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《自然方法学》:可视蛋白质组学

瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体(Leptospira interrogans)这种病原体中定位蛋白复合物的新方法,称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。 活细胞中的生化进程分为多个功能单元,它们在细胞内有着特定的时间和空间分布。一般来说,这些单元是相互作用蛋白形成的复合物。定量质谱常常用于确定蛋白复合物的组成,但这种方法需要多个细胞的裂解液,但这样一来,空间信息就损失了,特定细胞的特有性质也就看不见了。 低温电子断层扫描术(cryoET)是一种三维观察细胞的成像技术。在目前可实现的分辨率下,它能鉴定并定位冰冻含水标本中的大蛋白复合物。这是通过模板匹配来实现的,将代表特定蛋白复合物的信号与cryoET收集的信号联系起来。多个蛋白复合物的结构特点组合,就有可能描述出特定细胞的立体蛋白质组结构,这个过程就称为“可视蛋白质组学”。这种方法已经应用到无细胞系统中,它在完整细胞中的......阅读全文

蛋白质组学概念的起源和发展

  蛋白质组学的诞生和发展,离不开多学科和技术的逐渐交叉融合。这些学科技术包括(但不限于)基因组学、生物化学、分析化学、自动化、基于电磁场的精密质谱仪、信号处理、数理统计和计算机科学。近年来,分子医学、大数据技术和人工智能的发展,进一步加速推动了蛋白质组学的成长,使之在精准医疗领域展示出越来越大的应

人类蛋白质组学计划将从启动阶段进入全面实施阶段

  ——访中国蛋白质组学专业委员会副主任、复旦大学杨芃原教授   不久前,第六届中国蛋白质组学大会在江苏泰州成功召开,会议盛况空前,可以看出我国的蛋白质组学研究队伍的壮大。会后的间隙,我们有幸采访到了主要参与会议组织的中国蛋白质组学专业委员会副主任、复旦大学杨芃原教授,希望杨教授为大家介绍一下国际

蛋白质组学的标准化(下)

  蛋白质组学信息学研究组   蛋白质组学信息学研究组的任务是教育蛋白质组学研究实验室最大程度地应用和实践生物信息学方法,向精确和复杂的蛋白质组学数据分析方向发展。iPRG积极地支持和参与开发和提高新的算法、软件工具以及蛋白质组信息学战略,目标是向全体会员教育和介绍这些新技术。iPRG已经发起了两

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

瑕瑜:用化学反应的灵感改造质谱 解决脂质组学的难题

  质谱在现代科学研究中正发挥着日益重要的作用。分析化学家使用质谱,研究基础科学和应用技术领域的挑战性课题,做出有影响力的工作。随着社会与经济的迅猛发展,科学仪器研发与应用研究从未像今天这样如此紧密地联系在一起。对质谱而言,仪器研发、分析方法与应用研究正成为相互推动、共同发展的有机整体。质谱仪器或关

张玉奎院士等专家在2012年北京色谱年会上作大会报告

  2012年12月07日,北京,2012年北京色谱年会热烈召开。促进了北京地区色谱以及色谱相关领域的技术应用与交流。围绕“色谱新技术及其应用”的主题,展开多场报告,内容包括蛋白质组学、色谱技术、色谱与质谱、色谱与核磁共振、金属组学、代谢组学、生物气味研究、环境分析等。中国科学院大连化学物理研究所张

何大澄教授:蛋白质组学已经成为细胞生物学的基础

  2013年12月8日,由首都医科大学附属北京朝阳医院、AB SCIEX公司主办的第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参

2019年,中国“大农业”里那些高科技

   今年,我国“大农业”科研领域又诞生了诸多令人惊奇的发现,每一条都与我们息息相关。它们涵盖了观赏农业、林业、作物、医学等各个领域,包括睡莲、玉米、硅藻等进展。为了展现这些成就,本报特此就我国农业科学家今年发表的大部分重要论文进行梳理,以飨读者。野生玉米大刍草、SK、现代玉米自交系ZHENG58的

全国生物医药色谱会大会报告(二)

  2012年4月21-22日,全国生物医药色谱及相关技术学术交流会在美丽的山城重庆成功召开。大会设立主会场和3个分会场,其中大会报告16个、分会报告90个、征集墙报论文100篇。  大会报告内容广泛,涉及色谱及色谱分离材料最新技术进展、烟草特有亚硝胺分析、生物标志物及毒剂溯源检测、毛细管电泳方法研

中科院生物物理研究所:活性“蛋白质” 捕光“梦工厂”

  蛋白质,英文名称“protein”,是生物体中广泛存在的一类生物大分子,也是生命活动的主要承担者。  时值春暖花开,在中国科学院生物物理研究所寻访,本报记者在这里看到的“蛋白质”,不仅充满科学的奥妙和神奇,而且彰显出其应有的活泼、活性与活力,恍若走进一所“梦工厂”。那么

《自然—方法学》:蛋白质结构分析新技术创测定速度纪录

  过去需几年时间完成的工作现在仅用几天即可完成   据美国物理学家组织网7月20日报道,隶属于美国能源部的劳伦斯伯克利国家实验室的科学家开发出一种利用小角度X射线散射技术测定蛋白质结构的新方法,大大提高了蛋白质结构研究分析的效率,使过去需要几年时间完成的工作仅需要几天即可完成,这将极大地促进结构

刘丽宏主任:洞悉世界先进理念,开展应用型药学研究

  2013年12月8日,第四十期质谱沙龙活动在北京朝阳医院顺利举办,来自北京师范大学、北京朝阳医院、中科院微生物所、空军总医院的百余名专家学者齐聚一堂共同参加了此次沙龙活动。北京朝阳医院总药剂师药事部主任 刘

张玉奎:分析化学已“无孔不入”

  ——访中国科学院院士张玉奎  分析测试百科网讯 “上个世纪是化学的世纪,而这个世纪是生命科学的世纪,大家的重点是研究人、研究生命科学,化学也随着这个潮流,自然转向了以生命科学为重点。”中科院院士、中科院大连化学物理研究所研究员张玉奎说。  张玉奎院士在色谱领域做了多年研究,近年来,随着分析化学和

中国人类蛋白质组计划(CNHPP)正式启动

“中国人类蛋白质组计划(CNHPP)”正式启动  今天上午,“中国人类蛋白质组计划(CNHPP)”在军事医学科学院召开第一次工作部署会,国家科技部、总后勤部相关领导、重点专项管理委员会成员及全国40多个科研单位的70余名院士、专家出席,这标志着CNHPP全面启动实施,这是我国科学界乃至世界

浙江中医药大学韩贤林教授发表Nature综述文章

   浙江中医药大学的韩贤林(Xianlin Han)教授在7月29日的《自然综述内分泌学》(Nature Reviews Endocrinology)杂志上发表了一篇题为“Lipidomics for studying metabolism”的综述文章,介绍了脂质组学(Lipidomics)在代谢

浙江中医药大学韩贤林教授发表Nature综述文章

   浙江中医药大学的韩贤林(Xianlin Han)教授在7月29日的《自然综述内分泌学》(Nature Reviews Endocrinology)杂志上发表了一篇题为“Lipidomics for studying metabolism”的综述文章,介绍了脂质组学(Lipidomics)在代谢

941项/人,教育部公布2019年度科技奖候选项目/候选人

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郭天南:全景式组学研究为新冠重症早诊断提供决策依据

  分析测试百科网讯 在新冠肺炎COVID-19疫情肆虐全球之际,PCR技术在快速筛查中已大显神威,但进入临床后如何更早地区分轻症和重症患者,从而更准确地治疗和用药?5月27日中国研究人员在《Cell》发表文章,利用蛋白质组学和代谢组学的全景式分析,发现了重症患者体内应对病毒进攻特征性的分子改变,并

沃特世:同中国科学家深度合作共促糖组学创新

  分析测试百科网讯 如果说基因是生命的起点,那么糖蛋白的表现很大程度上就是研究生命功能的终点。人类蛋白中有50%以上都发生了糖基化的修饰,在病理和生理过程中糖蛋白发挥了至关重要的作用,在生物制药中最亮眼的单抗药100%都是糖蛋白药物。对糖蛋白和糖蛋白质组学的研究是贯穿生物制药、疾病与临床研究生生不

质谱沙龙第三十三期活动报道

  2011年9月25日,第三十三期质谱沙龙活动在北京大学分析测试中心成功举行。来自第二炮兵总医院、北京大学、中科院微生物研究所、中国医学科学院基础医学研究所、空军总医院、AB SCIEX公司、北京艾米诺医学研究有限公司等,近四十位专家、学者、技术工程师参加了本次沙龙活动,本次沙龙以大分子为主题,共

破译蛋白质组 打开生命“解剖图”

 据新一期英国《自然》杂志报道,人类蛋白质组组织前主席约翰·伯杰龙发起一项大规模的破译人类蛋白质组计划,目标是花费约10年时间将人体所有蛋白质归类并描绘出它们的特性,并揭示它们在细胞中所处的位置以及每种蛋白质与其他哪些蛋白质存在相互作用。 早在上世纪90年代,科学家就已经启动了基因组计划

聚焦药物和蛋白 质谱技术创新开发临床应用研讨会落幕

  分析测试百科网讯 2018年7月6日,由上海市徐汇区中心医院/复旦大学附属中山医院徐汇医院,中国科学院上海临床研究中心,上海市徐汇区医学会共同主办,分析测试百科网承办的“质谱技术的创新开发及临床应用研讨会”在上海市徐汇区中心医院召开(相关链接:聚焦质谱技术创新开发与应用 拓展临床质谱方法学研究)

蛋白质组学的标准化(上)

Tim Wehr   由于人类基因序列的建立已经接近完成,人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域,蛋白质组学将其研究目标定位于:鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质,这样做的预期是,将能发现那些能够成为疾病生物标志物(bioma

蛋白质组:解码生命的“天书”

   人类和老鼠的外貌可说是天渊之别,但实际上他们却有着近99%相同的基因组。何以“失之毫厘差之千里”?正是蛋白质放大了他们基因上的细微差别。   日 前,中国人类蛋白质组计划全面启动。“基因组学中微小的差异,在蛋白质组学中可以被千倍甚至几近万倍地放大。”亚太蛋白质组组织主席、中国科学院院士贺福 初

八方交流,聚焦应用——第二届北京临床质谱论坛分外精彩

  分析测试百科网讯 2019年3月15-16日,由首都医科大学附属北京妇产医院、京津冀妇女与儿童保健专科联盟检验子联盟共同主办,分析测试百科网承办的“第二届北京临床质谱论坛”在北京长富宫饭店召开,共有500人左右参与本次会议。本次会议涵盖:大会主旨报告、小分子质谱临床检测、大分子蛋白多肽的质谱

董梦秋:化学交联质谱让结构生物学研究如虎添翼

  在蛋白质组学分析方法中,质谱获得的是多肽序列结构的信息;那么用质谱是否可研究大分子蛋白的结构信息?近几年来,董梦秋实验室在中国做出了多项先驱性工作,主要集中在化学交联质谱领域。在用单颗粒冷冻电镜技术研究结构生物学屡创佳绩的当下,很多研究者都把样品一分为二,一份做冷冻电镜,一份做交联质谱。那么交联

近期《自然》期刊系列中发挥关键作用的赛默飞质谱仪

   【导语】在2011年10-11月期间,在一级科学刊物Nature和Nature Methods上有14篇科研论文使用赛默飞世尔LTQ-Orbitrap或TSQ质谱仪产生数据,聚焦的主题包括:目标物发现与定量研究,Top-down蛋白质组研究绘制蛋白质异构体,同位素标签方法的精度,提高糖蛋白质组

贺福初院士数篇文章解析SARS研究突破

贺福初院士实验室SARS研究取得系列重要进展 蛋白质组学国家重点实验室、军事医学科学院放射与辐射医学研究所贺福初院士实验室在2003年“非典”爆发后,当即组织力量编写出版了国内第一本《严重急性呼吸系统综合征(SARS) 》专著,此后一直致力于其相关的基因组学和蛋白质组学研究,在此领域取得系列重要进

英国《自然》杂志在线发表军事科学院重磅成果

  2月28日凌晨,英国《自然》杂志在线发表由军事科学院军事医学研究院生命组学研究所、国家蛋白质科学中心(北京)、蛋白质组学国家重点实验室贺福初院士团队、钱小红研究员团队联合复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队、北京大学肿瘤医院邢宝才教授团队在早期肝细胞癌蛋白质组研究领域取得的重大科研成果。文章测定了早

第34届中国质谱学会学术年会报告 探讨质谱技术新进展

  分析测试百科网讯 2016年9月10日,由中国质谱学会主办,中国科学院青海盐湖研究所和安特百科(北京)技术发展有限公司联合承办的“第34届中国质谱学会学术年会暨全国会员代表大会”在西宁召开(相关报道:第34届中国质谱学会学术会在西宁开幕 共享质谱顶尖技术)。会议首日,15位报告人分别作了精彩的大