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10标串联质谱标签(TMT)能更快速定量肿瘤蛋白

在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通路的鉴定。图片来源于网络 然而,实体瘤组织在组成上比细胞系要复杂得多,至少包含了上皮、基质和血液成分。人们需要更复杂且更耗时的方案来处理实体瘤组织,才能检测到低丰度的蛋白(如癌基因和肿瘤抑制因子)。为此,在液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析之前必须降低样品的复杂性。 基于这个目的,Broad研究所蛋白质组学平台的研究人员近日在《Nature Protocols》杂志上报道了一个经过优化的新流程,能够快速且重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量。 “我们介绍了一个经过优化的流程,它是利用10标串联质谱标签(TMT)来进行多重分析和相对定量,从而对组织或细胞系实现整体的蛋白质组和磷酸化蛋白质......阅读全文

串联质谱方法属于临床哪个专业组

蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。NM R技术最大的优点不在于它的分辨率

串联质谱的分类和主要串联方式

  空间串联和时间串联。空间串联是两个以上的质量分析器联合使用,两个分析器间有一个碰撞活化室,目的是将前级质谱仪选定的离子打碎,由后一级质谱仪分析。而时间串联质谱仪只有一个分析器,前一时刻选定-离子,在分析器内打碎后,后一时刻再进行分析。本节将叙述各种串联方式和操作方式。  质谱-质谱的串联方式很多

10标串联质谱标签(TMT)能更快速定量肿瘤蛋白

  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)的蛋白组学研究表明,将蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据与基因组数据相整合,才能改善癌症通路的鉴定。图片来源于网络  然而,实体瘤组织在组成上比细胞系要复

串联质谱的工作原理

  为了得到更多的有关分子离子和碎片离子的结构信息,早期的质谱工作者把亚稳离子作为一种研究对象。所谓亚稳离子(metastable ion)是指离子源出来的离子,由于自身不稳定,前进过程中发生了分解,丢掉一个中性碎片后生成的新离子,这个新的离子称为亚稳离子。  这个过程可以表示为: m1+m2+ +

Nature Protocols 快速重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量

  Broad研究所蛋白质组学平台的研究人员近日在《Nature Protocols》杂志上报道了一个经过优化的新流程,能够快速且重复地对肿瘤蛋白进行深度分析和定量。  在过去十年中,基因组学研究已经系统绘制了人类癌症的遗传改变,但这些改变对蛋白质组的直接影响还知之甚少。NIH临床蛋白质组学肿瘤分析

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

什么是串联质谱筛查

串联质谱筛查:两个或更多的质谱连接在一起,称为串联质谱(MS-MS)。最简单的串联质谱由两个质谱串联而成,其中第一个质谱仪(MS1)作为分离器,第二个质谱仪(MS2)作为分析仪来对混合物直接进行分析。串联质谱技术可以应用于其他领域:疾病生物标记物(Biomarker  of Diseases),临床

什么是串联质谱筛查

串联质谱筛查:两个或更多的质谱连接在一起,称为串联质谱(MS-MS)。最简单的串联质谱由两个质谱串联而成,其中第一个质谱仪(MS1)作为分离器,第二个质谱仪(MS2)作为分析仪来对混合物直接进行分析。串联质谱技术可以应用于其他领域:疾病生物标记物(Biomarker  of Diseases),临床

分析串联质谱的优、缺点

所谓的串联质谱就是两个或者更多的质谱仪连接在一起,进行分析样品的技术。两个质谱串联而成的质谱联用技术是简单的,通常个质量分析器(ms1)将离子预分离或加能量修饰,由第二级质量分析器(ms2)分析结果。三级四极杆串联质谱是常用的串联质谱,级和第三级四极杆分析器分别为ms1和ms2,第二级四极杆分析器所

什么是串联质谱筛查

串联质谱筛查:两个或更多的质谱连接在一起,称为串联质谱(MS-MS)。最简单的串联质谱由两个质谱串联而成,其中第一个质谱仪(MS1)作为分离器,第二个质谱仪(MS2)作为分析仪来对混合物直接进行分析。串联质谱技术可以应用于其他领域:疾病生物标记物(Biomarker  of Diseases),临床