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Cell子刊综述:干细胞研究单细胞定量分析

了解调控细胞命运的关键分子是干细胞研究的核心问题,这需要在单细胞水平上定量分析分子和细胞行为。近年来技术进展实现了单个细胞高通量分子解析,以及持续性的非侵入式细胞行为观察。 Cell Stem Cell发布综述:“Quantitative Single-Cell Approaches to Stem Cell Research”,回顾了可用于单细胞水平上分析干细胞命运的先进技术,比如细胞谱系示踪(lineage tracing),延时成像和分子谱分析(molecular profiling)等。同时这一综述也分析了这些技术的优点和缺陷,解析了它们的关键技术限制,数据注释和注意事项。 干细胞发育调控 干细胞在被触发成为功能性细胞(如肝脏、心脏或血细胞)之前,存在于一种“基态”。是什么触发了这一变化,与细胞内的基因如何、何时、以什么顺序表达,或打开和关闭,有很大的关系。表征在干细胞中起作用的基因表达,对于理解健康和疾病的基......阅读全文

单细胞水平揭示造血干细胞扩增的动态图谱

  造血干细胞具有自我更新和分化的生物学特征,既可以维持其自身在造血组织中的恒定数量,又能向红系、粒系、巨核系和淋巴系等多种血细胞分化。造血干细胞移植广泛应用于白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征等临床血液系统恶性肿瘤的治疗,然而,造血干细胞来源不足,限制其广泛应用。因此,如何模拟体内造血干细

高通量单细胞技术获得新突破

  人类肠道是一件了不起的事情。每周,肠道都会再生一层新的内皮细胞,脱落的表面面积相当于一个小型公寓,并用新的细胞进行修复。几十年来,研究人员已经知道,负责这一改头换面行为的是肠道干细胞,但是直到今年,美国北卡大学教堂山分校(UNC)医学、细胞生物学和生理学、生物医学工程副教授Scott Magne

如何实现高通量的单细胞分选?

 单细胞分选通过集成基于介电的单细胞捕获释放和电磁阀吸吮技术,实现了高速流动状态下单细胞的捕获、采集、释放和分选,通量达~60个细胞/分钟。    为了进一步提高通量,研究人员提出,单细胞经液滴包裹后,通过耦合介电可实现高通量分选。  首先,液滴表面凸/凹的形状会产生透镜效应,影响激光聚焦,降低空间

单细胞多组学高通量测序平台(一)

一单细胞多组学高通量测序技术简介通过测序手段检测细胞多层次信息,如基因组、表观组、转录组甚至蛋白组已经成为生物学研究的重要手段。几乎一切生命体的活动都围绕着DNA->RNA->蛋白质的过程,而现有的组学技术也围绕这一过程获取信息(如DNA层面的基因序列),从而解读生物体运行机制,应用于疾病的诊断和治

单细胞多组学高通量测序平台(二)

虽然single-cell sequencing的方法仍在不断推出,但是目前使用最为广泛、商业化成熟的方法仍是10×Genomics公司推出的ChromiumTM系统。1.2以RNA-seq为例介绍高通量单细胞测序技术单细胞测序的最主要难点是如何在短时间内分离得到最可能多的单个细胞,早期的技术代表F

高通量单细胞转录组测序发展与展望

单细胞转录组测序技术这几年的发展之快,运用之广已众所周知。为更好的在国内推广该技术,也为更好的将该技术运用到广大科研工作者的实际工作中,上海生物芯片有限公司生物信息团队通过对该技术的整理和归纳,在《生命科学》杂志上发表了名为“高通量单细胞转录组测序发展与展望”综述文章,希望能进一步提升科研工作者对该

单细胞测序这样的高通量技术的优势

单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin

谢晓亮:从单细胞研究到高通量测序

  2011年7月第八期《自然—方法学》刊登了Monya Baker撰写的一篇人物特写,详细介绍了在当期发表的论文 “Fluorogenic DNA sequencing in PDMS microreactors”的主要作者哈佛大学谢晓亮教授的高通量测序技术。全文翻译如下:  在科学界,

尼古丁会在单细胞水平上影响胎儿发育

  怀孕的准妈妈们需要注意了,又有新证据表明吸烟会对腹中胎儿造成极大伤害。美国一项新研究显示,尼古丁会在单细胞水平上对人类胚胎发育产生广泛不利影响,新生儿暴露在尼古丁环境下3周后,就可能导致多种出生缺陷。   尼古丁是烟草的主要化学成分。已有大量动物模型研究表明,怀孕期间暴露在尼古丁环境下会增加

单细胞分选对于高通量需求具有重要意义

单细胞分选可以依据荧光信号的强度挑出特定生物学属性的细胞,相比起其他单细胞分离技术(如有限稀释法、激光捕获显微切割、显微操作等),其特定类型的单细胞获取更具准确性。    另外,依赖于精确的液滴分析模式,采用32等份液滴分选模式,实现液滴的精确分析,可以准确判断相应液滴中目标细胞的数量,因此可以准确