计算框架模型,并且与传统的基于大规模GWAS数据进行药物重定位的工作进行了比较,实验结果表明该方法具有较低的假阳性和有效的预测结果。 新药开发是一个极其耗时费力的高风险过程。在现有的开发策略中,深入研究已获批准的药物,充分发掘已有药物的新用途(Drug Repurposin......阅读全文

高昂研发成本让药物重定位大行其道

   当一位年轻医生选择在Grant Churchill的药理实验室进行短期培训时,他希望能快速学到治疗工具方面的知识。“我想‘我有个好项目适合你’。”Churchill说。  2010年,英国牛津大学Churchill研究小组正在寻找不使用锂治疗躁郁症的方法。常规药物虽然疗效显著但副作用也很明显。

高昂研发成本让药物重定位大行其道

  当一位年轻医生选择在Grant Churchill的药理实验室进行短期培训时,他希望能快速学到治疗工具方面的知识。“我想‘我有个好项目适合你’。”Churchill说。  2010年,英国牛津大学Churchill研究小组正在寻找不使用锂治疗躁郁症的方法。常规药物虽然疗效显著但副作用也很明显。C

构建癌症基因组学的非组织特异标签的药物重定位新方法

  10月9日,国际学术期刊《细胞通讯》(Cell Reports)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院(营养与健康研究院)计算生物学研究所韩敬东研究组的论文“Accurate Drug Reposition through Non-Tissue Specific Core Signatures

莲单瓣重瓣等性状遗传定位研究中取得进展

  莲(荷花)作为我国传统名花之一,已有几千年栽培历史,其花器官中表现出广泛的多样性,如花色、花瓣数等方面的变化。然而,莲花各种形态特征的遗传变异规律仍不清楚。  针对这一问题,中国科学院武汉植物园研究员陈进明研究团队联合武汉市园林科学研究院,对栽培花莲12个花器官为主的性状进行全基因组关联研究(G

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

Nature子刊:细胞重编程助力药物筛选

  Johns Hopkins大学的研究人员利用iPSC技术进行药物筛选取得了实质性的进展,这项成果为一些遗传疾病提供了成本更低更快捷的药物研发途径,还将有助于发展个性化医疗,用来自患者自身的细胞在体外测试治疗手段的安全性和有效性。文章于十一月二十五日发表在Nature Biotechnol

Cell子刊:细胞重编程加速药物筛选

  最近,美国约翰霍普金斯大学的研究人员报道称,一种实验室培养的人类神经细胞可与心肌细胞搭档,来刺激收缩。因为加速心跳的神经细胞来自于由人类皮肤细胞制成的诱导多能干细胞(iPS),因此研究人员认为,这些细胞——称为交感神经细胞,将有助于我们研究影响神经系统的疾病,也就是说,科学家将能够在实验室里培养

使用转录定位法进行基因定位

许多 RNA病毒的整个基因组往往作为一个单位转录。随着转录的进行,由基因组上各个基因所编码的蛋白质也依序在寄主细胞中出现。当寄主细胞被紫外线照射使本身的蛋白质合成受到抑制时,病毒蛋白的出现更为明显。紫外线照射也起着抑制病毒基因组的转录的作用。紫外线在 RNA分子的某一部位造成损伤后,损伤的部位和它后

用缺失定位法进行基因定位

缺失定位法一个细胞中的两个同源染色体中的一个上有一个突变基因,另一染色体上有一小段已知范围的缺失,如果这一突变基因的位置在缺失范围内,便不可能通过重组而得到野生型重组体;如果突变基因不在缺失范围内,那么就可以得到野生型重组体。利用一系列已知缺失位置和范围的缺失突变型,便能测定突变型基因的位置。

基因定位方法介绍--单元化定位法

在构窠曲霉这一类真菌的准性生殖过程中,杂合二倍体细胞在有丝分裂时常随机地丢失它的染色体。染色体在多次有丝分裂过程中逐条丢失而使二倍体细胞终于转变为单倍体细胞的过程称为单元化。如果一对染色体中带有显性的野生型基因的染色体丢失了,那么同源染色体上隐性基因的性状便得以表现。此外,通过体细胞交换也可以从杂合