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癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些信息。”美国纽约斯隆·凯特林癌症中心(MSKCC)研究人员Charles Sawyers表示。 如今,美国和欧洲的一些大型医学科学研究中心正期望通过汇集关于患者肿瘤基因组及其临床结果的数据改变这一切。近日,美国癌症研究协会(AACR)在一次于波士顿举办的会议上宣布了此项计划。它的名字叫GENIE,是一个很绕口的首字母缩略词,分别代表着基因组、证据、肿瘤形成、信息和交流。此项计划由帮助研制出抗白血病药物格列卫的Sawyers牵头。格列卫是最成功的基因靶向疗法之一。 Sawyers表示,GENIE源自和其他癌症中心同行的谈话。他们正在......阅读全文

“10,000个癌症基因组计划”宣告完成

  旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划已正式宣告结束。这一于2006年启动,耗资1亿美元的研究项目现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consort

梳理疾病生物标志物最新进展

  个体化医疗正越来越受到临床医学界的重视,而生物标志物是实施个体化医疗的基础。生物标志物(Biomarker)是近年来随着免疫学、分子生物学和基因组学技术的发展而提出的一类与细胞生长、增殖、疾病发生等有关的标志物;能反映正常生理过程或病理过程或对治疗干预的药物反应,在早期诊断、疾病预防、药物靶点确

医疗领域应用大数据的难题:收集信息

        6月8日消息,科技博客网站今天发表文章称,许多机构的研究人员正在探索如何利用人工智能和大数据,为癌症等疑难病症找到更好治疗方法,目前已取得进展,但他们在收集患者信息上遇到难题。  IBM、波士顿制药公司 Berg

肠道微生物组进展一览

  本期为大家带来的是肠道微生物相关领域的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Nutrition Reviews:饮食对肠道菌群的影响  DOI: 10.1093/nutrit/nuz106  根据乔治华盛顿大学(GW)和美国国家标准研究院(National Institute of Sta

PCAWG联盟6篇Nature、15篇Nature子刊揭示癌症的复杂性

  一项大规模的国际努力对来自38个人体组织的2600多个肿瘤基因组进行了多方面研究,从而对癌症的遗传基础产生了丰富的见解。  早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。在发表在最新

多种测序技术或将深入推动癌症领域研究

  本文中小编整理了多篇文章,来解读测序技术在阐明癌症发生机制、癌症诊断及疗法开发等方面的巨大潜力,与各位一起学习!  【1】JAMIA:新工具深入挖掘外显子测序结果 帮助找到最佳癌症治疗药物  doi:10.1093/jamia/ocw022  科罗拉多大学的研究人员最近在国际学术期刊JAMIA上

“大数据”助力人类疾病研究

  近年来,科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:CC0 Public Domain  【1】Front Immunol:大数据帮助设计更好的流感疫苗  doi:10.3389/fimmu.2019

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

大数据分析如何助力人类癌症、HIV等多种疾病的研究?

  近年来,科学家们逐渐开始使用大数据分析来对多种疾病进行研究,当然,研究人员也取得了多项研究进展,本文中,小编就对近年来相关研究成果进行整理,分享给大家!  【1】Cancer Immunol Res:科学家有望利用大数据分析来预测癌症患者对免疫疗法的反应  doi:10.1158/2326-60

全民测序时代 基因测序到底有什么用?

  近两年精准医学的概念逐渐深入人心,这是一种将个人基因、环境与生活习惯差异考虑在内的疾病预防与处置的新兴方法。2015年1月20日,美国总统奥巴马在国情咨文中提出“精准医学计划”,希望精准医学可以引领一个医学新时代。随后习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委,要求国家成立中国精准医疗战略专家组,科

瓶中基因联盟将于明年初发布参考材料 首发基因型

  作为一个致力于研究人类基因组测序参考材料的团体,瓶中基因联盟(Genome in a Bottle Consortium)计划于明年初发布其首个试点参考材料、高度表征的HapMap样本以及一组高度可信的基因组检测。   该团体最近发布了一组基于公开提供的测序数据之分析进行的高度可信的基因组

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

GEN:大数据挖掘对癌症治疗的四大影响

  2016年1月在瑞士达沃斯召开的世界经济论坛上的一个panel讨论中,美国副总统Joe Biden当场要求临床医生和研究者举例表示人类在抗击癌症中突破的障碍。当几个重要话题浮现时,最重要的议题是“大数据”,具体而言,即“大数据”的收集、分析和应用。  研究者表示:“大数据”是有效的,这是因为有重

癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑

图片来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w  2001年,人类基因组计划完成,整个计划花费约30亿美元,1985年提出,1990年正式启动,历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一,该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的

6篇Nature齐发!癌症基因组计划成果成井喷之势

  除了Nature一次性发表6篇论文外,Nature Genetics杂志发表了3篇,Nature Communications发表9篇,Nature Biotechnology一篇,详细报道BioArt后续会陆续发布。文章合集网址:https://www.nature.com/collectio

GEN:专家解析 大数据研究对于癌症治疗的焦点问题

  在今年一月,美国副总统拜登在瑞士达沃斯世界经济论坛的科学家小组讨论中提出了一系列攻克癌症的具体要求。其中,怎样通过大数据的收集、分析与应用来研究、预防与治疗癌症成为了一个格外引人注目的话题。  专家:  Keith Perry:圣裘德儿童研究医院高级副总裁和首席信息官  Narayan Desa

2017年5月CRISPR/Cas亮点盘点

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。  

2017世界科技发展回顾

  尽管安全性一度遭到质疑,但基因编辑技术发展势头不可阻挡。  基因测试新技术  新概念造影剂“纳米MRI灯”  巴西转基因大豆  记录DNA数据  具隐身效果的膜材料(模拟效果图)  耐水性超薄太阳能电池  美 国  基因编辑技术火热 干细胞研究获突破  美科学家开展了该国首个对人类胚胎的基因编辑

2016年肿瘤干细胞重磅研究进展

  肿瘤干细胞是一群具有自我更新、多向分化潜能、具有启动和重建肿瘤组织表型能力的肿瘤细胞。前期研究均表明,肿瘤干细胞参与肿瘤的转移、复发和对化疗和放疗耐受。因此,靶向肿瘤干细胞的治疗策略将有望为癌症的治疗带来希望。科学家们也在肿瘤干细胞的研究中投入了不少精力,试图通过肿瘤干细胞的研究解决肿瘤起源及治

Nature对儿童癌症基因组分析,有望实现儿童癌症精准治疗

  在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院等研究机构的研究人员证实患有癌症的儿童和成年人通常具有不同的发生突变的基因来促进疾病产生,这提示着这些患者可能受益于不同的疗法。这一发现强调了对儿童癌症进行精准医疗的必要性。相关研究结果于2018年2月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“P

2017年5月Cell期刊不得不看的亮点研究

  5月份即将结束了,5月份Cell期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Cell:皮肤中的调节性T细胞促进毛发再生  doi:10.1016/j.cell.2017.05.002  在一项新的研究中,来自美国加州大学旧金山分校的研究人员通过开展小鼠实验发现作为一类

2016年11月4日Science期刊精华

  2016年11月7日/生物谷BIOON/--/生物谷BIOON/--本周又有一期新的Science期刊(2016年11月4日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。  1.Science:蛋白翻译后突变---利用自由基化学让蛋白侧链多样化  doi:10.1126/science.aag14

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

大大简化药物发现过程的新方法

  最近在《Nature Biotechnology》发表的一篇论文,来自麻省理工学院-哈佛大学布罗德研究所和Dana-Farber癌症研究所的研究人员描述了一种新的方法,大大简化了早期药物发现中一个费力的实验过程。他们的方法称为PRISM,采用一种分子条形码系统,以前所未有的规模和速度,在癌症和其

科学家尝试破解一小撮异常反应造福广大癌症患者

   如果X与大部分晚期膀胱癌患者一样,她可能现在已经死了。在第一次确诊后,她接受了标准化疗。结果失败了。然后,她参加了一个药物临床试验,该药物最初被批准用于治疗其他肿瘤,但科学家希望知道,它是否能作用于转移性膀胱癌。结果似乎不行——参与试验的其他患者进展情况均不好。  但X却好于预期。美国纽约纪念

Nature:乳腺癌的第一次大规模蛋白组-基因组研究成果

  基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据,美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组(proteogenomic)”研究,将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行,包括贝勒医学院、MIT和哈佛的

IVD这个细分领域未来市场容量或达200亿

  2017年6月,世界经济论坛与《科学美国人》杂志的专家委员会联合选出了2017年度全球十大新兴技术榜单,其中肿瘤的无创诊断技术成功入选并荣膺榜首。肿瘤无创诊断技术即液体活检(liquid biopsies)的出现,标志着人类在攻克肿瘤的道路上又前进了一大步。与传统的组织活检相比,液体活检具备实时

临床测序重磅成果!300多种肿瘤,突变数据集问世

  肿瘤分子分析是精准肿瘤医学的基本组成部分,它能够识别基因以及通路中所发生的变化,这是个性化医疗的关键。不同组织复发性突变的存在,加上分子靶向治疗组合的扩大,这就需要灵活且综合性的方法来分析全癌谱中与临床相关的基因。  5月8日,Nature Medicine杂志在线发表了一篇“大作”,科学家们采