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罗氏454测序分析软件升级

罗氏公司近日宣布推出一款新的软件包(v2.8),能显著改善其GS FLX+系统上长读取鸟枪法测序的性能。这一测序平台能带来百万个读取,其读长超过1000 bp。此次改进将让研究人员发现更多复杂的遗传变异,并揭开隐藏在基因组、转录组和宏基因组样品中难以测序的区域下的生物学秘密。 罗氏测序解决方案的总裁Thomas Schinecker表示:“此次最新的软件发布代表了GS FLX+ 系统的长读取性能在满足客户的预期上又向前迈进了一大步。全世界30多个顶尖的测序实验室正在使用我们的新软件,他们的反馈非常好。” 自GS FLX+系统上市以来,研究人员已经证实了超长读取的价值,能带来更完整的全基因组de novo组装,出色的全长转录组分析,以及更好的宏基因组样品鉴定。新软件将进一步改善这些应用的测序结果,并为454测序系统的生物信息学工具带来新的功能改进。 RIKEN Omics科学中心和横滨市立大学......阅读全文

研究人员绘出苹果基因组草图

  一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。  意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果

癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

   研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。   这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道

研究人员发现:霍乱正改变人类基因组

  生命演化到今天,人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明,当代人类也在进化,而引发这种进化的,竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明:在霍乱流行的孟加拉国,人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案

研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组

  新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说,该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制,寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。   相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说,艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖

研究人员发布最新版树鼩基因组注释

  树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物,是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短(约6周),饲养成本低,单胎产仔数较高(每胎2-5只)等特点,在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前,树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建,是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究

安捷伦授予临床基因组研究人员Peter Robinson“思想领袖奖”

  分析测试百科网讯 2016年11月29日,安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC,以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候,中国中医科学院中药研究所所长陈士林(详见本网报道:中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”)和癌症研究

日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱

  据日本共同社报道,日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。  DNA一共有4种碱基排列组合,人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片,对大量切片同时

研究人员在实验室生成胰岛β细胞

   对于糖尿病研究者而言,在实验室生成全功能胰岛β细胞是一项挑战。当人体干细胞在培养皿中发育成β细胞时,它们仅达到前体阶段,不能充分成熟。这就使其无法有效产生可以响应葡萄糖的胰岛素。近日,研究人员在《细胞—新陈代谢》期刊上撰文称发现了一种能在试管中激活该细胞成熟过程的蛋白质。这将有助于打破长期存

研究人员在实验室生成胰岛β细胞

  对于糖尿病研究者而言,在实验室生成全功能胰岛β细胞是一项挑战。当人体干细胞在培养皿中发育成β细胞时,它们仅达到前体阶段,不能充分成熟。这就使其无法有效产生可以响应葡萄糖的胰岛素。近日,研究人员在《细胞—新陈代谢》期刊上撰文称发现了一种能在试管中激活该细胞成熟过程的蛋白质。这将有助于打破长期存在的

研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”

  人类对基因组变异的认识又向前推进一大步:西安交通大学日前传出消息,该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构,通过开发新的计算机算法和分析处理流程,分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异,其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异,即基因组中的“暗物质”。