Antpedia LOGO WIKI资讯

鸟枪法蛋白质鉴定质量控制方法研究进展

【摘要】鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中,这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切,以肽段为鉴定单元,继而推导真实的样品蛋白质。由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率,而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失,所鉴定的蛋白质难免存在部分不可靠结果。 因此,蛋白质鉴定的质量控制在蛋白质组学研究中极为重要。蛋白质鉴定的质量控制包含两大类主要方法,其一为利用肽段进行蛋白质组装,当前最常用也被证明最有效的方法是使用简约原则,即用最少的蛋白质解释所有鉴定肽段,现有的方法可以分为布尔型和概率型,其二为鉴定蛋白质的可靠性评估,包括单个蛋白质鉴定置信度和蛋白质鉴定整体水平的假阳性率计算。综合各种可辅助蛋白质鉴定的先验信息,构建普适的概率统计模型,是目前蛋白质鉴定质量控制方法的发展趋势。 蛋白质组学研究最基本任务就是定性和定量地鉴定一个组织或细胞中的全部蛋白质[1, 2......阅读全文

5分钟了解:啥仪器让蛋白质组学界诞生如此多牛人大咖

  蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1994年澳大利亚的Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念,1997年

更快更灵敏的timsTOF Pro:为蛋白质组学而生

  分析测试百科网讯,今年9月国际人类蛋白质组学大会(HUPO)上,布鲁克公司发布timsTOF Pro捕集离子淌度飞行时间质谱,该产品获得了由分析测试百科网组织评选的2017 ANTOP大奖,奖项名称为“蛋白质组学创新质谱技术奖” 。BCEIA展会上,分析测试百科网编辑采访到布鲁克道尔顿中国区高级

4D-蛋白质组学:如何通过软件创新变得更强大?

  在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。  当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得

通过软件创新打造更强大的4D-蛋白质组学技术

  在过去的二十年中,新技术、新方法的重大进步使蛋白质组学成为蛋白质科学家、生物学家和临床研究人员的一个极其强大的工具1。随着分析仪器的不断发展,蛋白质组学研究的每一项技术进步都会产生更多的数据。与此同时也给生物信息学软件的开发带来了新挑战。  当代基于高通量质谱的蛋白质组学方法使人们对生命过程获得

“鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术

  1999年,Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun),其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索,从而确定蛋白质的种类,可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

蛋白质组质谱新方法一览

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

ABI/MDS发布新型5800 MALDI TOF/TOF质谱仪

  2009年4月9日   Life Technologies' Applied Biosystems公司和它的质谱合作伙伴MDS公司,今天发布AB Sciex TOF/TOF 5800质谱仪,这是近6个月来该公司第二次发布重要的产品。这次发布是跟随他们发布AB Sciex 5500三重四极杆质谱

第三届原位电离质谱会议日程公布

  在成功举办了前两届原位电离质谱会议(2013厦门、2014张家界)的基础上,由中国质谱学会主办、华质泰科公司承办的第三届原位电离质谱会议(AIMS2015)将于2015年4月2