下一代测序技术将改变生物学现状（二）
最新的新一代测序仪操作只需一个人，24小时内可产生与几百台桑格毛细管测序仪同样多的序列数据。此外，样品中DNA损伤与常温贮藏的状态以及新一代测序误差等因素往往超过了序列变异，因此很难确定样品来源于现代人类还是古穴人。相比较而言，断言长毛象的某一特定顺序是来源于古代标本，而不是现代污染物更容易，因为现代大象不像人类会经常处在实验室环境中。要在基因组范围内得到古代哺乳动物真正的序列，需要对某一区域进行反复的分析或者结合多种方法来确定其来源，这又要求大量削减成本来额外开展该项目。如果能完成这一项目而且能突破为复杂的多来源的DNA混合物测序的难题，将使测序地球上的任何生态系统成为可能，它也为测序至少十万年前的古代动植物打开了一扇窗户，这些都远远超出了我们以前的预想。新一代测序仪已被用来再测序先前公布的参考细胞株，同时它也首次被允许查找基因组水平上的所有突变。在2005年，Velicer[14]等人首次从一种进化了1000代的结核分枝杆菌......阅读全文
下一代测序技术将改变生物学现状（二）
最新的新一代测序仪操作只需一个人，24小时内可产生与几百台桑格毛细管测序仪同样多的序列数据。此外，样品中DNA损伤与常温贮藏的状态以及新一代测序误差等因素往往超过了序列变异，因此很难确定样品来源于现代人类还是古穴人。相比较而言，断言长毛象的某一特定顺序是来源于古代标本，而不是现代污染物更容易，因为现
下一代测序技术将改变生物学现状
新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了，它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而，要研发出新一代基因测序法，必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。 1977年，Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技
下一代测序技术将改变生物学现状（一）
新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了，它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而，要研发出新一代基因测序法，必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。1977年，Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技术的论文[1
DNA测序技术的现状和发展（二）
三、新一代DNA测序技术DNA测序技术已广泛应用于生物学研究的各个领域，很多生物学问题都可以借助高通量DNA测序技术予以解决。过去三年，大规模平行 测序平台（massively parallel DNA sequencing platform）已经发展为主流的测序技术，这项测序技术的出现不仅
下一代测序技术临床应用现状和发展趋势
自DNA双螺旋结构解析开始，人们在探究健康与疾病基因组复杂性与差异性上付出巨大努力，测序通量限制和高昂成本成为人们深入分析基因组的首要障碍，2005年推出高通量测序技术初步解决了这个问题，人类基因组测序成本迅速下降，由此产生一个新名词：下一代测序(next－generation sequenci
新测序技术将彻底改变白血病治疗
在白血病这种疾病中，每个细胞都可能表现出不同的遗传性状，现在，来自瑞典的研究人员已经找到了一种廉价的方法来检测单个细胞。这一研究突破发表在10月14日的《Nature Communications》，可能彻底改变白血病的治疗。延伸阅读：单细胞研究在治疗儿童急性淋巴细胞白血病中的重要作用。 细胞
DNA测序技术的现状和发展（十二）
2.1.3 剪切后的短片段作图软件包要将RNA的逆转录片段cDNA重新定位到基因组当中需要更加复杂的专业化算法。要将不同外显子经过剪切拼接之后生成的RNA短片段重新定位到基因组中和将一个外显子生成的RNA短片段重新定位到基因组中是完全不一样的（图14）。在RNA逆转录产物cDNA的定位操作中用到的诸
高通量测序技术应用发展现状
根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等，主要有以下几种：大规模平行签名测序(MassivelyParallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、Illumina
DNA测序技术的现状和发展（九）
与在扫描隧道显微镜（scanning tunneling microscope, STM）中一样，使用合适的探针（电极），可以得到纳安级（nano-ampere）的电子隧穿电流。使用这种纳安级的电流检测碱基的速度比在直径不到 3nm的纳米孔中使用皮安级的电流检测要快得多。虽然这种方法只需
DNA测序技术的现状和发展（八）
虽然这些最初的纳米孔实验并没有获得预期结果，但它们至少显示出纳米孔在单分子技术方面的应用优势，例如高度的敏感性，同时也带动了纳米孔核酸分析技术的研究热潮，并在理论及实验方面取得了一些成果。自从发现在电场力作用下，长达1000个碱基的单链DNA分子也能通过纳米孔之后，人们就更加坚信， 廉价的纳米孔
DNA测序技术的现状和发展（十）
五、更多阅读1. 核糖体印记与深度测序技术将核糖体图谱（ribosome profiling）和深度测序（deep sequencing）相结合，研究人员可以从基因组水平监测蛋白质的翻译状况。深度测序的强大功能对生物学研究的各个领域都产生了极大的影响。在诸如全基因组测序等方面，新技术的高效性和经济性
DNA测序技术的现状和发展（三）
1.1.1 摩尔定律对454测序仪的影响454测序仪的迅猛发展不是因为我们想要Sanger测序仪小型化，而是因为新型奔腾芯片的出现以及摩尔定律法则给我们带来的希望。很明显，常规的人类基因测序项目会对我们处理测序技术的能力提出更高要求，这与我们对计算机处理能力的要求是一样的。不过，只有将计算机的电子管
DNA测序技术的现状和发展（一）
一、我们将如何应对海量的基因信息新一代测序技术带给人们大量遗传信息的同时，却成为限制其广泛应用的一个障碍。1980年，英国生物化学家Frederick Sanger与美国生物化学家Walter Gilbert建立了DNA测序技术并获得诺贝尔化学奖，至今已有近三十年了。在这三十年，DNA测序技
DNA测序技术的现状和发展（七）
3. 新一代测序技术的前景在2007年6月，James Watson的基因组序列登录到了GenBank数据库当中，这是第一次使用非Sanger测序法获得了人类个体基因组序列，并且第一次将个人基因组序列公之于众。整个测序过程在两个月之内就完成了，花费不到100万美元，这只占耗时10年之久的人类
DNA测序技术的现状和发展（四）
1.1.3.2 模板制备程序完全的体外大规模模板制备工作是达成高通量、低价格测序技术的前提。已广泛使用的乳液PCR扩增技术就是一种很好的方法。不过，由于很难在热循环测序反应中保证乳液微滴的稳定性，因此最开始实验的模板扩增方法是恒温扩增法（isothermal）。乳液PCR不需要借助细菌的帮助就能扩增
DNA测序技术的现状和发展（十一）
2.1.2 短片段作图软件Maq和Bowtie（见表16）都属于上述提及的程序。它们使用的是一种称作“建立索引（indexing）”的策略。同时，人们也对大量的DNA序列建立了一份索引，借助这份索引就能快速地找到其中的短DNA片段了。Maq软件是基于一种直接的但是很有效的策略——空位种子片段索引法（
DNA测序技术的现状和发展（六）
2. 用于处理新一代测序技术数据的软件和标准各种新一代测序仪的飞速发展面临着一个极其重要的问题，那就是生物信息学问题，这些问题包括序列质量评分（sequence quality scoring）问题、序列比对问题、序列组装问题、数据发布问题等。下面将逐个进行讨论。2.1 序列质量问题目前，序列质量评
DNA测序技术的现状和发展（五）
1.3 AB SOLiD测序仪AB SOLiD测序仪可以对由任何方法制成的DNA文库进行测序。AB SOLiD测序仪有一个极大的特点就是能够将富集模板片段的微珠在芯片上进行高度可控的任意排列。AB SOLiD测序仪也是使用如图5a中所示的微乳液PCR方法扩增模板片段的，不过，它这里使用的
FDA批准下一代测序基因检测技术
2月19日，美国药品管理局（FDA）批准了"23 and me"公司发明的，对引起"布鲁姆综合征"（一种可能导致身材矮小并伴随高发性癌症的疾病）的主效基因进行检测手段。 这一检测手段主要针对准备生育的人群。如果双亲这一基因都具有"BLMAsh"表型的话，子女就会出现这一症状。一般情况下发生的几
中国有望翘楚下一代基因测序技术
北京——2012年8月24日，当世界首例胚胎移植前接受全基因组筛查的试管婴儿（IVF）在中国湖南省诞生之时，喜悦之情洋溢在中国基因组学者和医学专家心中。 中国属于出生缺陷率较高的国家，高达5.6%，即100例新生儿中出生缺陷婴儿超过5例。总体上，约有8，000种单基因突变导致的缺陷疾病，这给家
二代测序技术
人们常说“事后诸葛亮”，可见“料事如神”是一个让人艳羡的能力。现代科技的发展让人们无限接近这种能力，天气预报就是现代人诸多“料事如神”本领中的一种，不断进步中切实提高了生活品质与舒适度。个人体会进步主要体现在两个方面：1.越来越说人话。印象里小时候听天气预报感觉听的是中文，但是这些中国话想表达什么听
下一代测序(NGS)技术市场潜力巨大
尽管下一代测序(NGS)技术的应用还处于早期阶段，事实上它已获得研究者和临床医生们的倍加青睐。研究者和临床医生们采用下一代测序(NGS)技术对复杂疾病进行分子水平的深度研究，以揭示患者的基因组信息与疾病间的相关性。 下一代测序(NGS)技术是一项颠覆性的生物技术，它产生了海量的基因序列数据，需
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变，一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定，因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变，同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，所以又被称为深度测序(de
单细胞测序技术应用和发展现状研究
一背景概况单细胞测序技术是指能够在单个细胞的水平上，对基因组或转录组进行高通量测序分析的一项新技术。与传统高通量测序相比，单细胞测序不仅能够分析相同表型细胞的异质性，还能获取难以培养微生物的遗传信息以及珍贵的临床样本的信息，具有广阔的应用前景。细胞是生命的单位，目前大部分的基因检测均是从组织中抽提D
新电池技术将改变未来能源市场格局
近日，3M公司宣布其突破性的新电池技术，凭借更轻薄、更安全、更高效的性能，或许将改变全球能源市场的格局。 该技术较传统电池在核心材料上有两点创新。首先，传统的电池阳极材料由石墨粉末组成，能量储存率低且消耗快。在蓄电池、锂电池的基础上，新电池用有机硅材料研制电池阳极，创造高于传统石墨粉末两倍
鲜奶分级标准将出台，将改变好奶卖不出好价现状
新国标中将对原奶中的优质奶源与一般奶源区分开来。 东方IC 资料行业人士指出，生乳分级制度将鼓励“养好牛、产好奶”的氛围，尤其是改变当前越是规范化大型牧场反而因为管理成本偏高而亏损的状况。此外，此举也能引导牛奶加工企业积极自建优质奶源基地，形成整个乳业链条的良性发展。继我国对婴儿配方奶粉实施史上最严
新测序技术将加快植物抗病育种
最近，英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室（TSL）和基因组分析中心(TGAC)的一个科学家小组，开发出一种新方法，可加速植物抗病基因的分离。该研究小组也在龙葵（Solanum americanum，马铃薯的一个野生近缘种）中发现了一个全新的枯萎病抗性基因。 植物病原体（如晚疫病）能够快速进化以战胜宿
新测序技术将加快植物抗病育种
最近，英国剑桥大学塞恩斯伯里实验室（TSL）和基因组分析中心(TGAC)的一个科学家小组，开发出一种新方法，可加速植物抗病基因的分离。该研究小组也在龙葵（Solanum americanum，马铃薯的一个野生近缘种）中发现了一个全新的枯萎病抗性基因。 植物病原体（如晚疫病）能够快速进化以战胜宿
一代测序技术，二代测序技术具有哪些优点
相比一代测序技术，二代测序技术优点如下：1、Illumina 原理：桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像优势：Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题，它的主要测序错误来源是碱基的替换。而读长短（200bp-500bp）也让其应用有所局
Life－Tech整合顺利－赛默飞进军下一代测序技术
2015年1月12日-15日，第33届JP摩根健康投融资大会在美国旧金山举行。大会上，各家公司都派出重量级阵营，公布上年度经营业绩，发布最新产品。 赛默飞世尔科技收购Life Tech的大约一年后，公司总裁兼首席执行官 Marc Casper在大会上重申，Life Tech的整合工