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蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并在1995 年7月的“Electrophoresis”上发表,指“一个细胞或一种组织基因组所表达的全部蛋白质”[2], 蛋白质组学(proteomics) 是从整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律。与基因固定不变的基因组不同,蛋白质组作为相应基因组所表达的产物随时间、地点、环境等条件变化。在同一机体不同的组织和不同细胞中、蛋白质的种类、数量不同; 即使同一组织或细胞在不同的发育阶段、生理状态、甚至不同的外界环境下,其蛋白质组也是在不断的变化之中; 在病理或治疗过程中, 与正常生理过程也不同。因此, 蛋白质组是一个动态的概念。其目的是从整体的角度分析机体内动态变......阅读全文

鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展

【摘要】鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中,这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切,以肽段为鉴定单元,继而推导真实的样品蛋白质。由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率,而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失,所鉴定的蛋白质难免存在

质谱检测法与蛋白质分析(一)

质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高,希望检测技术的灵敏度也越来越高,同时能够对更为复杂的样品进行分析处理,因此推动了质谱检测技术的发展,出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质

质谱检测法与蛋白质分析

在生命科学研究工作中有一个重要问题,就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息,我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来,从原则上来说,也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗,透过这个窗口,我们就能够对复杂的细胞调控网

质谱检测法与蛋白质分析(二)

  离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪   随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化,我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪,我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不

Western blotting蛋白印迹市场概况和主要品牌及产品

近日,MarketsandMarkets咨询公司发布了全球western blotting市场的分析报告。据MarketsandMarkets预测,全球western blotting的市场规模将从2016年的5.75亿美元增长到2021年的7.31亿美元,复合年均增长率达4.9%。另一家Futur

“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术

  1999年,Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun),其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索,从而确定蛋白质的种类,可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称

2009年北京色谱年会隆重召开

  2009年12月11日上午9时许,由北京理化分析测试技术学会色谱学会主办的2009年北京色谱年会在京东宾馆第一会议室隆重召开。来自全国色谱界专家、厂商技术专家、青年研究者和学生300余人参加了会议。 2009年北京色谱年会会场     中科院化学所 刘国诠教授  &

ETD:将成为蛋白质组学研究的标准方法

——访赛默飞ETD技术发明人John E.P. Syka 博士  【导语】质谱已经成为开展蛋白质组学研究的基础平台,更确切地说,具有MS/MS功能的质谱已成为蛋白质组学研究的基础平台。过去,CID/CAD技术是实现MS/MS功能的唯一手段,在蛋白质鉴定的自下而

2013年全国无机及同位素质谱学学术会议大会报告(一)

  2013年11月23日-25日,2013年全国无机及同位素质谱学学术会议在江苏昆山隆重召开,来自全国高等学校,科研机构和企业的200余位从事质谱工作的专家学者参加了大会。本次大会由中国质谱学会主办,无机质谱、同位素质谱和仪器与教育业委员会联合承办,江苏天瑞仪器协办,旨在推动我

质谱沙龙第十期活动报道

2008年7月27日下午,质谱沙龙第十期活动在西苑医院实验楼举行。会议有来自二炮总医院、西苑医院、医科院药物所、朝阳医院、北大医学院、北医三院、空军总医院、AB公司等老朋友,还有来自农业部畜禽产品质检中心、北京生命科学研究所等新朋友。沙龙活动的成员,以前较多的是来自医院的朋友,近来吸引了一批来自农/

《细胞》子刊11篇文章重磅回顾,这些年兴起的大牛技术

  还记得CRISPR-Cas9基因组编辑技术,cryo-EM,甚至高通量测序技术未出现之前,我们是怎样进行研究的吗?其实大家不用回忆太久,因为这不是很久以前的事。在过去几年间,生物学研究技术进步步伐快的让人难以置信。  Cell出版社旗下Molecular Cell杂志推出了技术特刊,介绍了新技术

第二届全国药品质量分析论坛圆满闭幕

  2011年4月20日,第二届全国药品质量分析论坛的第二天,首先进行了为期半天的分会报告,从事化学药品、生化药品、中药、中药注射剂、药包材/药用辅料的专家学者继续给出了精彩的报告,每场报告后都进行了热烈的互动交流。下午,来自中国食品药品检定研究院的林瑞超教授、江苏省食品药品检验所的樊夏雷主任、国家

沃特世环形离子淌度:750极限分辨率,打开科学新大门

  分析测试百科网讯 在ASMS 2019上,沃特世发布了两款全新的离子淌度Q-TOF质谱——SELECT SERIES Cyclic IMS和SYNAPT XS系统。2019年7月在北京和上海,沃特世隆重举办两场“质谱技术开放日”活动,正式向中国市场推出了两款ASMS新产品及应用于临床

聚焦安全与营养 2院士出席首届食品安全检测仪器大会

  分析测试百科网讯 2017年11月23日,“第一届全国食品质量安全检测仪器与应用学术大会”在北京京仪大酒店开幕。此次会议由中国仪器仪表学会主办,中国仪器仪表学会食品质量安全检测仪器与技术应用分会、中粮营养健康研究院、北京理化分析测试学会承办。此次会议将持续到24日,会议将围绕国内外食品安全与营养

寻找中西医学交汇点 推动中医药国际合作

  个体治疗:中医药学的临床特色与优势   上海中医药大学附属曙光医院沈远东   中国传统医学是发祥于中国古代的研究人体生命、健康、疾病的科学,它具有独特的理论体系,丰富的临床经验和科学的思维方法,是以自然科学知识为主体,同时还受到中国古代哲学思想的深刻影响与人文社会科学知识相交融的医学科学

2019中国生命科学领域CNS盘点:曹雪涛 颜宁 施一公上榜

  截至2019年12月23日,中国学者在Cell,Nature及Science在线发表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已经全部更新),iNature团队对于这些文章做了系统的总结:  按杂志来划分:Cell 发表了31篇,Nature 发表了44篇,Scie

Nature:乳腺癌的第一次大规模蛋白组-基因组研究成果

  基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据,美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组(proteogenomic)”研究,将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行,包括贝勒医学院、MIT和哈佛的

2011年度北京市电子显微学年会在国家图书馆成功举行

  报告题目:GL-69系列离子减薄仪的最新进展   报告人:钢铁研究总院钢拓冶金技术研究所李树强先生 钢铁研究总院钢拓冶金技术研究所 李树强 先生   在透射电子显微学的研究领域,样品制备技术是极为重要的环节。目前用离子减薄技术制备透射电镜的薄膜样品是最为理想的方法,主要有一下几个优

强!中国学者用最短时间突破100篇CNS生命科学领域成果

  截止2020月7月27日,中国学者在Cell,Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果,其中新冠肺炎领域占了近一半(共43篇)。iNature系统总结了这些研究成果:   按杂志来划分:Cell 发表了30篇,Nature 发表了45篇,

亲和层析实验:常规方法

实验步骤一、亲和介质的选择亲和纯化的成功取决于是否选择了合适的固相载体和配基。理想的亲和介质 (如吸附配基的固相载体)应该具备孔隙大、理化性质高度稳定的特征。亲和介质可以选择性的捕获相应耙标,既保证较弱的非特异性吸附,又可以在整个过程中维持良好的流动特征。优选介质应具备便宜、易获取和使用简便的特点。

亲和层析实验:常规方法

实验步骤 一、亲和介质的选择 亲和纯化的成功取决于是否选择了合适的固相载体和配基。理想的亲和介质 (如吸附配基的固相载体)应该具备孔隙大、理化性质高度稳定的特征。亲和介质可以选择性的捕获相应耙标,既保证较弱的非特异性吸附,又可以在整个过

第八届微全分析系统学术会议生物分离专场(上)

  2013年5月17日,由中国化学会主办、厦门大学承办、复旦大学、浙江大学协办的第八届全国微全分析系统学术会议、第三届全国微纳尺度生物分离分析学术会议暨第五届国际微化学与微系统学术会议在美丽的海滨城市厦门隆重召开。以下是生物分离专场精彩报告。北京大学 刘虎威教授  来

生物信息学在人类基因组计划中的应用

生物信息学是当前生物学领域的研究热点,预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加,近期生物信息学将在以下几方面迅速发展:大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务,它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前

Science医学:新技术加速癌症生物标记物筛查

  来自苏黎世联邦理工学院的研究人员开发了一种新程序可用于测试癌症生物标记物的临床利益。这种方法可能会大大缩短从实验室到进入临床应用的道路。相关论文发表在7月11日的《科学转化医学》(Science Translational Medicine)杂志上。   蛋白质生物标记物对于个体化医疗至关

大跃进 | 中国学者CNS发表超过100篇生命科学领域研究成果

  【50】2019年4月12日,中科院上海药物所徐华强,王明伟,浙江大学张岩及匹兹堡大学医学院Jean-Pierre Vilardaga共同通讯在Science发表题为“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

2019年中国学者发表CNS统计,谁是CNS发表之王?

  【51/52】2019年4月4日,清华大学柴继杰课题组、中科院遗传发育所周俭民课题组和清华大学王宏伟课题联合同期背靠背发表两篇重量级Science文章,完成了植物NLR蛋白复合物的组装、结构和功能分析,揭示了NLR作用的关键分子机制,是植物免疫研究的里程碑事件。两篇文章分别是: "Li

肿瘤的精准医疗

   2015年年初,美国总统奥巴马在国情咨文演讲中正式启动了“精准医疗计划”,白宫官网发布精准医疗计划的相关细节,随后美国癌症研究协会年会(AACR)在美国召开,此次会议汇集了目前所有癌症主要领域的最先进研究成果,“精准医疗”的概念再次聚焦了全球的目光。当前的肿瘤治疗正逐渐从对“症”治疗向对“基因

密理博的世纪转型

2008年3月5日,北京清华科技园国际会议中心内座无虚席,主题为“干细胞研究和表观遗传学的科学前沿”的 “Millipore 2008 亚洲生物高峰论坛-北京站”隆重举行,来自全国各地的380多位相关研究领域的重要科学家和研究者出席了此次由Millipore公司主办,北京大学干细胞中心,北京大学干细

膜蛋白分离方法

1 细胞质膜资料1895 年 ,Overton 从研究细胞透性得出 " 细胞膜由连续的脂类物质组成 " 。1925 年 Gorter&Grendel: 用脂单分子膜技术测定细胞膜中脂分子的总面积,提出: "细胞膜是由双层脂分子组成 " 。1935 年

《Nature》子刊重磅揭秘帕金森发病机制!这种蛋白是关键!

  帕金森病是一种常见的神经系统变性疾病,我国65岁以上人群PD的患病率大约是1.7%。大部分帕金森病患者为散发病例,仅有不到10%的患者有家族史。  多年来,科学家们已经知道帕金森氏病与脑细胞内α-突触核蛋白质的积聚有关。但是,这些蛋白质团块如何导致神经元死亡是一个谜。  蛋白质聚集和线粒体功能障