美国政府停摆给中国生命科学界的警示
美国政府停摆给中国生命科学界的警示：中国需要自主的“国家生物信息学中心“ 10月1日，由于美国民主、共和两党尚未解决新财年的政府预算分歧，联邦政府的非核心部门被迫关门了两个多星期。其中医学、药学及生命科学从业者及研究者依赖度甚高的NCBI(美国国立生物技术信息中心)网站在此期间处于基本维持状态，数据暂停更新。 NCBI 是由美国参议员Claude Pepper于上世纪80年代后期发起成立。30多年来，NCBI负责收集、存储、注释关于分子生物学、生物化学、遗传学等方面的数据信息，通过开发大量的软件和数据库为国际生命科学的研究提供数据的搜索、浏览、分析和下载服务。这些服务已成为国际生命科学研究重要的生物信息学基础。 美国政府停摆 NCBI暂停更新对中国研究者的影响更甚，由于中国尚未有自主的国家级生物信息学中心(简称：国家中心)，中国生命科学研究人员高度依赖NCBI的服务。如果因为政治、经费或其他......阅读全文
生物信息分析数据挖掘
DNA芯片技术能够在基因组水平分析基因表达，检测许多基因的转录水平及在不同条件下的基因转录变化，显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。基因芯片产生了海量的数据，仅仅进行差异表达分析还远远不够，如何管理分析这些数据、从中挖掘信息已经成为利用这一技术的新的难点。芯片数据大量出现
首届科学数据大会探讨“科研大数据与数据科学”
2月24日，首届科学数据大会在中国科学院大学国际会议中心举行。包括中科院院士郭华东、陈润生，中国工程院院士汪懋华在内的400多名专家、青年科研人员参会。 中科院副院长、国际科技数据委员会(CODATA)中国全国委员会主席丁仲礼向会议发来贺信。他在贺信中表示，科研大数据和数据科学的作用越来越
生物学家借助数据科学破解生命奥秘
自2000年人类基因组图谱绘制后，生物学研究迈入全新的“组学”时代，科学家们争先恐后地测序各种有机生物的基因组或蛋白质组。 现在，即使一些简单的实验都会产生大量数据，而从“背景噪音”中获得想要的结果则成为了一大挑战。美国趣味科学网站近日报道指出，计算机技术正帮助科学家们征服这些数据大山，甚至提
科学家开发完成水稻多组学数据整合和信息共享数据库
水稻不仅是世界近一半人口的主要粮食作物，同时也是一种重要的模式生物。高通量测序技术的迅速发展促进了水稻组学数据的广泛积累，使深入研究控制水稻重要农艺性状、种质资源多样性以及水稻驯化过程的机制成为可能。为此，研究人员构建了相关的水稻数据库，主要包括RAP-DB（日本农业生物资源研究所构建的水稻注释
科学家呼吁共享新能源数据信息提高产出
可再生能源领域数据共享机制的缺乏正在阻挠技术进步，让改善能源市场错失良机。 能源产业一直在通过改变能耗速率满足人们的需求。控制一个燃油发电厂的发电量，就像改变一辆汽车的速度一样：踩下油门踏板，就会有更多汽油涌向发动机。 但风能却不能如此随心所欲。不过，智能软件却可以让风电厂提高能效，增强对位
生物信息学数据库和软件的搜索实验
实验方法原理熟练掌握上网搜索生物信息学数据库和软件的方法及技能。实验材料电脑实验步骤一、搜索生物信息学数据库或者软件数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域。核酸序列数据库有GenBank， EMBL， DDB等，蛋白质序列数据库有SWISS-PROT， PIR，OWL，
科学数据，如何科学管理
《科学数据管理办法》（以下简称《办法》），2018年1月经中央深改组审议通过，近日由国务院办公厅正式印发。《办法》旨在进一步加强和规范科学数据管理，保障科学数据安全，提高开放共享水平，更好地为国家科技创新、经济社会发展和国家安全提供支撑。 这是我国第一次在国家层面出台科学数据管理办法。当前，为
科学数据，如何科学管理
《科学数据管理办法》（以下简称《办法》），2018年1月经中央深改组审议通过，近日由国务院办公厅正式印发。《办法》旨在进一步加强和规范科学数据管理，保障科学数据安全，提高开放共享水平，更好地为国家科技创新、经济社会发展和国家安全提供支撑。 这是我国第一次在国家层面出台科学数据管理办法。当前，为
农残数据库：高分辨质谱+互联网+数据科学/地理信息技术
近日，由市场监管总局组织实施，中国检验检疫科学研究院庞国芳院士团队牵头承担的国家科技基础性工作专项项目“水果和蔬菜中农药化学污染物残留水平调查及数据库建设”项目综合绩效评价会在京召开。庞国芳院士代表项目团队进行了情况汇报，杨志峰院士、任发政院士、李培武院士等13名专家听取了汇报，根据项目任务内容
国家微生物科学数据中心：保障主权，推动共享
细菌、病毒、真菌、支原体、衣原体…… 谈及它们，你定会避之不及。但是，你知道吗？在地球生物圈，它们占据着重要位置——环境、食品、医药、健康、工业、农业、化学化工、材料、生物安全，与人类存续相关的所有环节，几乎都与它们有关。其家族成员还包括放线菌、立克次氏体、螺旋体……它们，都是微生物。 微生