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基因表达系列分析实验(SAGE)

实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心管水浴锅带冷冻的热控制 循环仪96 孔 PCR 板干冰 甲醇浴台式离心机平台型摇床UV 盒滤镜Spin-X 离心过滤管微电击杯Bio-Rad 基因脉冲电转装置培养管实验步骤实验所需「材料」、「试剂」、「耗材」具体见「其他」1. 刮取细胞时准备 Dynabeads ,洗涤缓冲液和 5×第一链缓冲液混合液(置于冰上)。2. 充分悬起 Dynabeads oligo (dT)25,转移 100 ul 到一个无 RNase 的硅烷化微量离心管里,置于磁座上。30 s 后去除上清,不要扰动磁珠。3. 轻弹或轻轻涡旋把磁珠重悬于 500 ul 裂......阅读全文

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微

源资信息科技:数据挖掘和通路分析专家

  2010年全国质谱大会暨第三届世界华人质谱研讨会于2010年7月30日~8月1日期间在吉林长春顺利召开,源资信息科技(上海)有限公司在此次大会上主要向与会者介绍了高级化学分析软件(ACD/labs)及系统生物学中的GeneGo软件,引起了与会专家、参会代表及各大仪器厂商的极大兴趣。

基因突变导致他汀类药疗效不同

  Sage Bionetworks 机构的科研人员利用数据性状分析新方法,发现了一突变基因会导致患者服用他汀类药后出现肌肉疼痛和虚弱的症状,该基因的表达产物甘氨酸转脒基转移酶(glycine amidinotransferase,GATM)用于调控肌酸的合成速度。研究成果公布在《Natur

Nature新发现:导致疗效不同的基因突变

  研究人员采用一种新方法,发现了一种可能会导致一些患者服用他汀类药物,出现肌肉疼痛和虚弱的基因变异,这一研究成果公布在今日出版(8月29日)的 Nature杂志上。研究人员指出,利用他汀类药物进行治疗,一种称为甘氨酸转脒基转移酶(glycine amidinotransferase,GAT

SSH抑制性消减杂交文库构建方法介绍

SSH是一项可以快速获取两个不同生物材料中差异表达基因的分子生物学技术,是快速筛选差异表达基因的有效方法,也是寻找新基因的重要手段。该技术尤其适合以genome尚不完全清晰的物种或者以特殊材料为研究对象的科研工作者。是基因芯片技术的有效补充。基本流程:通过差减文库构建,文库验证和筛选(逆向斑点杂交)

蛋白质(十五)主要研究

主要研究历史在18世纪,安东尼奥·弗朗索瓦(Antoine Fourcroy)和其他一些研究者发现蛋白质是一类独特的生物分子,他们发现用酸处理一些分子能够使其凝结或絮凝。当时他们注意到的例子有来自蛋清、血液、血清白蛋白、纤维素和小麦面筋里的蛋白质。荷兰化学家格利特·马尔德(Gerhardus Joh

癌症为什么发生在特定细胞里?单一细胞测序可以解答!

   我们都知道癌症的起源离不开细胞突变,我们体内很多细胞的突变都可能会引起癌症,但相应的是,也有很多突变并不会导致癌症的发生,而如何辨别这些突变会不会引起癌症便是一个癌症早期防治的关键问题,在最新发表的一篇研究报告中,研究人员们探究了视网膜母细胞瘤与特定细胞突变的关系。Frolov 与 Ariss

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提...(一)

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法概述:木本热带植物中含有大量复杂的有机化合物,这些有机化合物会抑制提取RNA或DNA所需的化学程序,从而不利于后续研究及应用,如RNA测序和基因表达分析。为了克服这个问题,研究人员必须使用CTAB / PVP缓冲液的提取方案,而不能使用市售的

Nature :一款新软件有望成为科学数据分享新利器

  Titus Brown一边飞行在太平洋上空,一边深潜到学生的研究代码中。从美国东兰辛市密歇根州立大学到澳大利亚墨尔本参加会议的这次长途旅行,给这位生物信息学家详细检查实验室的新运算法则以及去除RNA序列中的错误提供了一次良机。   3年前,Brown必须要等回到办公室后才能这样做,因为如果不经

【重要风向标】JP.Morgan:2017全球生物技术框架

  第35届JP摩根医疗健康年会将会如约在旧金山举行,作为世界顶级的医疗健康投资者年会,JP摩根健康年会从创立之初便吸引着千万来自全球各主要地区和国家的生物技术创业者和资本与金融界的行业达人。JP摩根是怎么看2017年全球生物科技领域未来的发展呢?  一、核心行业的基本面继续走强  生物科技领域仍处

【重要风向标】JP.Morgan:2017全球生物技术框架

  第35届JP摩根医疗健康年会将会如约在旧金山举行,作为世界顶级的医疗健康投资者年会,JP摩根健康年会从创立之初便吸引着千万来自全球各主要地区和国家的生物技术创业者和资本与金融界的行业达人。JP摩根是怎么看2017年全球生物科技领域未来的发展呢?  一、核心行业的基本面继续走强  生物科技领域仍处

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